FuNGI

A0A0M8N469

Protein Details

Accession

A0A0M8N469

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-41	IETPERSASKHDKKAKKEKKHKSEKKRAREDEDAAA	Basic
70-96	MNGDSSVKAKKKKSKKVKEEVEMKEEE	Hydrophilic
104-132	QDVEEPKSEKKKSKKKKKRDDEQSQGNDG	Basic
139-164	EEQAPESTKTKKKKSKKHSEHAELLQ	Hydrophilic
436-459	LAEQRKGKKGGRRVLHRRRAPEFA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-35	SKHDKKAKKEKKHKSEKKRARE
46-51	ERRPKK
77-87	KAKKKKSKKVK
110-122	KSEKKKSKKKKKR
147-156	KTKKKKSKKH
440-455	RKGKKGGRRVLHRRRA

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSPAAIETPERSASKHDKKAKKEKKHKSEKKRAREDEDAAAEAEAERRPKKSKSEVDEEESRDVHDLEPMNGDSSVKAKKKKSKKVKEEVEMKEEETAAPAEEQDVEEPKSEKKKSKKKKKRDDEQSQGNDGGAVEAEEEQAPESTKTKKKKSKKHSEHAELLQDTPSKPPRSSAPRARDANADADAMELDEEPAPAAASDAYQPPDMPAKPQFPFFTQTVSLYEPIYPQGWSQPVTNCQYQHLRHLKNRYVPSLHGVLLDYRNVALGDAPGRAGAARTDEDATVLKSVNEYAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPAWKWVSNEDPEAAGMEETASVFTADDHGVTRQIHSTGFWVDGAGDKVKGKIRFRIRNFDVGISGDTSYLSLEGTMLDRDAEKKLVKEEALLAEQRKGKKGGRRVLHRRRAPEFAMTRFADDEGEGEGEGAEGQTTTTSTAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.56
3	0.62
4	0.66
5	0.76
6	0.86
7	0.89
8	0.9
9	0.91
10	0.92
11	0.93
12	0.95
13	0.96
14	0.96
15	0.96
16	0.96
17	0.96
18	0.96
19	0.93
20	0.9
21	0.88
22	0.81
23	0.78
24	0.71
25	0.61
26	0.5
27	0.41
28	0.33
29	0.24
30	0.22
31	0.16
32	0.19
33	0.2
34	0.24
35	0.3
36	0.35
37	0.44
38	0.51
39	0.58
40	0.6
41	0.68
42	0.69
43	0.71
44	0.73
45	0.68
46	0.61
47	0.51
48	0.44
49	0.36
50	0.3
51	0.23
52	0.21
53	0.18
54	0.16
55	0.19
56	0.19
57	0.19
58	0.18
59	0.18
60	0.14
61	0.17
62	0.24
63	0.27
64	0.34
65	0.41
66	0.51
67	0.62
68	0.72
69	0.8
70	0.82
71	0.87
72	0.91
73	0.92
74	0.92
75	0.91
76	0.86
77	0.81
78	0.71
79	0.61
80	0.52
81	0.42
82	0.32
83	0.23
84	0.18
85	0.12
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.12
93	0.12
94	0.14
95	0.16
96	0.2
97	0.28
98	0.33
99	0.4
100	0.48
101	0.58
102	0.67
103	0.78
104	0.84
105	0.86
106	0.92
107	0.95
108	0.95
109	0.96
110	0.95
111	0.94
112	0.93
113	0.88
114	0.8
115	0.69
116	0.57
117	0.46
118	0.35
119	0.25
120	0.14
121	0.08
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.05
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.08
130	0.08
131	0.1
132	0.18
133	0.25
134	0.33
135	0.43
136	0.53
137	0.62
138	0.72
139	0.81
140	0.85
141	0.88
142	0.91
143	0.91
144	0.89
145	0.87
146	0.8
147	0.75
148	0.64
149	0.54
150	0.46
151	0.37
152	0.29
153	0.27
154	0.3
155	0.26
156	0.25
157	0.27
158	0.32
159	0.39
160	0.47
161	0.52
162	0.52
163	0.59
164	0.61
165	0.61
166	0.56
167	0.49
168	0.43
169	0.35
170	0.27
171	0.18
172	0.15
173	0.13
174	0.1
175	0.08
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.03
186	0.04
187	0.05
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.14
194	0.13
195	0.15
196	0.18
197	0.21
198	0.22
199	0.25
200	0.26
201	0.23
202	0.27
203	0.24
204	0.23
205	0.19
206	0.19
207	0.18
208	0.18
209	0.17
210	0.14
211	0.14
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.09
216	0.08
217	0.1
218	0.11
219	0.12
220	0.13
221	0.14
222	0.18
223	0.22
224	0.24
225	0.22
226	0.23
227	0.28
228	0.27
229	0.34
230	0.39
231	0.4
232	0.43
233	0.5
234	0.52
235	0.53
236	0.55
237	0.49
238	0.43
239	0.39
240	0.37
241	0.31
242	0.27
243	0.2
244	0.17
245	0.15
246	0.14
247	0.13
248	0.1
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.07
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.14
323	0.15
324	0.16
325	0.19
326	0.24
327	0.24
328	0.26
329	0.26
330	0.23
331	0.24
332	0.31
333	0.33
334	0.33
335	0.35
336	0.39
337	0.44
338	0.44
339	0.43
340	0.35
341	0.29
342	0.25
343	0.23
344	0.17
345	0.11
346	0.08
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.09
360	0.12
361	0.12
362	0.14
363	0.14
364	0.15
365	0.15
366	0.14
367	0.16
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.11
372	0.1
373	0.12
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.16
379	0.23
380	0.29
381	0.3
382	0.37
383	0.46
384	0.55
385	0.61
386	0.68
387	0.66
388	0.68
389	0.66
390	0.59
391	0.5
392	0.42
393	0.37
394	0.28
395	0.24
396	0.15
397	0.13
398	0.11
399	0.1
400	0.08
401	0.07
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.09
410	0.11
411	0.13
412	0.17
413	0.18
414	0.2
415	0.23
416	0.27
417	0.26
418	0.26
419	0.28
420	0.28
421	0.3
422	0.32
423	0.3
424	0.32
425	0.37
426	0.38
427	0.39
428	0.4
429	0.43
430	0.48
431	0.56
432	0.6
433	0.64
434	0.72
435	0.78
436	0.84
437	0.88
438	0.87
439	0.86
440	0.82
441	0.79
442	0.71
443	0.7
444	0.65
445	0.59
446	0.59
447	0.51
448	0.47
449	0.41
450	0.38
451	0.29
452	0.23
453	0.19
454	0.13
455	0.13
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.07
462	0.05
463	0.04
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.07

A0A0M8N469

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer