Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9MDR4

Protein Details
Accession A0A0C9MDR4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
586-616NGAQNHQQQQQQRKKPKARNANKRGNRGGSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
598-614RKKPKARNANKRGNRGG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPLAITTTQQLPVALDQFNQGIQSVDDYQKYLSLLKHTDDLKPNTFDPLFKTVDGVVLKSIGESQEFGKVMKQIVDIACNSWNEDLIKALLKTMDHLPLDLDVLIKNSLGYGVKNIKKSGIEKNSAEIIELTNTLIEKWKVLQKKTSLNANGKRISPDRASSTSPPSSTEPPVRKQIKLAIQKEPPTRPKAMADPNFLLSLRESKKYPNTRPIYSVDTILEGFGNKPGKITTENSLKRPEPSSTTAETDSSKRKRVRFKDNLVEIREYEKNPEEWTSFDTTGTNVEHQYGNAHDLDVKEGQIAFMHVPQIAWYNPPELQFDESPSSTLVVRTHIQTDEVLAQDGREKLALAAIYTSPQHIPPSPTEPDETPSPNVDGSVPIIPLYDTELVPVDTVPLSLSPPVSIPPPPQTSSLMAPSALQPSLMTPANLNAAAAAIAAMKDTSSFMIPQQSQVQAQQPQYTNPALPASPPVAPQAHYYNQPHTAALQNNAQPTSIGSFGQQKISNQNVNEMLERNPSILQTLKELSFLAAGDMAKNANNAVPQQQILAQPQAVYSPVQPYHPYQHPLPSNTQQFQQNDWNRNNNNGAQNHQQQQQQRKKPKARNANKRGNRGGSHGQGRNTRVCSFYNSPDGCRNGDSCGFLHEHLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.14
8 0.11
9 0.11
10 0.14
11 0.17
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.23
19 0.21
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.33
24 0.33
25 0.4
26 0.45
27 0.48
28 0.48
29 0.48
30 0.47
31 0.48
32 0.47
33 0.41
34 0.37
35 0.37
36 0.34
37 0.3
38 0.31
39 0.24
40 0.28
41 0.27
42 0.23
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.14
47 0.16
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.21
57 0.22
58 0.23
59 0.23
60 0.21
61 0.22
62 0.26
63 0.24
64 0.23
65 0.25
66 0.23
67 0.24
68 0.19
69 0.2
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.14
74 0.17
75 0.15
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.23
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.19
86 0.2
87 0.17
88 0.14
89 0.08
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.15
99 0.23
100 0.28
101 0.32
102 0.33
103 0.34
104 0.38
105 0.41
106 0.46
107 0.45
108 0.47
109 0.44
110 0.47
111 0.48
112 0.44
113 0.4
114 0.3
115 0.22
116 0.17
117 0.17
118 0.13
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.22
127 0.28
128 0.31
129 0.38
130 0.4
131 0.49
132 0.53
133 0.58
134 0.59
135 0.62
136 0.66
137 0.67
138 0.65
139 0.57
140 0.58
141 0.51
142 0.48
143 0.42
144 0.39
145 0.37
146 0.36
147 0.4
148 0.38
149 0.42
150 0.4
151 0.37
152 0.36
153 0.34
154 0.35
155 0.35
156 0.4
157 0.39
158 0.4
159 0.5
160 0.5
161 0.47
162 0.46
163 0.49
164 0.5
165 0.54
166 0.54
167 0.52
168 0.54
169 0.61
170 0.64
171 0.65
172 0.62
173 0.57
174 0.56
175 0.5
176 0.48
177 0.48
178 0.51
179 0.49
180 0.48
181 0.45
182 0.44
183 0.42
184 0.39
185 0.32
186 0.22
187 0.25
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.26
192 0.35
193 0.44
194 0.5
195 0.52
196 0.55
197 0.55
198 0.58
199 0.56
200 0.53
201 0.44
202 0.39
203 0.29
204 0.25
205 0.22
206 0.18
207 0.15
208 0.09
209 0.08
210 0.11
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.17
217 0.19
218 0.21
219 0.29
220 0.33
221 0.35
222 0.41
223 0.4
224 0.39
225 0.39
226 0.35
227 0.3
228 0.31
229 0.33
230 0.3
231 0.31
232 0.29
233 0.28
234 0.27
235 0.26
236 0.31
237 0.31
238 0.36
239 0.39
240 0.45
241 0.54
242 0.6
243 0.68
244 0.68
245 0.73
246 0.75
247 0.78
248 0.77
249 0.7
250 0.63
251 0.53
252 0.47
253 0.42
254 0.32
255 0.27
256 0.23
257 0.2
258 0.2
259 0.21
260 0.18
261 0.16
262 0.18
263 0.19
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.14
268 0.16
269 0.15
270 0.13
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.09
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.1
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.12
348 0.14
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.22
353 0.21
354 0.22
355 0.23
356 0.23
357 0.19
358 0.18
359 0.18
360 0.16
361 0.15
362 0.13
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.1
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.17
394 0.21
395 0.22
396 0.24
397 0.26
398 0.26
399 0.27
400 0.27
401 0.22
402 0.18
403 0.17
404 0.16
405 0.16
406 0.13
407 0.11
408 0.08
409 0.09
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.1
415 0.12
416 0.12
417 0.11
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.14
435 0.15
436 0.17
437 0.2
438 0.21
439 0.21
440 0.24
441 0.28
442 0.27
443 0.29
444 0.32
445 0.3
446 0.29
447 0.32
448 0.31
449 0.26
450 0.22
451 0.22
452 0.16
453 0.15
454 0.16
455 0.15
456 0.14
457 0.15
458 0.17
459 0.16
460 0.17
461 0.2
462 0.23
463 0.23
464 0.28
465 0.3
466 0.31
467 0.35
468 0.34
469 0.31
470 0.28
471 0.3
472 0.27
473 0.27
474 0.29
475 0.27
476 0.29
477 0.29
478 0.27
479 0.21
480 0.2
481 0.19
482 0.15
483 0.12
484 0.11
485 0.18
486 0.19
487 0.25
488 0.26
489 0.25
490 0.31
491 0.37
492 0.4
493 0.33
494 0.37
495 0.34
496 0.34
497 0.34
498 0.29
499 0.24
500 0.24
501 0.24
502 0.21
503 0.18
504 0.17
505 0.17
506 0.18
507 0.17
508 0.17
509 0.2
510 0.19
511 0.19
512 0.19
513 0.17
514 0.15
515 0.14
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.09
526 0.11
527 0.12
528 0.15
529 0.16
530 0.16
531 0.16
532 0.19
533 0.21
534 0.23
535 0.24
536 0.21
537 0.19
538 0.19
539 0.19
540 0.17
541 0.14
542 0.13
543 0.17
544 0.17
545 0.2
546 0.22
547 0.26
548 0.32
549 0.38
550 0.41
551 0.36
552 0.44
553 0.48
554 0.49
555 0.53
556 0.54
557 0.55
558 0.53
559 0.56
560 0.54
561 0.5
562 0.51
563 0.54
564 0.54
565 0.54
566 0.58
567 0.63
568 0.58
569 0.62
570 0.62
571 0.58
572 0.58
573 0.52
574 0.51
575 0.5
576 0.55
577 0.56
578 0.56
579 0.55
580 0.54
581 0.63
582 0.68
583 0.7
584 0.73
585 0.78
586 0.83
587 0.88
588 0.91
589 0.91
590 0.91
591 0.92
592 0.92
593 0.93
594 0.91
595 0.91
596 0.89
597 0.85
598 0.77
599 0.73
600 0.71
601 0.68
602 0.68
603 0.64
604 0.61
605 0.6
606 0.62
607 0.62
608 0.58
609 0.52
610 0.45
611 0.42
612 0.44
613 0.43
614 0.44
615 0.47
616 0.45
617 0.47
618 0.51
619 0.53
620 0.47
621 0.44
622 0.39
623 0.35
624 0.36
625 0.34
626 0.27
627 0.29
628 0.28