Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A194SCI5

Protein Details
Accession A0A194SCI5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59AAPKQHRDSAPRQQRQPRTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-103AKSFARGGGRGGRGGVARGPGANPR
250-250K
267-305PRKDTRGERAPAARGRGGARGRGEGRGRGGARGGATRGA
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 11, mito 5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVFSANSFALLGDGDDSAPAAAPAKAAPAAAAPAAAPKAAPKQHRDSAPRQQRQPRTGGDREVNASVPAGEDAKEDRAKSFARGGGRGGRGGVARGPGANPRGNGGTYLGGNRPRRDNGGGRPFDRHSQTGRVDSEKAEAAGWGAEDGKKELEAEQLGDADAKAEKPTAAADGTATPVREAPVEEEDNTQTYEEYLAAQAEKKLSLSLPEARKANEGDDASFGQALTKKADAEEEWLYGAPKAAAGKTKKQKEGKTFIEVEFTSAPRKDTRGERAPAARGRGGARGRGEGRGRGGARGGATRGAPSSRGSAPAVPDASAFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.06
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.07
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.07
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.11
26 0.19
27 0.25
28 0.31
29 0.35
30 0.42
31 0.5
32 0.58
33 0.62
34 0.63
35 0.68
36 0.73
37 0.75
38 0.76
39 0.79
40 0.8
41 0.78
42 0.76
43 0.73
44 0.7
45 0.67
46 0.65
47 0.59
48 0.53
49 0.5
50 0.45
51 0.38
52 0.3
53 0.25
54 0.18
55 0.14
56 0.12
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.15
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.21
66 0.21
67 0.23
68 0.26
69 0.24
70 0.25
71 0.26
72 0.28
73 0.32
74 0.32
75 0.3
76 0.25
77 0.23
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.14
86 0.18
87 0.19
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.21
99 0.25
100 0.27
101 0.29
102 0.3
103 0.33
104 0.36
105 0.38
106 0.4
107 0.46
108 0.48
109 0.45
110 0.48
111 0.46
112 0.46
113 0.43
114 0.36
115 0.29
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.33
120 0.31
121 0.29
122 0.27
123 0.26
124 0.2
125 0.18
126 0.13
127 0.11
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.12
195 0.19
196 0.21
197 0.25
198 0.26
199 0.27
200 0.29
201 0.28
202 0.26
203 0.24
204 0.21
205 0.18
206 0.19
207 0.18
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.16
219 0.14
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.16
233 0.2
234 0.3
235 0.39
236 0.48
237 0.55
238 0.62
239 0.69
240 0.71
241 0.76
242 0.72
243 0.7
244 0.65
245 0.57
246 0.55
247 0.47
248 0.4
249 0.34
250 0.29
251 0.26
252 0.23
253 0.25
254 0.22
255 0.24
256 0.26
257 0.31
258 0.4
259 0.44
260 0.47
261 0.51
262 0.54
263 0.6
264 0.58
265 0.56
266 0.48
267 0.42
268 0.41
269 0.42
270 0.39
271 0.37
272 0.35
273 0.37
274 0.37
275 0.42
276 0.43
277 0.39
278 0.4
279 0.43
280 0.41
281 0.35
282 0.35
283 0.31
284 0.29
285 0.29
286 0.26
287 0.21
288 0.21
289 0.21
290 0.22
291 0.21
292 0.2
293 0.19
294 0.22
295 0.21
296 0.24
297 0.25
298 0.26
299 0.27
300 0.32
301 0.31
302 0.27
303 0.26
304 0.24
305 0.24