Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9MSG2

Protein Details
Accession A0A0C9MSG2    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-82EEEIRKNIEKSKNRKRNYAKLQGKGLGHydrophilic
92-115DSALNWIKKSRKREKDLAARRAREHydrophilic
266-294EADATFKKPKSKKKKKMRRKNKDEDDLNIBasic
514-548QNEQRKKERLRELEEKREKERRRGHDRKSGRDSNSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-72AKEEEIRKNIEKSKNRKRN
99-111KKSRKREKDLAAR
272-287KKPKSKKKKKMRRKNK
518-548RKKERLRELEEKREKERRRGHDRKSGRDSNS
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAESISIEETNALREKLGLPPLAIEGDAEDQVVDPDKDAYDNYQKSKQEKERLAKEEEIRKNIEKSKNRKRNYAKLQGKGLGEASDDDEEGDSALNWIKKSRKREKDLAARRARELEEMDNSYQSYDAAHLAGLKVSHAISEFEEGNETILTLKDRNILGEDDDDVDELTNVNMEDRERLKKNLEAKKQKPGYNPYDDDQFNGKKSSILPQYEEDEEEGGFVIGKSGTIKRVVDEADEKTVAQKLKEQTLSYEKMQEIKDYYTQEEADATFKKPKSKKKKKMRRKNKDEDDLNISTTATTAASTEEPVSQPRSRTIDPDANFVDDDDLQESLARARRIANKQKNKLFKKMTPEEIAKQIREEQNDQMKEEDNDEGGLVLSEATEFVNALGNNIPTFEAKEPAPKPQQQHHHHEVQVKVEPDTEYEVHTVDDTPSRDVKMEQVQDQDTAMAEPEKEEEHIKEEEEVKAEVIVEEPLVSRGLAATLNLLNQKGIIAKPTEEQIKRDKIAAEQIRWQNEQRKKERLRELEEKREKERRRGHDRKSGRDSNSDRQRELEREREREREREEAQRMREYELAMQNYKPEVNLEYTDDTGRVMKTAEAFRYMSHKFHGKTSGKTKTEKRMQKIEEERKLNMMSSTDTPHNLAGALLERQQRTGNAHVVLSVGNRGVVPTSTPLAKSSKSNKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.23
4 0.28
5 0.25
6 0.22
7 0.23
8 0.25
9 0.24
10 0.22
11 0.16
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.14
20 0.12
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.19
27 0.26
28 0.32
29 0.36
30 0.42
31 0.47
32 0.51
33 0.6
34 0.64
35 0.64
36 0.68
37 0.73
38 0.75
39 0.75
40 0.77
41 0.74
42 0.72
43 0.72
44 0.7
45 0.66
46 0.62
47 0.6
48 0.61
49 0.63
50 0.65
51 0.64
52 0.67
53 0.73
54 0.78
55 0.79
56 0.83
57 0.84
58 0.85
59 0.85
60 0.86
61 0.84
62 0.8
63 0.82
64 0.77
65 0.69
66 0.6
67 0.5
68 0.4
69 0.31
70 0.25
71 0.21
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.06
80 0.06
81 0.1
82 0.12
83 0.12
84 0.18
85 0.26
86 0.33
87 0.44
88 0.54
89 0.61
90 0.67
91 0.76
92 0.81
93 0.84
94 0.88
95 0.88
96 0.87
97 0.8
98 0.74
99 0.69
100 0.6
101 0.52
102 0.45
103 0.39
104 0.35
105 0.35
106 0.34
107 0.3
108 0.28
109 0.25
110 0.22
111 0.17
112 0.12
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.1
139 0.09
140 0.11
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.12
163 0.15
164 0.23
165 0.25
166 0.28
167 0.31
168 0.35
169 0.44
170 0.49
171 0.56
172 0.6
173 0.61
174 0.69
175 0.73
176 0.73
177 0.71
178 0.71
179 0.67
180 0.65
181 0.64
182 0.55
183 0.55
184 0.49
185 0.44
186 0.41
187 0.36
188 0.29
189 0.28
190 0.26
191 0.21
192 0.22
193 0.28
194 0.28
195 0.28
196 0.29
197 0.3
198 0.33
199 0.32
200 0.32
201 0.24
202 0.18
203 0.15
204 0.13
205 0.1
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.16
219 0.16
220 0.17
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.2
228 0.19
229 0.16
230 0.2
231 0.19
232 0.26
233 0.29
234 0.28
235 0.28
236 0.33
237 0.36
238 0.32
239 0.34
240 0.27
241 0.3
242 0.3
243 0.28
244 0.23
245 0.22
246 0.25
247 0.22
248 0.23
249 0.2
250 0.2
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.19
258 0.21
259 0.29
260 0.35
261 0.45
262 0.54
263 0.64
264 0.72
265 0.77
266 0.87
267 0.9
268 0.95
269 0.96
270 0.96
271 0.95
272 0.96
273 0.94
274 0.93
275 0.84
276 0.77
277 0.72
278 0.62
279 0.51
280 0.4
281 0.3
282 0.2
283 0.17
284 0.13
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.19
299 0.23
300 0.23
301 0.25
302 0.29
303 0.31
304 0.3
305 0.33
306 0.3
307 0.26
308 0.25
309 0.23
310 0.18
311 0.11
312 0.11
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.14
323 0.22
324 0.31
325 0.41
326 0.49
327 0.56
328 0.64
329 0.7
330 0.77
331 0.73
332 0.74
333 0.69
334 0.63
335 0.63
336 0.6
337 0.58
338 0.53
339 0.51
340 0.44
341 0.46
342 0.44
343 0.35
344 0.3
345 0.31
346 0.3
347 0.29
348 0.3
349 0.27
350 0.33
351 0.34
352 0.33
353 0.29
354 0.27
355 0.25
356 0.24
357 0.18
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.06
363 0.05
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.18
387 0.18
388 0.25
389 0.31
390 0.33
391 0.36
392 0.41
393 0.52
394 0.51
395 0.59
396 0.57
397 0.58
398 0.57
399 0.59
400 0.53
401 0.46
402 0.43
403 0.35
404 0.3
405 0.25
406 0.22
407 0.17
408 0.19
409 0.16
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.12
418 0.12
419 0.14
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.19
425 0.22
426 0.24
427 0.24
428 0.26
429 0.26
430 0.26
431 0.26
432 0.22
433 0.15
434 0.12
435 0.1
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.13
445 0.14
446 0.14
447 0.16
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.17
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.1
456 0.08
457 0.07
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.14
483 0.18
484 0.25
485 0.24
486 0.28
487 0.33
488 0.39
489 0.38
490 0.4
491 0.37
492 0.31
493 0.4
494 0.43
495 0.37
496 0.39
497 0.43
498 0.45
499 0.46
500 0.49
501 0.48
502 0.5
503 0.57
504 0.56
505 0.62
506 0.64
507 0.71
508 0.76
509 0.75
510 0.76
511 0.77
512 0.78
513 0.79
514 0.81
515 0.76
516 0.74
517 0.75
518 0.72
519 0.71
520 0.73
521 0.72
522 0.74
523 0.79
524 0.8
525 0.81
526 0.84
527 0.84
528 0.84
529 0.82
530 0.75
531 0.74
532 0.73
533 0.73
534 0.75
535 0.69
536 0.6
537 0.56
538 0.57
539 0.55
540 0.54
541 0.54
542 0.51
543 0.55
544 0.59
545 0.65
546 0.64
547 0.64
548 0.63
549 0.61
550 0.57
551 0.58
552 0.62
553 0.59
554 0.6
555 0.6
556 0.57
557 0.52
558 0.5
559 0.42
560 0.4
561 0.4
562 0.39
563 0.34
564 0.33
565 0.32
566 0.32
567 0.3
568 0.24
569 0.19
570 0.16
571 0.18
572 0.2
573 0.21
574 0.21
575 0.23
576 0.23
577 0.21
578 0.2
579 0.19
580 0.17
581 0.13
582 0.12
583 0.12
584 0.16
585 0.21
586 0.22
587 0.24
588 0.24
589 0.25
590 0.31
591 0.32
592 0.29
593 0.28
594 0.34
595 0.32
596 0.37
597 0.46
598 0.44
599 0.5
600 0.58
601 0.64
602 0.61
603 0.68
604 0.7
605 0.71
606 0.76
607 0.77
608 0.75
609 0.75
610 0.74
611 0.76
612 0.79
613 0.79
614 0.78
615 0.74
616 0.68
617 0.63
618 0.6
619 0.51
620 0.42
621 0.33
622 0.27
623 0.26
624 0.29
625 0.27
626 0.27
627 0.27
628 0.26
629 0.24
630 0.2
631 0.17
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.18
636 0.24
637 0.24
638 0.26
639 0.28
640 0.29
641 0.32
642 0.35
643 0.36
644 0.32
645 0.31
646 0.3
647 0.28
648 0.26
649 0.22
650 0.19
651 0.13
652 0.12
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.12
657 0.13
658 0.14
659 0.17
660 0.19
661 0.2
662 0.23
663 0.26
664 0.28
665 0.34