Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9MEM5

Protein Details
Accession A0A0C9MEM5    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-253YERRRRSHSRHRDDDKSRSRBasic
262-281MSPVYKRRDRYRSRSRSGSKHydrophilic
377-400INVSLRVPKRIKKRKLGCETDGYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-281RRRRSHSRHRDDDKSRSRDRYSRKRSMSPVYKRRDRYRSRSRSGSK
385-391KRIKKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.333, cyto_mito 2.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSNKKASNVLETWGNETTMNLNAIIYQNILSSPYFRSLYNKKTFHEIVDEIYNEAPFVKGTQPSTAYCCLFKMWTLRLTVKQIENMIDHVDSPYIRAIGFLYLRYVCAPAQLWDWLQYYLEDEEEIAISSGVNPTKITIGKLCRMLITEQKFQNTMLPRIPVPIARDLEKKLNDYDMEKRKTSTRRDDRDRDDKHYSRDRGRDRSTSRQRYTSRSRSPSRKSYRRDDRDDLDDYERRRRSHSRHRDDDKSRSRDRYSRKRSMSPVYKRRDRYRSRSRSGSKEDTRRSESRTYSKDSTSDRILLLNACNHMKSVGLEANQAVTVEFMKCLEAFVQNKPLREKWQQTDLDFTTNCVFLDESAFHINLKRGSVISATGLINVSLRVPKRIKKRKLGCETDGYSIGTVTGHYLGFLKATLDEMDKYPEMKGHYLAMDNGLIHSSTDIGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.24
3 0.24
4 0.23
5 0.19
6 0.19
7 0.14
8 0.12
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.13
13 0.11
14 0.1
15 0.11
16 0.13
17 0.11
18 0.12
19 0.14
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.27
24 0.34
25 0.43
26 0.51
27 0.53
28 0.49
29 0.57
30 0.58
31 0.52
32 0.51
33 0.42
34 0.36
35 0.37
36 0.35
37 0.28
38 0.28
39 0.25
40 0.18
41 0.17
42 0.13
43 0.08
44 0.1
45 0.12
46 0.15
47 0.17
48 0.22
49 0.24
50 0.26
51 0.31
52 0.34
53 0.32
54 0.28
55 0.28
56 0.25
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.24
61 0.26
62 0.3
63 0.33
64 0.36
65 0.41
66 0.44
67 0.4
68 0.39
69 0.38
70 0.36
71 0.33
72 0.29
73 0.26
74 0.2
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.12
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.17
126 0.21
127 0.25
128 0.28
129 0.28
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.3
134 0.31
135 0.34
136 0.33
137 0.34
138 0.34
139 0.32
140 0.36
141 0.32
142 0.29
143 0.25
144 0.24
145 0.23
146 0.24
147 0.25
148 0.21
149 0.2
150 0.23
151 0.22
152 0.23
153 0.26
154 0.27
155 0.32
156 0.32
157 0.31
158 0.26
159 0.27
160 0.25
161 0.25
162 0.31
163 0.34
164 0.36
165 0.35
166 0.35
167 0.4
168 0.46
169 0.51
170 0.53
171 0.54
172 0.6
173 0.68
174 0.75
175 0.76
176 0.79
177 0.76
178 0.71
179 0.7
180 0.64
181 0.62
182 0.62
183 0.6
184 0.56
185 0.6
186 0.6
187 0.59
188 0.61
189 0.62
190 0.59
191 0.65
192 0.69
193 0.7
194 0.66
195 0.66
196 0.64
197 0.64
198 0.67
199 0.66
200 0.65
201 0.63
202 0.67
203 0.68
204 0.72
205 0.75
206 0.76
207 0.75
208 0.72
209 0.74
210 0.78
211 0.77
212 0.78
213 0.72
214 0.65
215 0.61
216 0.58
217 0.5
218 0.44
219 0.39
220 0.33
221 0.37
222 0.37
223 0.33
224 0.36
225 0.4
226 0.44
227 0.52
228 0.62
229 0.63
230 0.69
231 0.75
232 0.79
233 0.78
234 0.8
235 0.79
236 0.75
237 0.71
238 0.66
239 0.64
240 0.61
241 0.65
242 0.66
243 0.66
244 0.68
245 0.68
246 0.69
247 0.7
248 0.73
249 0.73
250 0.72
251 0.72
252 0.72
253 0.74
254 0.75
255 0.78
256 0.78
257 0.77
258 0.76
259 0.78
260 0.79
261 0.78
262 0.81
263 0.78
264 0.76
265 0.76
266 0.75
267 0.72
268 0.71
269 0.72
270 0.68
271 0.69
272 0.63
273 0.6
274 0.57
275 0.54
276 0.53
277 0.51
278 0.52
279 0.48
280 0.47
281 0.47
282 0.44
283 0.42
284 0.37
285 0.34
286 0.28
287 0.25
288 0.24
289 0.21
290 0.19
291 0.18
292 0.17
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.14
307 0.1
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.14
318 0.15
319 0.19
320 0.29
321 0.3
322 0.34
323 0.38
324 0.4
325 0.42
326 0.48
327 0.53
328 0.48
329 0.56
330 0.56
331 0.53
332 0.57
333 0.51
334 0.48
335 0.4
336 0.37
337 0.29
338 0.25
339 0.24
340 0.17
341 0.16
342 0.1
343 0.13
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.17
350 0.2
351 0.19
352 0.2
353 0.18
354 0.16
355 0.17
356 0.18
357 0.16
358 0.14
359 0.16
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.14
368 0.15
369 0.22
370 0.27
371 0.35
372 0.46
373 0.56
374 0.64
375 0.7
376 0.79
377 0.82
378 0.88
379 0.89
380 0.83
381 0.82
382 0.76
383 0.69
384 0.61
385 0.5
386 0.4
387 0.31
388 0.26
389 0.16
390 0.13
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.1
402 0.11
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.21
410 0.22
411 0.24
412 0.25
413 0.25
414 0.23
415 0.24
416 0.25
417 0.26
418 0.25
419 0.22
420 0.2
421 0.19
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.12