FuNGI

A0A0C9VDX5

Protein Details

Accession

A0A0C9VDX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-387	DDRSSSKKRKRASSKSKNKDSSKRKRRRSEDSEEGSDSEDERSKSKKKKKKRSRKDDDSNEESSDAPKPKKRKRKSKKDDDSDSGSDSEENSDDEKKKKKRKTKSKRRDDVSSDDS	Basic
396-432	EDEAERRRPKSKSKSSSKKISSSKKSVSIKRQKSPSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-300	SKKRKRASSKSKNKDSSKRKRRRS
313-327	RSKSKKKKKKRSRKD
337-349	APKPKKRKRKSKK
367-379	KKKKKRKTKSKRR
401-428	RRRPKSKSKSSSKKISSSKKSVSIKRQK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSSRKLNADELKLHQAALAGNDKAKAEKLIPDGPTRTAAINFLLGAGMFKVMTSSGGVSAFRAVMKKEMDVKKDMSGEEAMVLSHIQASGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLVKSIKAVRHPTRKIYMLAHLDPSVELTGGPWYTDNELDTEFIKLLSTACLHYIRDRSFPKQSGKRASQNQQRFYAIGAAPSYPSAQQIQHFLSKSKITETELGVEHVEMLLRVLELDGEVEKIPAFAASSWDATVASEASGSDTASDSEDSDDDRSSSKKRKRASSKSKNKDSSKRKRRRSEDSEEGSDSEDERSKSKKKKKKRSRKDDDSNEESSDAPKPKKRKRKSKKDDDSDSGSDSEENSDDEKKKKKRKTKSKRRDDVSSDDSDSDSESQTEDEAERRRPKSKSKSSSKKISSSKKSVSIKRQKSPSPDLNDISAGGAFVYRAIRQERVALGWSQAPCGRCPVFDFCRDKGPTNPKECVYYEEWYTLGAGSQRTAVPAAMKIEI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.34
3	0.28
4	0.27
5	0.27
6	0.21
7	0.22
8	0.24
9	0.24
10	0.23
11	0.24
12	0.22
13	0.19
14	0.23
15	0.28
16	0.33
17	0.35
18	0.4
19	0.41
20	0.4
21	0.4
22	0.36
23	0.32
24	0.26
25	0.25
26	0.2
27	0.19
28	0.16
29	0.14
30	0.12
31	0.1
32	0.09
33	0.08
34	0.07
35	0.06
36	0.05
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.07
41	0.08
42	0.09
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.14
50	0.14
51	0.18
52	0.19
53	0.22
54	0.31
55	0.36
56	0.39
57	0.41
58	0.43
59	0.42
60	0.44
61	0.4
62	0.34
63	0.28
64	0.24
65	0.21
66	0.18
67	0.13
68	0.1
69	0.1
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.05
74	0.05
75	0.08
76	0.13
77	0.14
78	0.16
79	0.17
80	0.19
81	0.26
82	0.29
83	0.31
84	0.31
85	0.39
86	0.45
87	0.55
88	0.54
89	0.51
90	0.52
91	0.49
92	0.48
93	0.47
94	0.44
95	0.33
96	0.32
97	0.32
98	0.28
99	0.32
100	0.36
101	0.38
102	0.41
103	0.44
104	0.45
105	0.52
106	0.56
107	0.51
108	0.47
109	0.47
110	0.43
111	0.48
112	0.56
113	0.55
114	0.62
115	0.65
116	0.66
117	0.64
118	0.62
119	0.57
120	0.51
121	0.49
122	0.45
123	0.42
124	0.38
125	0.33
126	0.3
127	0.26
128	0.24
129	0.17
130	0.1
131	0.08
132	0.06
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.08
138	0.1
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.09
147	0.08
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.08
154	0.1
155	0.12
156	0.13
157	0.16
158	0.22
159	0.23
160	0.29
161	0.32
162	0.35
163	0.4
164	0.45
165	0.51
166	0.53
167	0.58
168	0.6
169	0.63
170	0.67
171	0.68
172	0.72
173	0.72
174	0.73
175	0.7
176	0.65
177	0.59
178	0.51
179	0.43
180	0.39
181	0.3
182	0.23
183	0.18
184	0.15
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.08
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.15
194	0.17
195	0.2
196	0.21
197	0.21
198	0.21
199	0.22
200	0.22
201	0.2
202	0.19
203	0.17
204	0.2
205	0.2
206	0.2
207	0.19
208	0.19
209	0.17
210	0.15
211	0.12
212	0.09
213	0.08
214	0.04
215	0.04
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.04
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.1
262	0.15
263	0.24
264	0.3
265	0.35
266	0.41
267	0.5
268	0.6
269	0.69
270	0.76
271	0.78
272	0.83
273	0.87
274	0.91
275	0.9
276	0.87
277	0.86
278	0.86
279	0.86
280	0.86
281	0.86
282	0.86
283	0.88
284	0.88
285	0.88
286	0.86
287	0.84
288	0.82
289	0.78
290	0.71
291	0.62
292	0.55
293	0.45
294	0.37
295	0.28
296	0.19
297	0.16
298	0.13
299	0.15
300	0.2
301	0.26
302	0.36
303	0.46
304	0.54
305	0.62
306	0.73
307	0.82
308	0.88
309	0.92
310	0.94
311	0.94
312	0.96
313	0.96
314	0.95
315	0.92
316	0.86
317	0.78
318	0.67
319	0.56
320	0.45
321	0.36
322	0.31
323	0.28
324	0.27
325	0.29
326	0.39
327	0.48
328	0.59
329	0.68
330	0.74
331	0.8
332	0.87
333	0.92
334	0.94
335	0.95
336	0.94
337	0.92
338	0.86
339	0.82
340	0.72
341	0.63
342	0.52
343	0.41
344	0.31
345	0.23
346	0.19
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.16
351	0.19
352	0.25
353	0.34
354	0.43
355	0.52
356	0.61
357	0.69
358	0.75
359	0.83
360	0.89
361	0.91
362	0.92
363	0.94
364	0.94
365	0.91
366	0.89
367	0.84
368	0.81
369	0.75
370	0.68
371	0.58
372	0.49
373	0.42
374	0.33
375	0.28
376	0.21
377	0.16
378	0.11
379	0.1
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.14
385	0.17
386	0.25
387	0.34
388	0.37
389	0.44
390	0.48
391	0.58
392	0.64
393	0.7
394	0.73
395	0.76
396	0.83
397	0.85
398	0.91
399	0.87
400	0.85
401	0.84
402	0.84
403	0.82
404	0.8
405	0.78
406	0.76
407	0.78
408	0.78
409	0.79
410	0.8
411	0.79
412	0.79
413	0.81
414	0.78
415	0.78
416	0.79
417	0.76
418	0.74
419	0.71
420	0.64
421	0.58
422	0.52
423	0.44
424	0.35
425	0.26
426	0.17
427	0.11
428	0.09
429	0.06
430	0.07
431	0.09
432	0.09
433	0.13
434	0.16
435	0.19
436	0.2
437	0.24
438	0.25
439	0.25
440	0.27
441	0.24
442	0.23
443	0.26
444	0.25
445	0.24
446	0.25
447	0.24
448	0.23
449	0.29
450	0.28
451	0.23
452	0.28
453	0.33
454	0.35
455	0.43
456	0.48
457	0.43
458	0.52
459	0.54
460	0.53
461	0.54
462	0.59
463	0.6
464	0.6
465	0.64
466	0.56
467	0.58
468	0.56
469	0.53
470	0.47
471	0.41
472	0.37
473	0.33
474	0.31
475	0.26
476	0.25
477	0.19
478	0.16
479	0.15
480	0.14
481	0.13
482	0.16
483	0.16
484	0.17
485	0.17
486	0.16
487	0.16
488	0.18

A0A0C9VDX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer