Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M9VVT4

Protein Details
Accession A0A0M9VVT4    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-55QERERERERDRDRDRHRERDRDRDRDRDRBasic
65-84RDRGRDRRGYRSRSRERRGABasic
92-124SPDPRPRDRDPERPRPRDRRRDDDRRPQRHRSGBasic
210-231AGGIRKEKKTEYRQYMNRQGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-123RDRGPQERERERERDRDRDRHRERDRDRDRDRDRDRDYDRERARDRGRDRRGYRSRSRERRGAPGPNRSRSPDPRPRDRDPERPRPRDRRRDDDRRPQRHRS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAESRRHRRPDSRQMWDDSDRRDRGPQERERERERDRDRDRHRERDRDRDRDRDRDRDYDRERARDRGRDRRGYRSRSRERRGAPGPNRSRSPDPRPRDRDPERPRPRDRRRDDDRRPQRHRSGSPDGPTALPTRTRPDPRDANKDRDRAQDHDRMDQDGPPPRSGADDDNDDDNDAAADDDDDMAAMQAMLGFGGFGSTKGTKVAGNNAGGIRKEKKTEYRQYMNRQGGFNRPLSPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.74
4 0.69
5 0.65
6 0.64
7 0.57
8 0.53
9 0.53
10 0.53
11 0.54
12 0.59
13 0.6
14 0.61
15 0.67
16 0.72
17 0.73
18 0.75
19 0.72
20 0.73
21 0.71
22 0.72
23 0.71
24 0.75
25 0.77
26 0.79
27 0.82
28 0.82
29 0.84
30 0.84
31 0.82
32 0.82
33 0.83
34 0.82
35 0.8
36 0.8
37 0.78
38 0.78
39 0.78
40 0.76
41 0.72
42 0.71
43 0.69
44 0.69
45 0.67
46 0.66
47 0.64
48 0.64
49 0.61
50 0.61
51 0.62
52 0.61
53 0.64
54 0.64
55 0.68
56 0.7
57 0.71
58 0.73
59 0.76
60 0.75
61 0.77
62 0.77
63 0.79
64 0.8
65 0.82
66 0.79
67 0.74
68 0.74
69 0.72
70 0.71
71 0.67
72 0.67
73 0.68
74 0.65
75 0.65
76 0.6
77 0.61
78 0.58
79 0.61
80 0.6
81 0.59
82 0.64
83 0.69
84 0.7
85 0.72
86 0.71
87 0.72
88 0.71
89 0.75
90 0.75
91 0.77
92 0.8
93 0.81
94 0.86
95 0.85
96 0.84
97 0.82
98 0.82
99 0.84
100 0.84
101 0.84
102 0.84
103 0.84
104 0.84
105 0.82
106 0.8
107 0.77
108 0.71
109 0.68
110 0.65
111 0.6
112 0.55
113 0.49
114 0.42
115 0.35
116 0.32
117 0.26
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.18
122 0.24
123 0.29
124 0.3
125 0.36
126 0.44
127 0.48
128 0.57
129 0.57
130 0.6
131 0.62
132 0.64
133 0.61
134 0.59
135 0.57
136 0.51
137 0.52
138 0.5
139 0.45
140 0.46
141 0.43
142 0.38
143 0.35
144 0.33
145 0.32
146 0.33
147 0.34
148 0.28
149 0.27
150 0.24
151 0.25
152 0.25
153 0.23
154 0.17
155 0.19
156 0.19
157 0.21
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.15
162 0.12
163 0.08
164 0.07
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.02
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.23
193 0.24
194 0.25
195 0.28
196 0.29
197 0.32
198 0.31
199 0.34
200 0.32
201 0.31
202 0.34
203 0.38
204 0.45
205 0.52
206 0.62
207 0.66
208 0.71
209 0.77
210 0.82
211 0.86
212 0.85
213 0.79
214 0.72
215 0.66
216 0.65
217 0.6
218 0.54
219 0.47