FuNGI

A0A0C9MV20

Protein Details

Accession

A0A0C9MV20

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-143	HVNWRRMSIKHLERKRNRLLRSKPPITT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-136	IKHLERKRNRLLR

Subcellular Location(s)

extr 7, nucl 6, mito 5, cyto_nucl 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MDSVPTYQRTLSTIDFIFAGHALRHLLSDANVGFIPPSWSDHAILEVTLKLGKSKMGPGLWRGNPCYANNRAYQKQLEEKINATMDTLDLDMTPQDQWERIKLVTKKVIQKFGVKHVNWRRMSIKHLERKRNRLLRSKPPITTLRILLPKIDSMLQILQQELVDIAALKAGDTWREKGEKSAGYLKRLHQTRTSQQYMASLQAPESCRDVAVTRVEVNSAVVSGDSLTGAAQGDLGGTGMAHGDAGDTGTPGGVGDTNGAGVMDGTEDISVNQDETRLSLDGLSTDSSDDDFESAVDAVDQVGAESPVERPWISDNLEDMKSFAWHYYTDLYRADPVEPSDIAAYLDTVTFEKVLTIDEQQFLMDPITLDELLQQANRSTKATAPGSDGLAYPFLSLLFNMTCLQDLVLKVYNDALDGIFPSSWHDLRIRLFPKKGLLALLKNWRPICLLGCDGKVFTRLLAQRMAPILGRIINPFQSGFIQQRFICDNGMALSMVLEEAQAFKHTGAGILLDQEKAYNRVNADYLCAVLLRFGFPASFVSCIKLLFFGNDMYVNVNGHFTSAVKQERGIRQGDPLASNGTSTDMVTSRVSPAVKCLAYADDVCVFLRDELDLYRLQQHMANYSAVSNAKFNEDKSEAFSLSGRRSSAWVRAFEEMNVHTYYHHGSGAAFRYLGLYFAYSHAQRVQTEEMLLNSVKTQCRIYGQRQLSILGRVTIVNSLILSKVWYSLRMLRPTKRFLEKVKSCVYQFVWQKKCPLIRKDLIFLPKSRGGLAVLNPSLQQLILQKRWLNYIINPGKYPSFLLPFMLYHLSLLPASSDFPYMAFLDAEYRRSPMLYKDLSIWHSIFALYDYFEFPDIQQVKVIPLQTVLQLPLHKLLTGFSDNHWLQRHPKFPATKFLIFDHYQQRLRLHVAAQNSPTGSWCVAPHLTVSLHRHRGLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.2
4	0.19
5	0.15
6	0.15
7	0.1
8	0.1
9	0.11
10	0.11
11	0.12
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.17
16	0.15
17	0.16
18	0.16
19	0.15
20	0.15
21	0.14
22	0.17
23	0.12
24	0.16
25	0.18
26	0.2
27	0.22
28	0.22
29	0.24
30	0.21
31	0.2
32	0.18
33	0.14
34	0.13
35	0.14
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.15
40	0.17
41	0.22
42	0.27
43	0.3
44	0.33
45	0.38
46	0.47
47	0.5
48	0.53
49	0.51
50	0.51
51	0.51
52	0.51
53	0.52
54	0.48
55	0.47
56	0.48
57	0.53
58	0.5
59	0.52
60	0.53
61	0.52
62	0.55
63	0.58
64	0.57
65	0.52
66	0.5
67	0.49
68	0.47
69	0.4
70	0.32
71	0.25
72	0.19
73	0.17
74	0.15
75	0.1
76	0.07
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.1
83	0.13
84	0.15
85	0.18
86	0.21
87	0.22
88	0.31
89	0.34
90	0.41
91	0.47
92	0.52
93	0.58
94	0.62
95	0.69
96	0.64
97	0.68
98	0.64
99	0.65
100	0.68
101	0.58
102	0.62
103	0.63
104	0.7
105	0.63
106	0.64
107	0.6
108	0.53
109	0.58
110	0.58
111	0.58
112	0.58
113	0.66
114	0.72
115	0.75
116	0.81
117	0.87
118	0.85
119	0.82
120	0.83
121	0.82
122	0.82
123	0.83
124	0.82
125	0.73
126	0.71
127	0.69
128	0.65
129	0.6
130	0.52
131	0.49
132	0.47
133	0.45
134	0.4
135	0.36
136	0.31
137	0.29
138	0.27
139	0.19
140	0.17
141	0.19
142	0.19
143	0.18
144	0.17
145	0.16
146	0.15
147	0.14
148	0.11
149	0.09
150	0.06
151	0.06
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.07
157	0.08
158	0.13
159	0.15
160	0.18
161	0.21
162	0.24
163	0.25
164	0.27
165	0.34
166	0.31
167	0.33
168	0.4
169	0.4
170	0.41
171	0.46
172	0.46
173	0.48
174	0.5
175	0.49
176	0.46
177	0.5
178	0.55
179	0.59
180	0.6
181	0.52
182	0.48
183	0.49
184	0.43
185	0.38
186	0.31
187	0.22
188	0.18
189	0.22
190	0.23
191	0.2
192	0.21
193	0.18
194	0.16
195	0.17
196	0.17
197	0.16
198	0.18
199	0.18
200	0.18
201	0.18
202	0.18
203	0.17
204	0.17
205	0.13
206	0.1
207	0.08
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.03
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.11
299	0.15
300	0.16
301	0.17
302	0.18
303	0.2
304	0.22
305	0.21
306	0.18
307	0.15
308	0.14
309	0.13
310	0.12
311	0.08
312	0.08
313	0.1
314	0.13
315	0.14
316	0.15
317	0.15
318	0.16
319	0.16
320	0.17
321	0.16
322	0.13
323	0.13
324	0.14
325	0.13
326	0.13
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.09
331	0.08
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.09
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.07
352	0.06
353	0.05
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.07
362	0.08
363	0.1
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.13
368	0.19
369	0.2
370	0.2
371	0.21
372	0.21
373	0.21
374	0.2
375	0.19
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.08
380	0.07
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.1
395	0.13
396	0.12
397	0.12
398	0.13
399	0.13
400	0.11
401	0.11
402	0.08
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.07
409	0.09
410	0.09
411	0.11
412	0.11
413	0.13
414	0.15
415	0.23
416	0.25
417	0.27
418	0.28
419	0.28
420	0.3
421	0.29
422	0.28
423	0.23
424	0.22
425	0.19
426	0.23
427	0.3
428	0.3
429	0.33
430	0.32
431	0.29
432	0.27
433	0.26
434	0.23
435	0.16
436	0.17
437	0.15
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.11
444	0.09
445	0.12
446	0.13
447	0.15
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.16
452	0.17
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.1
466	0.12
467	0.12
468	0.15
469	0.14
470	0.16
471	0.17
472	0.17
473	0.15
474	0.12
475	0.12
476	0.09
477	0.1
478	0.07
479	0.06
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.02
486	0.03
487	0.03
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.1
504	0.11
505	0.11
506	0.11
507	0.12
508	0.14
509	0.13
510	0.14
511	0.11
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.07
516	0.06
517	0.07
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.07
524	0.07
525	0.09
526	0.08
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.08
534	0.09
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.08
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.06
548	0.08
549	0.13
550	0.15
551	0.14
552	0.17
553	0.22
554	0.27
555	0.3
556	0.29
557	0.25
558	0.25
559	0.27
560	0.27
561	0.22
562	0.19
563	0.17
564	0.15
565	0.15
566	0.12
567	0.11
568	0.1
569	0.09
570	0.09
571	0.07
572	0.09
573	0.1
574	0.11
575	0.1
576	0.13
577	0.13
578	0.12
579	0.14
580	0.17
581	0.17
582	0.16
583	0.16
584	0.14
585	0.16
586	0.16
587	0.15
588	0.11
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.09
599	0.08
600	0.09
601	0.13
602	0.13
603	0.14
604	0.16
605	0.16
606	0.16
607	0.18
608	0.17
609	0.13
610	0.13
611	0.15
612	0.14
613	0.14
614	0.12
615	0.11
616	0.15
617	0.15
618	0.16
619	0.19
620	0.2
621	0.2
622	0.23
623	0.25
624	0.21
625	0.21
626	0.22
627	0.2
628	0.21
629	0.22
630	0.19
631	0.17
632	0.19
633	0.21
634	0.27
635	0.27
636	0.28
637	0.28
638	0.3
639	0.3
640	0.28
641	0.29
642	0.22
643	0.2
644	0.18
645	0.16
646	0.13
647	0.14
648	0.15
649	0.13
650	0.13
651	0.1
652	0.09
653	0.14
654	0.17
655	0.16
656	0.14
657	0.13
658	0.14
659	0.14
660	0.14
661	0.1
662	0.08
663	0.08
664	0.09
665	0.13
666	0.11
667	0.13
668	0.16
669	0.18
670	0.17
671	0.21
672	0.22
673	0.2
674	0.21
675	0.2
676	0.17
677	0.17
678	0.17
679	0.13
680	0.12
681	0.16
682	0.16
683	0.16
684	0.17
685	0.16
686	0.23
687	0.29
688	0.33
689	0.39
690	0.41
691	0.43
692	0.43
693	0.43
694	0.39
695	0.36
696	0.31
697	0.21
698	0.19
699	0.15
700	0.15
701	0.14
702	0.12
703	0.09
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.07
710	0.11
711	0.11
712	0.12
713	0.14
714	0.23
715	0.3
716	0.38
717	0.44
718	0.48
719	0.54
720	0.59
721	0.63
722	0.62
723	0.61
724	0.59
725	0.64
726	0.62
727	0.63
728	0.64
729	0.61
730	0.54
731	0.54
732	0.5
733	0.47
734	0.49
735	0.52
736	0.52
737	0.51
738	0.55
739	0.56
740	0.61
741	0.61
742	0.6
743	0.59
744	0.59
745	0.6
746	0.6
747	0.6
748	0.59
749	0.54
750	0.49
751	0.47
752	0.44
753	0.4
754	0.36
755	0.31
756	0.25
757	0.26
758	0.27
759	0.28
760	0.24
761	0.24
762	0.23
763	0.23
764	0.21
765	0.17
766	0.16
767	0.15
768	0.22
769	0.24
770	0.29
771	0.32
772	0.33
773	0.37
774	0.38
775	0.34
776	0.29
777	0.37
778	0.4
779	0.4
780	0.39
781	0.38
782	0.36
783	0.34
784	0.34
785	0.27
786	0.24
787	0.21
788	0.22
789	0.22
790	0.21
791	0.23
792	0.23
793	0.18
794	0.15
795	0.15
796	0.14
797	0.12
798	0.12
799	0.1
800	0.08
801	0.1
802	0.1
803	0.11
804	0.1
805	0.1
806	0.12
807	0.12
808	0.12
809	0.1
810	0.1
811	0.15
812	0.17
813	0.2
814	0.18
815	0.19
816	0.19
817	0.19
818	0.21
819	0.19
820	0.26
821	0.26
822	0.26
823	0.29
824	0.34
825	0.35
826	0.38
827	0.33
828	0.25
829	0.23
830	0.22
831	0.18
832	0.14
833	0.13
834	0.1
835	0.11
836	0.11
837	0.11
838	0.13
839	0.13
840	0.12
841	0.21
842	0.21
843	0.2
844	0.21
845	0.21
846	0.23
847	0.26
848	0.26
849	0.17
850	0.17
851	0.18
852	0.18
853	0.2
854	0.19
855	0.19
856	0.2
857	0.21
858	0.24
859	0.24
860	0.22
861	0.2
862	0.19
863	0.21
864	0.24
865	0.23
866	0.19
867	0.28
868	0.28
869	0.34
870	0.37
871	0.34
872	0.39
873	0.46
874	0.52
875	0.49
876	0.56
877	0.6
878	0.59
879	0.67
880	0.67
881	0.63
882	0.59
883	0.56
884	0.55
885	0.47
886	0.51
887	0.5
888	0.5
889	0.49
890	0.49
891	0.48
892	0.45
893	0.48
894	0.44
895	0.39
896	0.35
897	0.36
898	0.39
899	0.39
900	0.38
901	0.35
902	0.32
903	0.29
904	0.28
905	0.24
906	0.2
907	0.18
908	0.2
909	0.2
910	0.21
911	0.2
912	0.21
913	0.22
914	0.26
915	0.33
916	0.37
917	0.43

A0A0C9MV20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer