Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9LTW3

Protein Details
Accession A0A0C9LTW3    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-76NDRLKERYQKVQDKNKYPYEHydrophilic
259-289YRRYSDRGYNRDRNDQRRRGSRDRRDNDDDFBasic
304-324YDDAPPRRSRSRSPARRSRYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-320PRRSRSRSPARR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MDYQKAMLEELMSQYVDVDNKDFWDDSVCKHYIVAFCPSQLFTNTKSDLGACDKIHNDRLKERYQKVQDKNKYPYEAEFYDYLNKLISDLSRKIRQGNGRLNIQLDDKAAEVRKEEREEKMVLLDVKIKELLQKVEEAGEEGRVQEATDLQAEVDKLQEELTQFKENADGLSKAEKRMEVCDVCGAFLVTNDSSDRLEAHYQGKQHQGYLKIRDTIEQMRQNRQQQHHQPHGNYQQNNNYSRQRYDYHERRDGGRQRDYRRYSDRGYNRDRNDQRRRGSRDRRDNDDDFAGEIDRYSRRSRRDYDDAPPRRSRSRSPARRSRYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.2
12 0.2
13 0.21
14 0.28
15 0.28
16 0.25
17 0.25
18 0.29
19 0.25
20 0.27
21 0.3
22 0.24
23 0.24
24 0.26
25 0.27
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.21
30 0.28
31 0.28
32 0.27
33 0.26
34 0.25
35 0.25
36 0.28
37 0.3
38 0.23
39 0.26
40 0.29
41 0.32
42 0.39
43 0.41
44 0.4
45 0.42
46 0.47
47 0.52
48 0.59
49 0.59
50 0.61
51 0.66
52 0.72
53 0.74
54 0.78
55 0.79
56 0.78
57 0.82
58 0.79
59 0.73
60 0.64
61 0.58
62 0.54
63 0.46
64 0.39
65 0.33
66 0.27
67 0.29
68 0.28
69 0.24
70 0.18
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.19
77 0.25
78 0.3
79 0.32
80 0.35
81 0.39
82 0.44
83 0.48
84 0.52
85 0.51
86 0.49
87 0.5
88 0.48
89 0.43
90 0.37
91 0.29
92 0.21
93 0.16
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.17
100 0.21
101 0.25
102 0.27
103 0.26
104 0.29
105 0.29
106 0.28
107 0.25
108 0.23
109 0.19
110 0.17
111 0.2
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.15
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.13
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.11
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.06
147 0.08
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.17
164 0.19
165 0.23
166 0.16
167 0.16
168 0.19
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.13
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.27
191 0.25
192 0.26
193 0.27
194 0.31
195 0.35
196 0.4
197 0.4
198 0.37
199 0.37
200 0.36
201 0.36
202 0.35
203 0.37
204 0.39
205 0.39
206 0.43
207 0.5
208 0.55
209 0.6
210 0.59
211 0.61
212 0.64
213 0.7
214 0.72
215 0.71
216 0.65
217 0.66
218 0.71
219 0.68
220 0.61
221 0.57
222 0.55
223 0.55
224 0.56
225 0.53
226 0.51
227 0.46
228 0.46
229 0.46
230 0.4
231 0.41
232 0.49
233 0.54
234 0.55
235 0.59
236 0.58
237 0.58
238 0.65
239 0.66
240 0.62
241 0.63
242 0.62
243 0.62
244 0.7
245 0.71
246 0.7
247 0.69
248 0.67
249 0.62
250 0.65
251 0.66
252 0.65
253 0.7
254 0.71
255 0.69
256 0.74
257 0.77
258 0.78
259 0.8
260 0.8
261 0.79
262 0.8
263 0.84
264 0.84
265 0.87
266 0.87
267 0.87
268 0.85
269 0.85
270 0.83
271 0.77
272 0.7
273 0.63
274 0.52
275 0.42
276 0.36
277 0.28
278 0.19
279 0.17
280 0.16
281 0.14
282 0.17
283 0.24
284 0.3
285 0.36
286 0.44
287 0.51
288 0.57
289 0.64
290 0.66
291 0.68
292 0.73
293 0.74
294 0.74
295 0.76
296 0.72
297 0.71
298 0.71
299 0.7
300 0.7
301 0.72
302 0.75
303 0.78
304 0.83