Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P9GHK8

Protein Details
Accession A0A0P9GHK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28DSGPTFTIKKRSKPRASTSSLRSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-72RGKKTPAGRVKDREGA
328-333AKGKGK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MDDDSGPTFTIKKRSKPRASTSSLRSSTAPDQPAHQPAAVDDDNNDDDGNVAVFRARGKKTPAGRVKDREGAATKARARVSFGGDDDDDADSDASLVKRSTPTSTPRRLLRPTLPASSSSASLASPAPAAASAPIATAEPSSATRSTYSKEYLDELKRGQLSAPRAAVPVDPDGAPGFDDLTKSKFGNDQIEDSTIFPSSDSIARAKSRREEMRKAGISAPARGDDGFVSLEVGFAHKGGDSRLVREEDELGDGDDDMAAFTDSLSRLPLGKRANAAAARALRAEMGDMIDDVEMDVRDDDAEMREWEEAQIKRGGEGRRTTRDESAAKGKGKGPYRPAPIPQSSTLPSLAAVSARLSAAITTLTSSHTLDTGALAHFEQERADLDKQERELRDEVERVERKSRWFDEFKEQVEDWSAFLDEKFPQLEKIEAEYLAIQRERYNIVSQRRYADDADDVALFTGAAIPSLYRPPPPSDAPLPPPVDDALAPDAAESPEDLAPRSHARNARRQARTARYGASSSAYPDALDSAGYASDSSLSAAHQSDLSVALSAQQEALAGLFADVRAADFRDPNLGIRRRFEEWRERFGDEYEMTFAGLSLVQVWEFWARVEMASWNPFEIDELPRTVSDLSAYQWHQNLSSYGHRERSGGEQPEDDDEDDDKPDESAEVVNALVTSVVIPRLEKLARAAYDPYSSRQTVAALRVVDEVSYCVETSSPKFESLIHAFLYRLRLSIAQLQHLILPHLSALSLPSLAFDPSTFVSRQHVLHRALKLVRTCARWRRFMRALRVPALPVEVDGGVLEVGAGATYDELVQRELVARTVLPVLEAAWATGGAEVANKFIEALPKDIPPALRRRLEGEEAGVHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.74
3 0.8
4 0.86
5 0.85
6 0.86
7 0.85
8 0.82
9 0.82
10 0.74
11 0.66
12 0.57
13 0.53
14 0.52
15 0.5
16 0.47
17 0.37
18 0.38
19 0.43
20 0.47
21 0.44
22 0.38
23 0.3
24 0.26
25 0.33
26 0.3
27 0.24
28 0.19
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.22
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.13
42 0.2
43 0.23
44 0.28
45 0.35
46 0.43
47 0.5
48 0.6
49 0.65
50 0.66
51 0.73
52 0.75
53 0.75
54 0.74
55 0.67
56 0.64
57 0.58
58 0.54
59 0.5
60 0.51
61 0.48
62 0.46
63 0.48
64 0.42
65 0.43
66 0.42
67 0.42
68 0.38
69 0.35
70 0.34
71 0.31
72 0.31
73 0.27
74 0.23
75 0.18
76 0.14
77 0.13
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.15
86 0.18
87 0.22
88 0.25
89 0.34
90 0.42
91 0.51
92 0.56
93 0.6
94 0.66
95 0.67
96 0.69
97 0.67
98 0.66
99 0.63
100 0.62
101 0.56
102 0.5
103 0.49
104 0.43
105 0.36
106 0.27
107 0.23
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.12
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.18
133 0.2
134 0.23
135 0.25
136 0.23
137 0.25
138 0.27
139 0.33
140 0.35
141 0.37
142 0.33
143 0.36
144 0.35
145 0.34
146 0.32
147 0.3
148 0.3
149 0.32
150 0.32
151 0.27
152 0.27
153 0.27
154 0.26
155 0.23
156 0.2
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.12
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.19
173 0.21
174 0.28
175 0.29
176 0.29
177 0.29
178 0.3
179 0.3
180 0.27
181 0.24
182 0.17
183 0.15
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.16
191 0.22
192 0.25
193 0.29
194 0.34
195 0.4
196 0.48
197 0.55
198 0.59
199 0.61
200 0.68
201 0.66
202 0.62
203 0.56
204 0.52
205 0.46
206 0.41
207 0.36
208 0.26
209 0.25
210 0.22
211 0.2
212 0.14
213 0.13
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.16
228 0.16
229 0.18
230 0.23
231 0.24
232 0.24
233 0.24
234 0.25
235 0.17
236 0.18
237 0.16
238 0.12
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.1
255 0.11
256 0.17
257 0.18
258 0.2
259 0.22
260 0.22
261 0.27
262 0.26
263 0.26
264 0.25
265 0.23
266 0.22
267 0.2
268 0.19
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.08
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.15
296 0.15
297 0.16
298 0.19
299 0.18
300 0.19
301 0.25
302 0.26
303 0.25
304 0.31
305 0.35
306 0.39
307 0.44
308 0.46
309 0.42
310 0.46
311 0.42
312 0.39
313 0.41
314 0.39
315 0.35
316 0.35
317 0.36
318 0.37
319 0.4
320 0.41
321 0.4
322 0.42
323 0.47
324 0.48
325 0.48
326 0.48
327 0.47
328 0.46
329 0.4
330 0.36
331 0.31
332 0.3
333 0.26
334 0.2
335 0.17
336 0.14
337 0.12
338 0.09
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.11
370 0.12
371 0.13
372 0.15
373 0.17
374 0.19
375 0.24
376 0.23
377 0.23
378 0.23
379 0.23
380 0.24
381 0.23
382 0.22
383 0.26
384 0.28
385 0.27
386 0.31
387 0.31
388 0.31
389 0.36
390 0.38
391 0.34
392 0.35
393 0.36
394 0.4
395 0.43
396 0.41
397 0.39
398 0.36
399 0.3
400 0.29
401 0.26
402 0.17
403 0.13
404 0.12
405 0.07
406 0.07
407 0.09
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.15
430 0.19
431 0.26
432 0.29
433 0.3
434 0.32
435 0.32
436 0.32
437 0.29
438 0.24
439 0.18
440 0.15
441 0.14
442 0.12
443 0.1
444 0.07
445 0.07
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.11
458 0.13
459 0.18
460 0.19
461 0.22
462 0.24
463 0.27
464 0.3
465 0.34
466 0.32
467 0.29
468 0.28
469 0.24
470 0.2
471 0.17
472 0.15
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.1
487 0.13
488 0.15
489 0.18
490 0.22
491 0.27
492 0.36
493 0.44
494 0.52
495 0.52
496 0.55
497 0.59
498 0.6
499 0.62
500 0.54
501 0.48
502 0.4
503 0.38
504 0.33
505 0.27
506 0.2
507 0.16
508 0.15
509 0.12
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.07
514 0.07
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.06
535 0.06
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.07
544 0.04
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.04
552 0.04
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.12
558 0.12
559 0.15
560 0.24
561 0.28
562 0.29
563 0.32
564 0.36
565 0.36
566 0.39
567 0.41
568 0.44
569 0.43
570 0.49
571 0.49
572 0.46
573 0.43
574 0.41
575 0.4
576 0.29
577 0.25
578 0.19
579 0.16
580 0.14
581 0.13
582 0.12
583 0.08
584 0.07
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.11
600 0.14
601 0.14
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.13
609 0.14
610 0.15
611 0.14
612 0.16
613 0.15
614 0.12
615 0.11
616 0.1
617 0.1
618 0.14
619 0.15
620 0.17
621 0.19
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.2
626 0.18
627 0.24
628 0.27
629 0.28
630 0.32
631 0.32
632 0.31
633 0.31
634 0.34
635 0.36
636 0.35
637 0.33
638 0.3
639 0.31
640 0.33
641 0.33
642 0.27
643 0.2
644 0.16
645 0.16
646 0.15
647 0.15
648 0.12
649 0.1
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.08
668 0.13
669 0.13
670 0.14
671 0.16
672 0.21
673 0.22
674 0.24
675 0.25
676 0.22
677 0.27
678 0.28
679 0.28
680 0.28
681 0.27
682 0.26
683 0.24
684 0.25
685 0.23
686 0.25
687 0.26
688 0.2
689 0.21
690 0.22
691 0.21
692 0.18
693 0.15
694 0.13
695 0.1
696 0.11
697 0.1
698 0.08
699 0.09
700 0.11
701 0.14
702 0.19
703 0.19
704 0.18
705 0.19
706 0.2
707 0.26
708 0.28
709 0.28
710 0.24
711 0.23
712 0.22
713 0.25
714 0.29
715 0.22
716 0.18
717 0.17
718 0.17
719 0.19
720 0.26
721 0.25
722 0.24
723 0.25
724 0.25
725 0.26
726 0.25
727 0.24
728 0.16
729 0.14
730 0.11
731 0.09
732 0.09
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.08
737 0.07
738 0.08
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.08
743 0.1
744 0.11
745 0.15
746 0.14
747 0.14
748 0.19
749 0.22
750 0.25
751 0.29
752 0.35
753 0.37
754 0.43
755 0.45
756 0.47
757 0.47
758 0.5
759 0.47
760 0.47
761 0.47
762 0.47
763 0.54
764 0.57
765 0.6
766 0.65
767 0.66
768 0.67
769 0.71
770 0.73
771 0.74
772 0.74
773 0.74
774 0.68
775 0.66
776 0.58
777 0.5
778 0.44
779 0.34
780 0.24
781 0.19
782 0.14
783 0.12
784 0.1
785 0.1
786 0.07
787 0.06
788 0.06
789 0.03
790 0.03
791 0.03
792 0.03
793 0.03
794 0.03
795 0.04
796 0.05
797 0.06
798 0.07
799 0.08
800 0.09
801 0.09
802 0.13
803 0.13
804 0.14
805 0.14
806 0.13
807 0.14
808 0.16
809 0.15
810 0.12
811 0.12
812 0.11
813 0.12
814 0.12
815 0.1
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.08
820 0.08
821 0.05
822 0.08
823 0.08
824 0.09
825 0.1
826 0.09
827 0.1
828 0.11
829 0.18
830 0.17
831 0.21
832 0.22
833 0.23
834 0.26
835 0.28
836 0.31
837 0.3
838 0.38
839 0.43
840 0.45
841 0.46
842 0.5
843 0.53
844 0.54
845 0.5
846 0.45