Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M9VTN2

Protein Details
Accession A0A0M9VTN2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-146TAVTEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
305-329KLAGTVSPDKKRRRASKAADLEKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-136KKERKKRTH
285-295PKKSAAGRKRK
312-341PDKKRRRASKAADLEKEEPKKSGRKKTKSS
Subcellular Location(s) mito 15, mito_nucl 11.333, cyto_mito 10.833, nucl 6.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRPPKKSADDKAKVMPVPAVVPAPTMVPASVGVGGIHHPQAVSVAPGVPTRVVDNESFLRVRDSAVGRLTTIIELLRSFTNDYIRQTNLLLGEHTAEGSQELMSAFDSAAAQLIMPMVEMTAVTEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQHARSIIANDLGSEAPKGAVQEEGQRRWAHMGPHEKQGWNNAYQYNLRLYNARVHSYKHGNPLAKNMSDEEALKYAEDFSIPMPELKEPAVQAEAPTNDQDAIAQQLQQAVAAPSDEEEEEEDEEVETPVKTPKKSAAGRKRKTATPVTEDSKLAGTVSPDKKRRRASKAADLEKEEPKKSGRKKTKSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.56
3 0.48
4 0.38
5 0.32
6 0.29
7 0.23
8 0.16
9 0.16
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.08
21 0.08
22 0.1
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.14
42 0.18
43 0.19
44 0.22
45 0.22
46 0.21
47 0.21
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.22
56 0.23
57 0.23
58 0.17
59 0.15
60 0.11
61 0.09
62 0.08
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.13
68 0.18
69 0.2
70 0.23
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.24
75 0.24
76 0.2
77 0.18
78 0.15
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.1
114 0.18
115 0.27
116 0.35
117 0.43
118 0.52
119 0.61
120 0.69
121 0.78
122 0.82
123 0.84
124 0.86
125 0.89
126 0.9
127 0.85
128 0.76
129 0.67
130 0.62
131 0.54
132 0.49
133 0.4
134 0.31
135 0.3
136 0.31
137 0.31
138 0.27
139 0.25
140 0.22
141 0.19
142 0.18
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.14
161 0.18
162 0.19
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.25
167 0.26
168 0.21
169 0.23
170 0.31
171 0.29
172 0.36
173 0.38
174 0.36
175 0.34
176 0.39
177 0.36
178 0.28
179 0.28
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.19
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.22
190 0.24
191 0.26
192 0.23
193 0.24
194 0.3
195 0.35
196 0.37
197 0.37
198 0.4
199 0.4
200 0.4
201 0.45
202 0.44
203 0.38
204 0.35
205 0.29
206 0.25
207 0.23
208 0.23
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.09
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.14
269 0.19
270 0.19
271 0.21
272 0.28
273 0.36
274 0.44
275 0.54
276 0.59
277 0.66
278 0.72
279 0.8
280 0.79
281 0.74
282 0.74
283 0.72
284 0.68
285 0.65
286 0.66
287 0.61
288 0.59
289 0.54
290 0.48
291 0.4
292 0.32
293 0.25
294 0.19
295 0.17
296 0.23
297 0.31
298 0.39
299 0.46
300 0.54
301 0.63
302 0.72
303 0.79
304 0.78
305 0.81
306 0.81
307 0.83
308 0.86
309 0.86
310 0.82
311 0.79
312 0.75
313 0.73
314 0.71
315 0.61
316 0.54
317 0.51
318 0.54
319 0.57
320 0.63
321 0.65