Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9M5Q0

Protein Details
Accession A0A0C9M5Q0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
580-599GFPLRAKVPKRQQQWIALRCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 18, E.R. 6, mito 1, extr 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR044843  Trans_IPPS_bact-type  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004311  F:farnesyltranstransferase activity  
GO:0016117  P:carotenoid biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
Amino Acid Sequences MTYMYYASAVLLVTFSIYQPFITKLDKAKYGALGGASLISPFVIDYYNRATITNIQQQHHHQNMTSILHLTHTNASNMSVPSVTSPQSLFSDAAVLFMLTAFIVSVCGMFTRWHFPITFIKPNASSLVSGFVRHGLSILIILMAITSQYASLQSASFALTTIGLLWYIAGPYFVRRAKVIAAVSVISTLVCFFICCTAYNHSKLYAASILDCTLFVLVLVLSCNAIDYLDTILNTYPHLVQKDKSKQAALQNQASFAYWMAVAQLVANLPNESDLTASPIDDFETAIRALGSASRSWKTMAALFPVNLRQDLCLLYAFFRTADDLVDDAPTPKQCEQNLITIRRFLREVFFLTQANKQRYQQQDLTLPGHINWNYYATLLPNEDVLAIFRNFARISHYLCPRAMSELTDAWEQDLRGEPVKKQKDLLNYAALVSGTFGELCTCAIMYKMGRGNWGKQKNNKARNEDVLSRARATGQCLQLINIARDVIADSLVGRCYVPLQYMPYPPQNMYHILKFARKPLLVGEQTLKSFSIRILGLADQISERAQKGIDGLPEEVQDSIRAAFEIYMAIGPTLVNDPGFPLRAKVPKRQQQWIALRCIYGFRGPVSRALSATFYEMVSIYSRAFTRLSNTRTTAARAAVVAAAVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.09
4 0.09
5 0.1
6 0.11
7 0.14
8 0.16
9 0.19
10 0.23
11 0.29
12 0.34
13 0.39
14 0.4
15 0.41
16 0.4
17 0.39
18 0.36
19 0.29
20 0.23
21 0.18
22 0.17
23 0.13
24 0.1
25 0.08
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.1
33 0.16
34 0.21
35 0.21
36 0.22
37 0.23
38 0.28
39 0.36
40 0.42
41 0.42
42 0.39
43 0.44
44 0.51
45 0.59
46 0.58
47 0.52
48 0.43
49 0.41
50 0.45
51 0.42
52 0.37
53 0.28
54 0.22
55 0.22
56 0.22
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.23
65 0.21
66 0.16
67 0.14
68 0.15
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.18
77 0.15
78 0.18
79 0.16
80 0.16
81 0.14
82 0.11
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.09
98 0.15
99 0.16
100 0.19
101 0.19
102 0.22
103 0.3
104 0.37
105 0.43
106 0.38
107 0.41
108 0.4
109 0.41
110 0.4
111 0.32
112 0.25
113 0.17
114 0.22
115 0.19
116 0.19
117 0.17
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.16
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.13
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.18
164 0.19
165 0.24
166 0.23
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.14
172 0.12
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.12
184 0.17
185 0.22
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.25
190 0.23
191 0.23
192 0.2
193 0.16
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.26
229 0.35
230 0.4
231 0.4
232 0.39
233 0.41
234 0.48
235 0.54
236 0.49
237 0.47
238 0.41
239 0.4
240 0.39
241 0.34
242 0.26
243 0.18
244 0.13
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.13
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.14
295 0.13
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.12
320 0.16
321 0.15
322 0.2
323 0.21
324 0.28
325 0.34
326 0.36
327 0.35
328 0.35
329 0.35
330 0.31
331 0.3
332 0.23
333 0.18
334 0.16
335 0.19
336 0.16
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.24
341 0.28
342 0.3
343 0.29
344 0.28
345 0.34
346 0.37
347 0.42
348 0.4
349 0.37
350 0.37
351 0.38
352 0.39
353 0.32
354 0.28
355 0.22
356 0.23
357 0.2
358 0.16
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.09
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.14
381 0.14
382 0.18
383 0.24
384 0.29
385 0.3
386 0.3
387 0.31
388 0.27
389 0.28
390 0.24
391 0.19
392 0.17
393 0.15
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.13
398 0.14
399 0.12
400 0.11
401 0.13
402 0.12
403 0.16
404 0.18
405 0.2
406 0.29
407 0.34
408 0.34
409 0.34
410 0.36
411 0.4
412 0.44
413 0.44
414 0.38
415 0.33
416 0.32
417 0.3
418 0.26
419 0.17
420 0.12
421 0.09
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.07
433 0.07
434 0.12
435 0.16
436 0.16
437 0.22
438 0.25
439 0.32
440 0.39
441 0.49
442 0.51
443 0.55
444 0.66
445 0.7
446 0.77
447 0.78
448 0.75
449 0.71
450 0.72
451 0.7
452 0.63
453 0.58
454 0.54
455 0.49
456 0.43
457 0.38
458 0.33
459 0.29
460 0.29
461 0.3
462 0.26
463 0.28
464 0.27
465 0.27
466 0.28
467 0.3
468 0.26
469 0.2
470 0.17
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.09
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.09
485 0.1
486 0.11
487 0.15
488 0.19
489 0.23
490 0.28
491 0.31
492 0.33
493 0.32
494 0.34
495 0.31
496 0.34
497 0.33
498 0.31
499 0.3
500 0.31
501 0.37
502 0.35
503 0.39
504 0.41
505 0.37
506 0.35
507 0.35
508 0.41
509 0.36
510 0.37
511 0.35
512 0.31
513 0.32
514 0.32
515 0.28
516 0.19
517 0.19
518 0.16
519 0.16
520 0.13
521 0.13
522 0.14
523 0.14
524 0.15
525 0.15
526 0.15
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.13
536 0.16
537 0.17
538 0.18
539 0.19
540 0.19
541 0.2
542 0.2
543 0.18
544 0.15
545 0.12
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.07
561 0.09
562 0.09
563 0.08
564 0.08
565 0.11
566 0.14
567 0.16
568 0.15
569 0.16
570 0.22
571 0.31
572 0.36
573 0.43
574 0.51
575 0.58
576 0.65
577 0.72
578 0.73
579 0.74
580 0.8
581 0.77
582 0.74
583 0.67
584 0.6
585 0.52
586 0.47
587 0.39
588 0.32
589 0.27
590 0.22
591 0.26
592 0.26
593 0.32
594 0.33
595 0.32
596 0.29
597 0.29
598 0.29
599 0.24
600 0.26
601 0.21
602 0.16
603 0.15
604 0.15
605 0.14
606 0.14
607 0.15
608 0.12
609 0.14
610 0.15
611 0.16
612 0.17
613 0.17
614 0.22
615 0.3
616 0.33
617 0.37
618 0.4
619 0.43
620 0.44
621 0.48
622 0.45
623 0.37
624 0.35
625 0.28
626 0.26
627 0.22