Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9LSS6

Protein Details
Accession A0A0C9LSS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-104SGYETTDSRKRKRKAKNSNQTSNKKRVGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-93RKRKRKAKNS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSQNKVEDVYMMESNSRIQTRRTSRSARSASPVMEEEVASPVSSDELNPNIGSQVTNNSLVSNGGRVTRSQSVESSGYETTDSRKRKRKAKNSNQTSNKKRVGSASSDAYFKATPPPPPASTPAAAMSSSSTPPMNSNVQNGSNLNGDGERETRNTAQRISKEAREAKKAQRDLIIKERQVENQCNIRKQIIKQYTIIIFLIYRLTELDKLEKAVKDGSHSEYHKLLSDIESKRTKMLSVAEMRRSLAEGNVNNFFNSQKYAAYSQYFWDKLALRRSMIQHVQHKINTLEQEYYSNHVQSLTEDDAENDVEWAKQDPTADEPIYAASYQQQQYPSKQHQSSPPPPPSSSYFRHDTPPTTSTRDSPPLDMLASLADRQHQKDFKEEPTEKSFTLPPLNPWRYNQRPPLPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.25
4 0.23
5 0.25
6 0.34
7 0.43
8 0.51
9 0.57
10 0.6
11 0.63
12 0.72
13 0.75
14 0.7
15 0.67
16 0.63
17 0.56
18 0.52
19 0.47
20 0.38
21 0.33
22 0.28
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.14
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.11
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.15
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.2
55 0.25
56 0.27
57 0.27
58 0.27
59 0.29
60 0.3
61 0.3
62 0.28
63 0.21
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.25
69 0.32
70 0.37
71 0.47
72 0.54
73 0.63
74 0.74
75 0.8
76 0.83
77 0.87
78 0.89
79 0.9
80 0.93
81 0.94
82 0.93
83 0.9
84 0.88
85 0.83
86 0.74
87 0.65
88 0.6
89 0.54
90 0.5
91 0.46
92 0.42
93 0.37
94 0.36
95 0.34
96 0.3
97 0.26
98 0.2
99 0.24
100 0.21
101 0.23
102 0.28
103 0.33
104 0.33
105 0.35
106 0.39
107 0.35
108 0.33
109 0.31
110 0.27
111 0.23
112 0.21
113 0.18
114 0.16
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.12
121 0.15
122 0.18
123 0.18
124 0.21
125 0.23
126 0.24
127 0.25
128 0.24
129 0.22
130 0.19
131 0.17
132 0.14
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.14
140 0.17
141 0.21
142 0.23
143 0.25
144 0.29
145 0.29
146 0.35
147 0.36
148 0.36
149 0.39
150 0.45
151 0.45
152 0.46
153 0.49
154 0.51
155 0.56
156 0.55
157 0.49
158 0.48
159 0.47
160 0.45
161 0.49
162 0.47
163 0.4
164 0.41
165 0.41
166 0.4
167 0.42
168 0.4
169 0.34
170 0.37
171 0.39
172 0.37
173 0.37
174 0.35
175 0.34
176 0.33
177 0.39
178 0.37
179 0.36
180 0.35
181 0.37
182 0.34
183 0.31
184 0.29
185 0.19
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.19
206 0.22
207 0.23
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.22
212 0.2
213 0.17
214 0.14
215 0.21
216 0.21
217 0.26
218 0.28
219 0.28
220 0.29
221 0.29
222 0.26
223 0.2
224 0.21
225 0.21
226 0.26
227 0.3
228 0.32
229 0.33
230 0.33
231 0.31
232 0.29
233 0.23
234 0.16
235 0.17
236 0.15
237 0.17
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.14
244 0.15
245 0.13
246 0.1
247 0.12
248 0.14
249 0.16
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.23
254 0.23
255 0.2
256 0.22
257 0.22
258 0.25
259 0.32
260 0.32
261 0.27
262 0.32
263 0.34
264 0.37
265 0.4
266 0.42
267 0.41
268 0.45
269 0.49
270 0.45
271 0.45
272 0.4
273 0.38
274 0.34
275 0.29
276 0.25
277 0.21
278 0.23
279 0.21
280 0.24
281 0.22
282 0.2
283 0.18
284 0.16
285 0.16
286 0.13
287 0.18
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.1
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.15
305 0.2
306 0.2
307 0.18
308 0.18
309 0.17
310 0.18
311 0.16
312 0.13
313 0.11
314 0.17
315 0.18
316 0.21
317 0.26
318 0.28
319 0.34
320 0.43
321 0.48
322 0.51
323 0.52
324 0.54
325 0.58
326 0.64
327 0.68
328 0.69
329 0.7
330 0.65
331 0.63
332 0.62
333 0.59
334 0.56
335 0.52
336 0.47
337 0.44
338 0.41
339 0.47
340 0.46
341 0.44
342 0.43
343 0.42
344 0.41
345 0.43
346 0.43
347 0.39
348 0.43
349 0.47
350 0.43
351 0.42
352 0.4
353 0.36
354 0.34
355 0.31
356 0.23
357 0.18
358 0.17
359 0.15
360 0.13
361 0.17
362 0.2
363 0.24
364 0.32
365 0.35
366 0.35
367 0.43
368 0.47
369 0.49
370 0.56
371 0.56
372 0.54
373 0.57
374 0.59
375 0.51
376 0.49
377 0.45
378 0.4
379 0.44
380 0.4
381 0.41
382 0.48
383 0.55
384 0.55
385 0.57
386 0.63
387 0.64
388 0.71
389 0.73