Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0N0RTP5

Protein Details
Accession A0A0N0RTP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
487-510EREWEEARLRRRQRRKDGTADAGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
496-501RRRQRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9.833, mito 8.5, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQPQQQPQPQVPPRTFSPPQLSPSPATSQSGFALPPNKRPRTDGPVSQPGSPYAASPYTMSPVLAATPPTSTASPTYPQAQTPPVAAGYALPPHYANGHVAQGLALPSASPVMPSPALPPPQPPQTMVPIPVPPSPQSSSTMPQYTNATMQPMPHPAPPVAAQGPVIMGPPQKPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMADLYSNALDSIPDARTGFAQHPPGGKASFYGAGVANQPGQPTDQTQAQFAAQAAEQAWADSSMRLAVQRTREISDPFLLVALLHRRAEKVAREHNLGLNLELKGNQATMGKMRLPEQVPQPKVTVKMQPGPDSTMVETNGSFIPHDAFLADQLALISIATKQRLRELLEDANVLAKTRQKTSHGDVPEEWLPAAAPMNAEVLEPMNTTAVDGEGVNGTEASETNPLKRERSSILSHHGLTVLTIYTGAADAASTKKQPPAKLPKISSTMTYTMRELARQEREWEEARLRRRQRRKDGTADAGTSGSRAGSAAPGTPGSVAPESEKSMTKKEMKKNQAMKAAEASSHANQNITSSMFAGLGGKGSLFGKKKSGKTYDWMNVGRGGSGASTPSRSTPGLGKGPSGSHGTPASTNLAMTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWVMVLERDGREAKALQRAYLDLDTSGPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.65
3 0.62
4 0.61
5 0.58
6 0.55
7 0.56
8 0.52
9 0.55
10 0.55
11 0.54
12 0.48
13 0.49
14 0.47
15 0.41
16 0.39
17 0.35
18 0.32
19 0.29
20 0.28
21 0.24
22 0.23
23 0.28
24 0.28
25 0.37
26 0.45
27 0.5
28 0.5
29 0.56
30 0.6
31 0.61
32 0.66
33 0.65
34 0.63
35 0.67
36 0.67
37 0.63
38 0.57
39 0.49
40 0.44
41 0.35
42 0.27
43 0.21
44 0.21
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.17
63 0.19
64 0.21
65 0.23
66 0.27
67 0.26
68 0.27
69 0.3
70 0.3
71 0.28
72 0.26
73 0.25
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.14
78 0.13
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.15
106 0.2
107 0.23
108 0.23
109 0.27
110 0.29
111 0.36
112 0.37
113 0.36
114 0.33
115 0.37
116 0.39
117 0.37
118 0.35
119 0.31
120 0.33
121 0.33
122 0.32
123 0.26
124 0.29
125 0.29
126 0.27
127 0.29
128 0.29
129 0.3
130 0.33
131 0.36
132 0.31
133 0.31
134 0.32
135 0.3
136 0.29
137 0.26
138 0.24
139 0.2
140 0.22
141 0.23
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.26
146 0.23
147 0.24
148 0.24
149 0.26
150 0.22
151 0.2
152 0.18
153 0.16
154 0.16
155 0.13
156 0.12
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.15
161 0.17
162 0.19
163 0.2
164 0.25
165 0.34
166 0.38
167 0.42
168 0.45
169 0.49
170 0.49
171 0.49
172 0.46
173 0.41
174 0.38
175 0.33
176 0.26
177 0.19
178 0.17
179 0.15
180 0.14
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.12
211 0.14
212 0.16
213 0.18
214 0.2
215 0.22
216 0.22
217 0.24
218 0.22
219 0.2
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.15
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.08
260 0.1
261 0.14
262 0.17
263 0.19
264 0.2
265 0.23
266 0.23
267 0.24
268 0.22
269 0.18
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.18
282 0.2
283 0.23
284 0.29
285 0.31
286 0.33
287 0.34
288 0.35
289 0.35
290 0.3
291 0.24
292 0.19
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.17
308 0.17
309 0.2
310 0.27
311 0.33
312 0.34
313 0.34
314 0.34
315 0.31
316 0.32
317 0.31
318 0.28
319 0.23
320 0.28
321 0.28
322 0.3
323 0.29
324 0.29
325 0.28
326 0.23
327 0.21
328 0.17
329 0.15
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.13
357 0.16
358 0.18
359 0.19
360 0.22
361 0.23
362 0.23
363 0.23
364 0.19
365 0.19
366 0.16
367 0.14
368 0.11
369 0.13
370 0.13
371 0.17
372 0.19
373 0.21
374 0.26
375 0.31
376 0.37
377 0.35
378 0.36
379 0.33
380 0.34
381 0.32
382 0.28
383 0.22
384 0.15
385 0.13
386 0.11
387 0.11
388 0.07
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.05
414 0.06
415 0.1
416 0.11
417 0.13
418 0.19
419 0.2
420 0.22
421 0.23
422 0.25
423 0.23
424 0.29
425 0.31
426 0.29
427 0.34
428 0.35
429 0.35
430 0.32
431 0.29
432 0.23
433 0.19
434 0.16
435 0.1
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.06
446 0.08
447 0.1
448 0.11
449 0.17
450 0.21
451 0.24
452 0.33
453 0.42
454 0.5
455 0.57
456 0.58
457 0.59
458 0.6
459 0.58
460 0.51
461 0.44
462 0.4
463 0.34
464 0.33
465 0.28
466 0.27
467 0.27
468 0.26
469 0.23
470 0.26
471 0.29
472 0.29
473 0.32
474 0.3
475 0.34
476 0.35
477 0.36
478 0.36
479 0.36
480 0.41
481 0.47
482 0.54
483 0.6
484 0.68
485 0.75
486 0.79
487 0.84
488 0.85
489 0.85
490 0.84
491 0.82
492 0.75
493 0.66
494 0.56
495 0.45
496 0.37
497 0.27
498 0.2
499 0.11
500 0.07
501 0.06
502 0.05
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.13
515 0.15
516 0.17
517 0.18
518 0.23
519 0.23
520 0.27
521 0.33
522 0.4
523 0.46
524 0.54
525 0.62
526 0.66
527 0.73
528 0.78
529 0.78
530 0.78
531 0.71
532 0.63
533 0.59
534 0.51
535 0.41
536 0.35
537 0.32
538 0.25
539 0.28
540 0.26
541 0.21
542 0.19
543 0.2
544 0.2
545 0.16
546 0.14
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.15
559 0.17
560 0.18
561 0.27
562 0.34
563 0.4
564 0.48
565 0.54
566 0.51
567 0.54
568 0.62
569 0.6
570 0.6
571 0.56
572 0.49
573 0.47
574 0.44
575 0.38
576 0.29
577 0.22
578 0.14
579 0.13
580 0.13
581 0.11
582 0.13
583 0.14
584 0.15
585 0.19
586 0.19
587 0.2
588 0.23
589 0.29
590 0.33
591 0.33
592 0.34
593 0.32
594 0.33
595 0.34
596 0.34
597 0.27
598 0.24
599 0.25
600 0.25
601 0.23
602 0.24
603 0.25
604 0.2
605 0.19
606 0.16
607 0.16
608 0.15
609 0.16
610 0.2
611 0.22
612 0.26
613 0.27
614 0.28
615 0.28
616 0.34
617 0.38
618 0.39
619 0.41
620 0.46
621 0.51
622 0.58
623 0.63
624 0.65
625 0.69
626 0.68
627 0.7
628 0.68
629 0.66
630 0.67
631 0.68
632 0.63
633 0.56
634 0.5
635 0.41
636 0.37
637 0.34
638 0.27
639 0.27
640 0.23
641 0.25
642 0.26
643 0.25
644 0.26
645 0.28
646 0.31
647 0.33
648 0.33
649 0.31
650 0.32
651 0.32
652 0.34
653 0.33
654 0.29
655 0.2