Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A194S5C6

Protein Details
Accession A0A194S5C6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-411DGTGEKKKKKARVEEGEFVCBasic
436-458CGLRYAKLVSKTKKEAREKAAQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-402KKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013767  PAS_fold  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF00989  PAS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MQGYAAPGPHQQQQQHQQQYQHQQQQYAPQPPQQQHAAFFPQGSPSTSTGYSASQGMPSYYGQQQQQQQQYQQQPQQHPDQSLGQPRDSTAGPSRTAAQHRRDTSYTAAGNAAQSSSSGAGQGSGAATRHPAAPYQRPEGAVHNVKASSTTSLFTTRKNWSEHLLEELQDFMHVLSPEGNFIFASTSAQELVGYAPEELFTQSIFDFIHPDDVQSFRRDFDLSCRTGDTLTLYYRFKAKDTSGNDDVRYVLFEVTGHPYYEGSGARVAGNTEAPAPQVLARDRPAKAFFAMARPYPSKNQAMLDSFLELKFENERLRQELLAMYKEVEGDGSSGGFPYGQPGMYRADSFDAGARTVIDPATGLVQTQTLIPSTSNTYGALGIGISANGTKGDGTGEKKKKKARVEEGEFVCRDCGTVESPEWRKGPDGPKSLCNACGLRYAKLVSKTKKEAREKAAQAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.66
3 0.68
4 0.68
5 0.71
6 0.77
7 0.78
8 0.77
9 0.7
10 0.64
11 0.62
12 0.65
13 0.65
14 0.63
15 0.56
16 0.53
17 0.58
18 0.57
19 0.59
20 0.57
21 0.5
22 0.44
23 0.47
24 0.46
25 0.39
26 0.37
27 0.32
28 0.3
29 0.29
30 0.29
31 0.27
32 0.23
33 0.25
34 0.25
35 0.25
36 0.22
37 0.22
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.18
47 0.2
48 0.24
49 0.24
50 0.3
51 0.36
52 0.43
53 0.51
54 0.52
55 0.53
56 0.57
57 0.63
58 0.66
59 0.65
60 0.65
61 0.62
62 0.62
63 0.66
64 0.62
65 0.54
66 0.49
67 0.5
68 0.47
69 0.5
70 0.48
71 0.41
72 0.36
73 0.36
74 0.35
75 0.29
76 0.28
77 0.26
78 0.27
79 0.26
80 0.27
81 0.29
82 0.32
83 0.4
84 0.43
85 0.43
86 0.48
87 0.51
88 0.55
89 0.54
90 0.51
91 0.46
92 0.46
93 0.39
94 0.31
95 0.28
96 0.23
97 0.22
98 0.19
99 0.16
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.08
115 0.08
116 0.11
117 0.11
118 0.14
119 0.18
120 0.26
121 0.31
122 0.35
123 0.36
124 0.36
125 0.37
126 0.38
127 0.4
128 0.38
129 0.33
130 0.31
131 0.29
132 0.27
133 0.26
134 0.23
135 0.18
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.25
143 0.28
144 0.32
145 0.34
146 0.35
147 0.32
148 0.34
149 0.33
150 0.33
151 0.28
152 0.24
153 0.21
154 0.2
155 0.15
156 0.12
157 0.11
158 0.06
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.18
208 0.23
209 0.22
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.21
214 0.21
215 0.16
216 0.11
217 0.11
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.17
222 0.17
223 0.15
224 0.16
225 0.17
226 0.22
227 0.25
228 0.32
229 0.34
230 0.35
231 0.35
232 0.32
233 0.31
234 0.23
235 0.2
236 0.13
237 0.08
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.11
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.1
265 0.11
266 0.13
267 0.16
268 0.21
269 0.22
270 0.25
271 0.25
272 0.23
273 0.23
274 0.23
275 0.21
276 0.21
277 0.23
278 0.21
279 0.24
280 0.25
281 0.27
282 0.28
283 0.32
284 0.3
285 0.29
286 0.3
287 0.29
288 0.29
289 0.28
290 0.25
291 0.22
292 0.19
293 0.17
294 0.16
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.15
300 0.17
301 0.2
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.22
306 0.22
307 0.21
308 0.2
309 0.18
310 0.16
311 0.14
312 0.15
313 0.13
314 0.1
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.17
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.1
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.08
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.08
379 0.12
380 0.18
381 0.28
382 0.38
383 0.45
384 0.53
385 0.61
386 0.67
387 0.72
388 0.77
389 0.78
390 0.79
391 0.8
392 0.82
393 0.8
394 0.79
395 0.69
396 0.59
397 0.49
398 0.38
399 0.3
400 0.21
401 0.17
402 0.13
403 0.16
404 0.18
405 0.26
406 0.31
407 0.36
408 0.37
409 0.36
410 0.36
411 0.4
412 0.46
413 0.47
414 0.52
415 0.5
416 0.55
417 0.59
418 0.59
419 0.53
420 0.5
421 0.42
422 0.34
423 0.39
424 0.36
425 0.32
426 0.34
427 0.35
428 0.35
429 0.43
430 0.51
431 0.5
432 0.57
433 0.64
434 0.69
435 0.76
436 0.8
437 0.81
438 0.79
439 0.82
440 0.77