Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9VNT4

Protein Details
Accession A0A0C9VNT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-141FYRGIQQSKKSPRKKRSTRMNLSMSTHydrophilic
253-275MITFRNEKKKKMEGKTRLFRILTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-131KKSPRKKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 13.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026960  RVT-Znf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13966  zf-RVT  
Amino Acid Sequences MATRATSKHHILNIRTRSEQLVKDLTTELRRLDKIGWLDYEDADIMKSLVAELRQRSAPTYVSKWNSNTPRDDRTQSEALAKTGTTKNHTDKLDMSIKEEFNTYGLILEHGTQRLFYRGIQQSKKSPRKKRSTRMNLSMSTYAIHEINGATPTDSQIWKSIRDRDIPRAIRNFLWKALHNGYKIGEYWEQMENNTQRGKCILCRETETLEHILLDCESSTTSKTVWKLTEDLWRRRDPSWPSIKFGTILGSQMITFRNEKKKKMEGKTRLFRILTTEAAHLIWKIRCERIFKLGGNSDLFHTETEIHNRWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.54
4 0.53
5 0.52
6 0.49
7 0.45
8 0.43
9 0.37
10 0.37
11 0.38
12 0.37
13 0.34
14 0.33
15 0.31
16 0.3
17 0.31
18 0.3
19 0.29
20 0.31
21 0.31
22 0.32
23 0.3
24 0.27
25 0.27
26 0.25
27 0.25
28 0.19
29 0.16
30 0.12
31 0.11
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.05
36 0.07
37 0.09
38 0.14
39 0.16
40 0.19
41 0.22
42 0.22
43 0.24
44 0.25
45 0.26
46 0.27
47 0.29
48 0.34
49 0.36
50 0.4
51 0.41
52 0.47
53 0.51
54 0.51
55 0.54
56 0.52
57 0.53
58 0.54
59 0.55
60 0.5
61 0.49
62 0.47
63 0.4
64 0.41
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.24
69 0.23
70 0.24
71 0.25
72 0.23
73 0.27
74 0.31
75 0.37
76 0.39
77 0.36
78 0.34
79 0.37
80 0.41
81 0.35
82 0.34
83 0.32
84 0.31
85 0.29
86 0.29
87 0.22
88 0.15
89 0.15
90 0.12
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.18
105 0.24
106 0.32
107 0.36
108 0.39
109 0.46
110 0.56
111 0.66
112 0.66
113 0.7
114 0.72
115 0.79
116 0.86
117 0.87
118 0.88
119 0.89
120 0.88
121 0.87
122 0.82
123 0.73
124 0.66
125 0.57
126 0.46
127 0.35
128 0.26
129 0.18
130 0.13
131 0.1
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.13
144 0.14
145 0.17
146 0.2
147 0.26
148 0.27
149 0.34
150 0.36
151 0.39
152 0.47
153 0.47
154 0.48
155 0.45
156 0.44
157 0.4
158 0.42
159 0.36
160 0.3
161 0.29
162 0.26
163 0.27
164 0.3
165 0.32
166 0.27
167 0.27
168 0.24
169 0.22
170 0.22
171 0.2
172 0.16
173 0.13
174 0.15
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.21
179 0.19
180 0.22
181 0.26
182 0.23
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.21
187 0.29
188 0.28
189 0.26
190 0.3
191 0.32
192 0.34
193 0.33
194 0.32
195 0.26
196 0.23
197 0.21
198 0.16
199 0.14
200 0.11
201 0.1
202 0.07
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.12
210 0.14
211 0.18
212 0.19
213 0.21
214 0.22
215 0.24
216 0.33
217 0.38
218 0.44
219 0.46
220 0.49
221 0.5
222 0.48
223 0.53
224 0.5
225 0.52
226 0.54
227 0.51
228 0.51
229 0.5
230 0.5
231 0.43
232 0.37
233 0.31
234 0.21
235 0.19
236 0.15
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.13
242 0.16
243 0.23
244 0.33
245 0.38
246 0.44
247 0.5
248 0.58
249 0.66
250 0.73
251 0.76
252 0.76
253 0.81
254 0.86
255 0.84
256 0.82
257 0.73
258 0.63
259 0.58
260 0.52
261 0.44
262 0.36
263 0.3
264 0.24
265 0.24
266 0.24
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.22
271 0.25
272 0.31
273 0.35
274 0.4
275 0.43
276 0.46
277 0.5
278 0.48
279 0.52
280 0.5
281 0.5
282 0.47
283 0.44
284 0.38
285 0.34
286 0.32
287 0.24
288 0.2
289 0.18
290 0.2
291 0.27