Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9W2R0

Protein Details
Accession A0A0C9W2R0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42DEKPASELARPKKKRKLPTLSPSLSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-32RPKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MKRGSVGLVAYSSSEEDEKPASELARPKKKRKLPTLSPSLSIPVPVDNPALHQGRVRAVPHVEGQYATYIYVPLVLHPKEALYTLVEDVLGICKGSVPAQALHSIGRQENQNTGSGIGACWELHISLSRPLFLRAHQREDFKRAIKKVALSQAPFDASFATFSELTNDEKTRTFLALEVGAGHQEFRRCLDFLTPTLRSLRQKEFYTDPKFHASIAWALLEQKVTPSDLSQLQPPVSTAGALDEDALPSATSPANDETPPPSSTERFPRIPHFPPDLVPSLNQTYEDKLSQAKTGGFVVDRISVKIGRDVFTWPLKGTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.13
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.19
10 0.28
11 0.36
12 0.45
13 0.53
14 0.61
15 0.69
16 0.77
17 0.83
18 0.86
19 0.86
20 0.86
21 0.88
22 0.89
23 0.82
24 0.75
25 0.66
26 0.58
27 0.47
28 0.37
29 0.28
30 0.19
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.14
35 0.17
36 0.22
37 0.23
38 0.21
39 0.22
40 0.23
41 0.25
42 0.3
43 0.29
44 0.26
45 0.25
46 0.27
47 0.29
48 0.29
49 0.26
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.15
55 0.11
56 0.09
57 0.08
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.16
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.09
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.08
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.16
118 0.16
119 0.17
120 0.27
121 0.26
122 0.33
123 0.35
124 0.4
125 0.4
126 0.45
127 0.47
128 0.42
129 0.44
130 0.39
131 0.39
132 0.36
133 0.35
134 0.35
135 0.37
136 0.35
137 0.3
138 0.29
139 0.26
140 0.25
141 0.23
142 0.18
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.22
181 0.21
182 0.2
183 0.23
184 0.26
185 0.27
186 0.3
187 0.35
188 0.35
189 0.36
190 0.39
191 0.42
192 0.47
193 0.5
194 0.47
195 0.43
196 0.42
197 0.41
198 0.37
199 0.32
200 0.24
201 0.19
202 0.18
203 0.15
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.16
217 0.18
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.17
223 0.14
224 0.13
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.06
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.12
241 0.14
242 0.14
243 0.16
244 0.17
245 0.2
246 0.21
247 0.21
248 0.22
249 0.23
250 0.28
251 0.36
252 0.39
253 0.4
254 0.43
255 0.47
256 0.51
257 0.54
258 0.55
259 0.53
260 0.48
261 0.46
262 0.47
263 0.44
264 0.38
265 0.33
266 0.32
267 0.28
268 0.27
269 0.27
270 0.23
271 0.24
272 0.26
273 0.26
274 0.22
275 0.23
276 0.24
277 0.24
278 0.26
279 0.23
280 0.21
281 0.21
282 0.22
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.21
287 0.21
288 0.21
289 0.23
290 0.22
291 0.23
292 0.29
293 0.29
294 0.24
295 0.25
296 0.27
297 0.3
298 0.33
299 0.34