FuNGI

A0A0C9MCW0

Protein Details

Accession

A0A0C9MCW0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
749-776	QTPPARQLFDSRRRKQHRSRDRIQGLIR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 6, cyto 5.5, cyto_nucl 5.5, nucl 4.5, extr 4, plas 3, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028802 SMG8 IPR019354 SMG8/SMG9
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MDDIRKLLDKTGLSSLKDTGLTIISLYGVSEAKQSSTIVNLANTIAGANVFAARHQPVQEPAIELAEGIQFYLDKHSKTIYLFADANMNTTSLSSEKSVAASIMNHQAATTKALLFMLIVSHLVIPILPPSFLPADFLSTLVALGQIKSNMHTHLAQYQSSCWKYWDIAVPNSLFEKKDNERMNPALMGWWGPAKGVPIVVFVMADVSMSSMTPATIKKMQDSLQSRMKNIFRALHLMPLKPEGNSSHPPVEVRSLFIIPSTAQPVIHIIPPAAASDGKAEFSFDEPLSLASYISSSKESPSIHLDYSDRLLKHFVSMWIKTAISRHPLHNNFNNRKSDTPKVAPLPTGLQFTSAIVPLMSFIFNQQITEEGVEFKKMISTQFPSTKGMIQQIDVILRKKIRDNIEVERVFSKSHSMDVMQKCNEAYLQDSPPFYTEKYHTWKKTTVMRMYRSLARGPCMEEYAARLERECDSIWKGGRQSCEHMSLTGRACRLKMGHEKEVTSAKQLRDGRAMIVDPAKHNSGYNFFHACDCGKTQRVREDPFDIEDANIKFYNKFSCCLGAGRAALDIKKSTFGDQQDLVLNYDEIPAPSDAALLYLGPSSMYKNNVGLDKVEGFMSNTNFLIPWSMTTMNELKLRQQEADNAVTVGSHDSAPPAASKTSNDTLLRSSAGSHQPPATRETEWPVLGKATSVQKTNTHVAAAAPVLVASLEAFPALGSNPTPSTTGTTSAHMATLTNTSVSSTATTPQTPPARQLFDSRRRKQHRSRDRIQGLIRGYVGAEYECPHGHRFLSCGEGRICKLGHAGHPKEHGNYFVHQDLPLYVICPCSYANSANNSGSGGGSTGNASNAHVNGNSSASYANHNMDMTAQLQRLYIVTPEEAITISIEPKIKIQVPGTDKHVIVDLGIDCLSFGPGGLYVLRLPFIYSDADGSPIPMETDVQRRLRSAILQRDCIKFHYKETEKWIVP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.36
3	0.33
4	0.32
5	0.29
6	0.21
7	0.18
8	0.16
9	0.14
10	0.13
11	0.1
12	0.09
13	0.09
14	0.09
15	0.08
16	0.08
17	0.12
18	0.12
19	0.13
20	0.14
21	0.15
22	0.14
23	0.16
24	0.19
25	0.17
26	0.17
27	0.17
28	0.16
29	0.15
30	0.14
31	0.11
32	0.09
33	0.07
34	0.06
35	0.06
36	0.08
37	0.07
38	0.08
39	0.12
40	0.14
41	0.17
42	0.19
43	0.22
44	0.24
45	0.27
46	0.28
47	0.28
48	0.26
49	0.24
50	0.22
51	0.18
52	0.15
53	0.14
54	0.12
55	0.09
56	0.09
57	0.07
58	0.08
59	0.17
60	0.19
61	0.18
62	0.2
63	0.23
64	0.25
65	0.27
66	0.33
67	0.26
68	0.28
69	0.27
70	0.26
71	0.32
72	0.28
73	0.29
74	0.23
75	0.21
76	0.16
77	0.15
78	0.16
79	0.1
80	0.12
81	0.11
82	0.13
83	0.14
84	0.14
85	0.15
86	0.14
87	0.14
88	0.13
89	0.16
90	0.22
91	0.21
92	0.2
93	0.19
94	0.21
95	0.21
96	0.23
97	0.21
98	0.13
99	0.14
100	0.14
101	0.14
102	0.12
103	0.11
104	0.09
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.06
111	0.06
112	0.05
113	0.08
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.11
118	0.13
119	0.13
120	0.16
121	0.14
122	0.17
123	0.17
124	0.18
125	0.15
126	0.13
127	0.13
128	0.1
129	0.11
130	0.07
131	0.07
132	0.09
133	0.11
134	0.11
135	0.14
136	0.16
137	0.15
138	0.18
139	0.19
140	0.19
141	0.23
142	0.26
143	0.25
144	0.25
145	0.27
146	0.33
147	0.33
148	0.32
149	0.28
150	0.27
151	0.26
152	0.29
153	0.34
154	0.3
155	0.32
156	0.35
157	0.34
158	0.33
159	0.35
160	0.33
161	0.25
162	0.21
163	0.26
164	0.26
165	0.34
166	0.38
167	0.39
168	0.43
169	0.44
170	0.45
171	0.39
172	0.35
173	0.27
174	0.22
175	0.19
176	0.14
177	0.13
178	0.11
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.08
190	0.08
191	0.06
192	0.06
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.04
199	0.05
200	0.07
201	0.08
202	0.12
203	0.17
204	0.18
205	0.21
206	0.25
207	0.27
208	0.34
209	0.39
210	0.4
211	0.44
212	0.45
213	0.44
214	0.48
215	0.47
216	0.43
217	0.42
218	0.39
219	0.32
220	0.35
221	0.34
222	0.36
223	0.36
224	0.33
225	0.3
226	0.3
227	0.29
228	0.24
229	0.26
230	0.2
231	0.24
232	0.27
233	0.3
234	0.28
235	0.28
236	0.29
237	0.28
238	0.32
239	0.26
240	0.24
241	0.22
242	0.19
243	0.18
244	0.18
245	0.17
246	0.12
247	0.13
248	0.14
249	0.12
250	0.11
251	0.12
252	0.14
253	0.15
254	0.16
255	0.14
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.1
261	0.09
262	0.08
263	0.1
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.11
268	0.1
269	0.12
270	0.14
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.12
276	0.11
277	0.1
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.1
283	0.09
284	0.1
285	0.14
286	0.15
287	0.16
288	0.21
289	0.23
290	0.21
291	0.23
292	0.23
293	0.2
294	0.23
295	0.25
296	0.2
297	0.18
298	0.19
299	0.17
300	0.18
301	0.19
302	0.21
303	0.21
304	0.22
305	0.23
306	0.24
307	0.24
308	0.23
309	0.23
310	0.21
311	0.23
312	0.24
313	0.26
314	0.33
315	0.38
316	0.44
317	0.49
318	0.56
319	0.58
320	0.63
321	0.65
322	0.58
323	0.57
324	0.56
325	0.55
326	0.52
327	0.47
328	0.46
329	0.45
330	0.43
331	0.4
332	0.35
333	0.32
334	0.27
335	0.26
336	0.2
337	0.17
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.12
342	0.1
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.11
367	0.15
368	0.2
369	0.25
370	0.27
371	0.27
372	0.28
373	0.29
374	0.28
375	0.29
376	0.24
377	0.19
378	0.19
379	0.17
380	0.19
381	0.19
382	0.19
383	0.17
384	0.17
385	0.18
386	0.2
387	0.26
388	0.27
389	0.3
390	0.34
391	0.37
392	0.45
393	0.44
394	0.42
395	0.37
396	0.33
397	0.28
398	0.23
399	0.21
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.12
404	0.19
405	0.23
406	0.28
407	0.25
408	0.26
409	0.24
410	0.24
411	0.23
412	0.15
413	0.14
414	0.12
415	0.14
416	0.15
417	0.16
418	0.16
419	0.17
420	0.17
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.18
425	0.25
426	0.33
427	0.35
428	0.37
429	0.4
430	0.41
431	0.47
432	0.49
433	0.49
434	0.48
435	0.49
436	0.49
437	0.49
438	0.49
439	0.43
440	0.39
441	0.32
442	0.27
443	0.25
444	0.23
445	0.2
446	0.18
447	0.16
448	0.12
449	0.13
450	0.16
451	0.16
452	0.14
453	0.13
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.15
458	0.12
459	0.12
460	0.16
461	0.16
462	0.17
463	0.19
464	0.2
465	0.23
466	0.23
467	0.25
468	0.24
469	0.27
470	0.25
471	0.23
472	0.22
473	0.22
474	0.22
475	0.21
476	0.2
477	0.16
478	0.16
479	0.17
480	0.16
481	0.19
482	0.26
483	0.29
484	0.34
485	0.34
486	0.35
487	0.35
488	0.39
489	0.34
490	0.29
491	0.28
492	0.22
493	0.28
494	0.3
495	0.29
496	0.28
497	0.28
498	0.24
499	0.21
500	0.21
501	0.15
502	0.15
503	0.15
504	0.12
505	0.14
506	0.14
507	0.13
508	0.13
509	0.13
510	0.15
511	0.16
512	0.19
513	0.18
514	0.18
515	0.18
516	0.18
517	0.18
518	0.15
519	0.15
520	0.15
521	0.19
522	0.21
523	0.24
524	0.31
525	0.36
526	0.38
527	0.39
528	0.39
529	0.36
530	0.35
531	0.32
532	0.25
533	0.19
534	0.2
535	0.17
536	0.16
537	0.15
538	0.14
539	0.13
540	0.14
541	0.2
542	0.17
543	0.18
544	0.16
545	0.18
546	0.18
547	0.19
548	0.19
549	0.15
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.12
554	0.12
555	0.11
556	0.11
557	0.09
558	0.12
559	0.12
560	0.13
561	0.17
562	0.18
563	0.2
564	0.2
565	0.21
566	0.21
567	0.21
568	0.2
569	0.16
570	0.14
571	0.11
572	0.12
573	0.1
574	0.07
575	0.08
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.07
590	0.09
591	0.11
592	0.11
593	0.13
594	0.15
595	0.17
596	0.17
597	0.15
598	0.15
599	0.14
600	0.14
601	0.13
602	0.11
603	0.1
604	0.12
605	0.12
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.11
612	0.08
613	0.07
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.13
618	0.15
619	0.17
620	0.2
621	0.2
622	0.21
623	0.25
624	0.26
625	0.25
626	0.24
627	0.26
628	0.26
629	0.27
630	0.24
631	0.19
632	0.17
633	0.15
634	0.15
635	0.11
636	0.08
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.09
644	0.09
645	0.1
646	0.11
647	0.16
648	0.18
649	0.23
650	0.23
651	0.23
652	0.23
653	0.24
654	0.23
655	0.17
656	0.16
657	0.17
658	0.23
659	0.23
660	0.23
661	0.26
662	0.28
663	0.29
664	0.31
665	0.28
666	0.23
667	0.24
668	0.27
669	0.28
670	0.26
671	0.25
672	0.22
673	0.21
674	0.19
675	0.17
676	0.16
677	0.19
678	0.2
679	0.22
680	0.23
681	0.26
682	0.3
683	0.34
684	0.31
685	0.24
686	0.22
687	0.2
688	0.19
689	0.16
690	0.11
691	0.08
692	0.06
693	0.06
694	0.05
695	0.05
696	0.04
697	0.04
698	0.03
699	0.03
700	0.04
701	0.03
702	0.04
703	0.04
704	0.05
705	0.05
706	0.07
707	0.08
708	0.1
709	0.11
710	0.11
711	0.15
712	0.15
713	0.19
714	0.18
715	0.2
716	0.2
717	0.2
718	0.19
719	0.15
720	0.14
721	0.11
722	0.12
723	0.11
724	0.09
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.09
731	0.12
732	0.14
733	0.16
734	0.16
735	0.23
736	0.29
737	0.28
738	0.33
739	0.35
740	0.37
741	0.38
742	0.46
743	0.48
744	0.53
745	0.63
746	0.66
747	0.71
748	0.75
749	0.84
750	0.85
751	0.86
752	0.87
753	0.86
754	0.85
755	0.86
756	0.82
757	0.8
758	0.73
759	0.68
760	0.59
761	0.52
762	0.43
763	0.32
764	0.27
765	0.2
766	0.17
767	0.11
768	0.1
769	0.09
770	0.11
771	0.12
772	0.14
773	0.15
774	0.16
775	0.17
776	0.17
777	0.17
778	0.16
779	0.22
780	0.21
781	0.24
782	0.25
783	0.28
784	0.28
785	0.3
786	0.28
787	0.22
788	0.25
789	0.24
790	0.29
791	0.35
792	0.38
793	0.39
794	0.44
795	0.46
796	0.46
797	0.44
798	0.4
799	0.33
800	0.32
801	0.32
802	0.29
803	0.27
804	0.24
805	0.23
806	0.2
807	0.19
808	0.16
809	0.12
810	0.11
811	0.11
812	0.11
813	0.11
814	0.11
815	0.12
816	0.15
817	0.18
818	0.22
819	0.26
820	0.3
821	0.29
822	0.29
823	0.26
824	0.24
825	0.2
826	0.16
827	0.11
828	0.08
829	0.07
830	0.08
831	0.08
832	0.1
833	0.1
834	0.11
835	0.13
836	0.13
837	0.15
838	0.14
839	0.15
840	0.14
841	0.15
842	0.14
843	0.12
844	0.13
845	0.12
846	0.16
847	0.17
848	0.18
849	0.18
850	0.18
851	0.17
852	0.17
853	0.18
854	0.16
855	0.18
856	0.17
857	0.16
858	0.16
859	0.16
860	0.16
861	0.15
862	0.14
863	0.12
864	0.12
865	0.12
866	0.12
867	0.12
868	0.12
869	0.12
870	0.11
871	0.1
872	0.11
873	0.13
874	0.15
875	0.15
876	0.17
877	0.22
878	0.24
879	0.28
880	0.3
881	0.34
882	0.37
883	0.41
884	0.45
885	0.45
886	0.41
887	0.37
888	0.36
889	0.28
890	0.23
891	0.23
892	0.17
893	0.14
894	0.14
895	0.13
896	0.1
897	0.11
898	0.11
899	0.07
900	0.07
901	0.05
902	0.06
903	0.07
904	0.07
905	0.09
906	0.09
907	0.1
908	0.11
909	0.11
910	0.11
911	0.1
912	0.12
913	0.13
914	0.12
915	0.14
916	0.14
917	0.16
918	0.15
919	0.16
920	0.15
921	0.13
922	0.13
923	0.11
924	0.12
925	0.14
926	0.22
927	0.29
928	0.34
929	0.35
930	0.36
931	0.38
932	0.4
933	0.44
934	0.45
935	0.48
936	0.49
937	0.55
938	0.6
939	0.62
940	0.61
941	0.57
942	0.56
943	0.48
944	0.47
945	0.5
946	0.5
947	0.52
948	0.59

A0A0C9MCW0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer