Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9MDD3

Protein Details
Accession A0A0C9MDD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-151FENQPTIKRRPRSCSKPEKTTTFLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR011513  Nse1  
IPR014857  Nse1_RING_C4HC3-type  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PF07574  SMC_Nse1  
PF08746  zf-RING-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
cd16493  RING-CH-C4HC3_NSE1  
Amino Acid Sequences MHKPYPTSTSATRRRTHLKPSQVAVLQETFVTNTLPDAAVRSQLAHELDITERTVQIWFQNRRAKARKLEASSGGSMSSLVPNVRTGWIDLPKPTQQHHHHHHHSHQSDHPSSDQSSPFHSLMTTDTFENQPTIKRRPRSCSKPEKTTTFLLSTPPQRAMSEGMGRVETNQDAKPIVSFPVQGIRIGTWARFARQISSNEWDLFCFSDPTVRQLIWQVQDGGHQFRIEVDFENIQQIRLGQIQNDIGQLDIDVQPKSIISFSMRRSGIDQDWVRCNDFTENQQASSFEAGSHALQGSHDNLRQSLLELISQAPDLAAKLVIIPDNNYLCRDLTISPSATPEPSFSNMNPVAAASAAAAAAASWLVDPAKIPWNPYPQQQQYQQQQQEQQQYQQQPSSYDASFSWPHWNMLQQQQQDPNHSEQHLLTNQQHDPTCVDMNSFFPRDMIRTSLVRAIENPLLFPSFEAMSQFNDSHRLFMQSMLSKKMVTEQEAMDIYAKVCNVTSKPADVEFPSFVSVLNKELDKLDYSLRLSRNEQDGVMHVIMVNTNQDTATELATQFTAIEMAFIRELFDLIINADDEDFGVSATTALHLGGKMTPKLASRDVQTLLDKLVEDGWIGEQKGNYFLTTRSVAELQDYFKQLYGESILECIFCLDMVTMGEHCANAQCSVRLHKHCADSQFNNSADPRCPSCSSRWSRGNTFGLGLPDDEEDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.7
3 0.72
4 0.71
5 0.72
6 0.71
7 0.7
8 0.71
9 0.66
10 0.61
11 0.55
12 0.47
13 0.37
14 0.3
15 0.27
16 0.19
17 0.16
18 0.15
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.13
25 0.13
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.21
31 0.22
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.19
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.14
43 0.19
44 0.27
45 0.31
46 0.39
47 0.47
48 0.51
49 0.61
50 0.68
51 0.7
52 0.7
53 0.74
54 0.75
55 0.73
56 0.75
57 0.7
58 0.67
59 0.6
60 0.51
61 0.41
62 0.31
63 0.25
64 0.2
65 0.16
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.21
75 0.26
76 0.27
77 0.29
78 0.33
79 0.36
80 0.39
81 0.39
82 0.43
83 0.46
84 0.53
85 0.6
86 0.65
87 0.69
88 0.73
89 0.78
90 0.79
91 0.75
92 0.7
93 0.67
94 0.65
95 0.59
96 0.55
97 0.49
98 0.42
99 0.4
100 0.4
101 0.37
102 0.29
103 0.3
104 0.33
105 0.31
106 0.27
107 0.25
108 0.2
109 0.19
110 0.22
111 0.19
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.18
118 0.21
119 0.26
120 0.35
121 0.41
122 0.49
123 0.55
124 0.63
125 0.73
126 0.76
127 0.8
128 0.82
129 0.82
130 0.83
131 0.84
132 0.8
133 0.74
134 0.69
135 0.62
136 0.54
137 0.46
138 0.4
139 0.38
140 0.37
141 0.36
142 0.34
143 0.32
144 0.29
145 0.29
146 0.29
147 0.27
148 0.28
149 0.26
150 0.24
151 0.23
152 0.23
153 0.22
154 0.21
155 0.18
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.16
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.18
178 0.22
179 0.22
180 0.23
181 0.29
182 0.31
183 0.3
184 0.33
185 0.34
186 0.32
187 0.32
188 0.27
189 0.22
190 0.21
191 0.17
192 0.14
193 0.11
194 0.15
195 0.15
196 0.18
197 0.2
198 0.18
199 0.18
200 0.21
201 0.26
202 0.22
203 0.23
204 0.21
205 0.19
206 0.23
207 0.24
208 0.23
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.19
220 0.18
221 0.16
222 0.16
223 0.14
224 0.14
225 0.16
226 0.16
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.07
246 0.09
247 0.15
248 0.17
249 0.24
250 0.25
251 0.25
252 0.27
253 0.3
254 0.27
255 0.3
256 0.31
257 0.26
258 0.31
259 0.33
260 0.32
261 0.28
262 0.28
263 0.23
264 0.22
265 0.21
266 0.25
267 0.24
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.2
272 0.2
273 0.17
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.09
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.12
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.14
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.02
352 0.03
353 0.03
354 0.05
355 0.11
356 0.12
357 0.15
358 0.18
359 0.26
360 0.27
361 0.32
362 0.39
363 0.36
364 0.41
365 0.43
366 0.47
367 0.47
368 0.55
369 0.54
370 0.49
371 0.5
372 0.51
373 0.54
374 0.47
375 0.44
376 0.41
377 0.4
378 0.39
379 0.36
380 0.31
381 0.24
382 0.25
383 0.26
384 0.19
385 0.17
386 0.16
387 0.18
388 0.18
389 0.18
390 0.22
391 0.19
392 0.2
393 0.19
394 0.22
395 0.21
396 0.28
397 0.33
398 0.29
399 0.31
400 0.38
401 0.39
402 0.4
403 0.4
404 0.35
405 0.32
406 0.3
407 0.28
408 0.21
409 0.25
410 0.23
411 0.23
412 0.21
413 0.23
414 0.23
415 0.26
416 0.25
417 0.21
418 0.2
419 0.2
420 0.2
421 0.15
422 0.15
423 0.12
424 0.14
425 0.17
426 0.17
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.15
431 0.16
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.19
437 0.19
438 0.18
439 0.17
440 0.19
441 0.19
442 0.18
443 0.17
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.1
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.18
458 0.18
459 0.19
460 0.19
461 0.2
462 0.18
463 0.19
464 0.24
465 0.22
466 0.24
467 0.26
468 0.26
469 0.22
470 0.22
471 0.27
472 0.24
473 0.22
474 0.23
475 0.2
476 0.23
477 0.23
478 0.23
479 0.18
480 0.16
481 0.13
482 0.12
483 0.11
484 0.08
485 0.08
486 0.1
487 0.1
488 0.15
489 0.16
490 0.16
491 0.18
492 0.18
493 0.2
494 0.19
495 0.21
496 0.17
497 0.17
498 0.16
499 0.14
500 0.14
501 0.14
502 0.13
503 0.12
504 0.13
505 0.12
506 0.12
507 0.13
508 0.14
509 0.14
510 0.15
511 0.15
512 0.17
513 0.19
514 0.24
515 0.26
516 0.28
517 0.29
518 0.32
519 0.35
520 0.33
521 0.31
522 0.26
523 0.25
524 0.26
525 0.23
526 0.18
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.09
545 0.08
546 0.07
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.07
579 0.1
580 0.14
581 0.14
582 0.15
583 0.18
584 0.2
585 0.25
586 0.28
587 0.28
588 0.27
589 0.32
590 0.33
591 0.34
592 0.33
593 0.3
594 0.27
595 0.25
596 0.21
597 0.17
598 0.15
599 0.12
600 0.1
601 0.09
602 0.11
603 0.13
604 0.14
605 0.15
606 0.15
607 0.16
608 0.19
609 0.19
610 0.17
611 0.15
612 0.15
613 0.18
614 0.2
615 0.2
616 0.2
617 0.2
618 0.2
619 0.22
620 0.23
621 0.22
622 0.25
623 0.26
624 0.24
625 0.24
626 0.24
627 0.21
628 0.21
629 0.2
630 0.16
631 0.14
632 0.15
633 0.14
634 0.13
635 0.13
636 0.11
637 0.09
638 0.07
639 0.07
640 0.06
641 0.07
642 0.07
643 0.09
644 0.09
645 0.1
646 0.11
647 0.1
648 0.1
649 0.13
650 0.14
651 0.14
652 0.16
653 0.18
654 0.21
655 0.29
656 0.37
657 0.4
658 0.45
659 0.49
660 0.54
661 0.57
662 0.61
663 0.62
664 0.58
665 0.6
666 0.61
667 0.55
668 0.52
669 0.5
670 0.46
671 0.41
672 0.41
673 0.37
674 0.36
675 0.39
676 0.39
677 0.43
678 0.51
679 0.55
680 0.6
681 0.64
682 0.65
683 0.67
684 0.72
685 0.7
686 0.61
687 0.55
688 0.48
689 0.43
690 0.37
691 0.31
692 0.23