Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M9VTX5

Protein Details
Accession A0A0M9VTX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-245VSAVGGKKQRERERKVKQTIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-111PRDGPRGGHGARVRGGRGSRHPRDRD
235-235R
254-286RSRGGAPRGGRGGPRGGRGGERGRGGPFRGPRG
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 13.5, nucl 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLYALLGNDSDGEEKPVVPVKTVDKAQPRTTKRNVEPQAPQAPVRTGGNRRGGPGGNEGAFRDRNAGRDRNQGRSTDEAPRDGPRGGHGARVRGGRGSRHPRDRDDRHPNKSGVTGSEKQAAQSWGAAEGNAELKDEQAGEAIAETEQKETQTEEAAAEEPAEPEDKSVSYADYLAQQAEKKLNFETELNVRAANEGSKLDKKWASAKALEKTDDEYVSAVGGKKQRERERKVKQTIDFDPRFVEADRSRGGAPRGGRGGPRGGRGGERGRGGPFRGPRGGSSAPINTSDESAFPSLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.15
4 0.15
5 0.17
6 0.14
7 0.13
8 0.16
9 0.22
10 0.21
11 0.21
12 0.24
13 0.25
14 0.31
15 0.34
16 0.38
17 0.41
18 0.47
19 0.55
20 0.61
21 0.64
22 0.66
23 0.72
24 0.75
25 0.72
26 0.76
27 0.73
28 0.71
29 0.69
30 0.68
31 0.67
32 0.59
33 0.55
34 0.47
35 0.44
36 0.39
37 0.36
38 0.35
39 0.32
40 0.37
41 0.45
42 0.43
43 0.43
44 0.45
45 0.43
46 0.38
47 0.37
48 0.34
49 0.26
50 0.26
51 0.25
52 0.25
53 0.24
54 0.22
55 0.23
56 0.2
57 0.25
58 0.3
59 0.35
60 0.34
61 0.43
62 0.47
63 0.5
64 0.52
65 0.48
66 0.45
67 0.45
68 0.45
69 0.44
70 0.42
71 0.35
72 0.34
73 0.35
74 0.34
75 0.29
76 0.26
77 0.19
78 0.23
79 0.21
80 0.26
81 0.25
82 0.26
83 0.29
84 0.3
85 0.29
86 0.27
87 0.28
88 0.26
89 0.34
90 0.4
91 0.45
92 0.53
93 0.56
94 0.59
95 0.67
96 0.69
97 0.7
98 0.71
99 0.72
100 0.69
101 0.71
102 0.65
103 0.57
104 0.53
105 0.43
106 0.35
107 0.34
108 0.3
109 0.25
110 0.3
111 0.29
112 0.26
113 0.28
114 0.25
115 0.18
116 0.17
117 0.15
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.19
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.13
188 0.1
189 0.09
190 0.12
191 0.16
192 0.16
193 0.2
194 0.21
195 0.23
196 0.28
197 0.32
198 0.33
199 0.35
200 0.41
201 0.42
202 0.44
203 0.44
204 0.39
205 0.36
206 0.35
207 0.29
208 0.23
209 0.17
210 0.14
211 0.12
212 0.13
213 0.11
214 0.12
215 0.16
216 0.2
217 0.25
218 0.35
219 0.44
220 0.53
221 0.61
222 0.68
223 0.75
224 0.81
225 0.85
226 0.84
227 0.8
228 0.77
229 0.77
230 0.76
231 0.67
232 0.57
233 0.49
234 0.42
235 0.38
236 0.31
237 0.3
238 0.22
239 0.25
240 0.25
241 0.26
242 0.25
243 0.27
244 0.28
245 0.26
246 0.26
247 0.28
248 0.3
249 0.3
250 0.31
251 0.31
252 0.38
253 0.36
254 0.38
255 0.35
256 0.33
257 0.34
258 0.38
259 0.41
260 0.37
261 0.37
262 0.35
263 0.36
264 0.38
265 0.39
266 0.4
267 0.4
268 0.41
269 0.44
270 0.43
271 0.4
272 0.44
273 0.43
274 0.38
275 0.38
276 0.35
277 0.32
278 0.33
279 0.34
280 0.27
281 0.28
282 0.25
283 0.21
284 0.2
285 0.2