Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BMN1

Protein Details
Accession Q6BMN1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-64LESDLKKEIKKLQRSRDQLKTWHydrophilic
583-603DYEKTWLTRRKENYKFSQDFRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-301KDGPKEEPKPETKTETKPEAKTESKRETK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG dha:DEHA2F04004g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MSTRKLQQEFDKTNKKIAEGLTVFDDIYDKLMTTEISSQKEKLESDLKKEIKKLQRSRDQLKTWISDTSIKLDKSLIQDNRTKIEHAMDQFKDLEKSSKIKQFSNEGLELQSQKTKYNKFTDPEDAKKQEACNYIGDIIDQLNQQNESLESEIHSLATQLKKTKSANSYSVQSSIDDCKYNVERNNNHLSKLEMILRNIENENLDPERVDDIKDDLEYYVETNQEDDYVEYDDFYDQLEMSEENDILGSGQDANEDNEENKAEVKEGPKEEPKDGPKEEPKPETKTETKPEAKTESKRETKPEIKSEAKSEPKSSNESTSAASTLARKGKTTVVPAANPPPLNTAQSYSNIIKASMSSPAAAKVLPPGLNQAKSSTSSPQRTPQKLHQADDSKKRVVSQTQHIPSTQPETRSETQSPILNVNKPIFDTVNRLSTLPQSRLHNPLPFQSIVSLLESSLLNCPDSFDAEKPRQYHPTSIHPSSVDYPQEPMYELNSSHIMKKFDNDTLFFCFYYSEGIDNLAKWNAAQELSKRGWIFNTDVKQWFLKDNKNGGKNRSMSIIQKEEDEQNKQDDSANNEENYKYFDYEKTWLTRRKENYKFSQDFRESF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.58
3 0.52
4 0.46
5 0.46
6 0.36
7 0.37
8 0.32
9 0.31
10 0.29
11 0.24
12 0.24
13 0.14
14 0.15
15 0.13
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.19
22 0.23
23 0.28
24 0.3
25 0.31
26 0.34
27 0.37
28 0.35
29 0.33
30 0.38
31 0.36
32 0.41
33 0.5
34 0.53
35 0.54
36 0.58
37 0.62
38 0.62
39 0.69
40 0.71
41 0.72
42 0.76
43 0.81
44 0.84
45 0.84
46 0.8
47 0.77
48 0.74
49 0.68
50 0.59
51 0.53
52 0.47
53 0.43
54 0.39
55 0.38
56 0.38
57 0.33
58 0.32
59 0.31
60 0.32
61 0.31
62 0.39
63 0.38
64 0.37
65 0.43
66 0.46
67 0.5
68 0.47
69 0.44
70 0.36
71 0.35
72 0.35
73 0.34
74 0.39
75 0.34
76 0.35
77 0.36
78 0.36
79 0.34
80 0.29
81 0.29
82 0.25
83 0.29
84 0.33
85 0.38
86 0.4
87 0.42
88 0.45
89 0.47
90 0.49
91 0.51
92 0.45
93 0.39
94 0.38
95 0.37
96 0.35
97 0.29
98 0.28
99 0.23
100 0.26
101 0.32
102 0.37
103 0.41
104 0.46
105 0.51
106 0.49
107 0.54
108 0.59
109 0.6
110 0.61
111 0.63
112 0.58
113 0.54
114 0.54
115 0.5
116 0.47
117 0.44
118 0.38
119 0.31
120 0.3
121 0.28
122 0.25
123 0.23
124 0.17
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.13
144 0.17
145 0.19
146 0.23
147 0.25
148 0.3
149 0.32
150 0.39
151 0.4
152 0.43
153 0.45
154 0.43
155 0.45
156 0.41
157 0.42
158 0.35
159 0.29
160 0.26
161 0.25
162 0.24
163 0.21
164 0.19
165 0.22
166 0.24
167 0.29
168 0.31
169 0.36
170 0.37
171 0.42
172 0.53
173 0.48
174 0.46
175 0.42
176 0.38
177 0.32
178 0.31
179 0.31
180 0.23
181 0.23
182 0.26
183 0.25
184 0.26
185 0.24
186 0.22
187 0.17
188 0.15
189 0.18
190 0.14
191 0.14
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.12
252 0.17
253 0.18
254 0.22
255 0.26
256 0.29
257 0.3
258 0.33
259 0.35
260 0.36
261 0.36
262 0.38
263 0.4
264 0.44
265 0.46
266 0.46
267 0.47
268 0.46
269 0.47
270 0.47
271 0.45
272 0.44
273 0.45
274 0.48
275 0.49
276 0.45
277 0.46
278 0.47
279 0.47
280 0.46
281 0.49
282 0.49
283 0.5
284 0.51
285 0.52
286 0.53
287 0.55
288 0.55
289 0.53
290 0.52
291 0.49
292 0.48
293 0.47
294 0.47
295 0.46
296 0.42
297 0.4
298 0.36
299 0.35
300 0.38
301 0.36
302 0.31
303 0.26
304 0.26
305 0.23
306 0.21
307 0.19
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.14
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.17
316 0.22
317 0.24
318 0.26
319 0.27
320 0.25
321 0.26
322 0.28
323 0.31
324 0.29
325 0.27
326 0.24
327 0.21
328 0.2
329 0.2
330 0.18
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.2
335 0.17
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.17
355 0.2
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.2
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.27
364 0.3
365 0.32
366 0.4
367 0.47
368 0.49
369 0.53
370 0.55
371 0.59
372 0.59
373 0.58
374 0.57
375 0.57
376 0.59
377 0.63
378 0.6
379 0.51
380 0.47
381 0.47
382 0.43
383 0.4
384 0.39
385 0.38
386 0.43
387 0.45
388 0.46
389 0.44
390 0.42
391 0.37
392 0.39
393 0.33
394 0.26
395 0.24
396 0.31
397 0.33
398 0.37
399 0.37
400 0.33
401 0.33
402 0.33
403 0.32
404 0.3
405 0.31
406 0.29
407 0.3
408 0.29
409 0.27
410 0.24
411 0.25
412 0.2
413 0.18
414 0.21
415 0.21
416 0.24
417 0.24
418 0.23
419 0.22
420 0.28
421 0.32
422 0.29
423 0.31
424 0.32
425 0.35
426 0.41
427 0.44
428 0.42
429 0.38
430 0.39
431 0.39
432 0.34
433 0.31
434 0.25
435 0.22
436 0.19
437 0.19
438 0.15
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.15
450 0.16
451 0.16
452 0.24
453 0.29
454 0.34
455 0.35
456 0.39
457 0.43
458 0.43
459 0.47
460 0.44
461 0.49
462 0.52
463 0.52
464 0.5
465 0.43
466 0.43
467 0.4
468 0.4
469 0.32
470 0.25
471 0.25
472 0.24
473 0.24
474 0.22
475 0.2
476 0.18
477 0.17
478 0.16
479 0.17
480 0.2
481 0.2
482 0.24
483 0.28
484 0.28
485 0.27
486 0.31
487 0.32
488 0.33
489 0.36
490 0.33
491 0.31
492 0.35
493 0.36
494 0.32
495 0.28
496 0.22
497 0.19
498 0.2
499 0.18
500 0.13
501 0.11
502 0.14
503 0.15
504 0.15
505 0.17
506 0.15
507 0.14
508 0.12
509 0.14
510 0.13
511 0.14
512 0.16
513 0.17
514 0.23
515 0.25
516 0.3
517 0.29
518 0.28
519 0.29
520 0.29
521 0.31
522 0.32
523 0.35
524 0.36
525 0.38
526 0.4
527 0.4
528 0.38
529 0.41
530 0.4
531 0.43
532 0.46
533 0.53
534 0.59
535 0.66
536 0.7
537 0.68
538 0.7
539 0.65
540 0.58
541 0.54
542 0.49
543 0.46
544 0.49
545 0.5
546 0.41
547 0.41
548 0.42
549 0.44
550 0.46
551 0.46
552 0.4
553 0.39
554 0.39
555 0.37
556 0.39
557 0.35
558 0.36
559 0.39
560 0.41
561 0.37
562 0.39
563 0.39
564 0.34
565 0.35
566 0.31
567 0.25
568 0.23
569 0.24
570 0.27
571 0.3
572 0.35
573 0.37
574 0.44
575 0.5
576 0.53
577 0.6
578 0.65
579 0.71
580 0.75
581 0.77
582 0.79
583 0.82
584 0.82
585 0.78
586 0.79