Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9N3I1

Protein Details
Accession A0A0C9N3I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-78LSSVVSQLQQQRKRRRLLKDTAIIQRGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
PS50234  VWFA  
CDD cd01453  vWA_transcription_factor_IIH_type  
Amino Acid Sequences MASRKPADEDYIDIDDTYDANQDDDAGNGGYAWEEEYKRSWDILQEDSEGRLSSVVSQLQQQRKRRRLLKDTAIIQRGIIRHLFLVIDLSEAMNEKDLRPSRVELTLTYAQQFVIEYFDQNPISQLGIIVTRDGIAEKLTELSGNPTDHIKALKSKKNTETSGEPSLQNSLQLARASMLGVPSHGSKEVLLVFGSLTTCDPSDIHETIDLLKKEMVRVNIVGLAAEVQICRLLCESTKGTYGVVLNEAHYKDLLFEVVPPPAVLPNKNTSNLVTMGFPRRLIEDHPSFCVCHSKLTVGGYICPRCKSKVCELPSDCDICGLTLVSSPHLARSYHHLFPVDNFDEIKPNSGREAHCFSCLAEFSDKTDTADTLPPELLRKVVSLVPCQDLTSLRLTCMYMRTFCDQPVVWKSIDLKPSSERELWKLTELKKTIDLHLSHILSIRIWGVRDNVVQYLLNQCRNLQHLTICGWTTLSDHCLRLLPAQSLKIKTLELIGSSQQTNFVSVDAYTLGNLLLHSPEMTNLVLGCEIHIHAETFITELEKKPSISSDLQSFMLASRKTWLNEHVLRLINIYPEIQKIYLVPKASIEFDPVEKNNVDALLHEKLKQIMNIVPLPLEIPVLSNEEFIIYDKRFTTCV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.2
3 0.19
4 0.16
5 0.14
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.09
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.08
20 0.11
21 0.12
22 0.14
23 0.18
24 0.22
25 0.23
26 0.24
27 0.24
28 0.25
29 0.28
30 0.3
31 0.29
32 0.3
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.24
37 0.2
38 0.16
39 0.14
40 0.12
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.22
45 0.3
46 0.4
47 0.48
48 0.56
49 0.63
50 0.69
51 0.78
52 0.8
53 0.82
54 0.82
55 0.84
56 0.84
57 0.82
58 0.82
59 0.8
60 0.75
61 0.65
62 0.55
63 0.5
64 0.4
65 0.35
66 0.28
67 0.2
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.12
72 0.13
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.2
84 0.24
85 0.27
86 0.29
87 0.32
88 0.32
89 0.36
90 0.36
91 0.28
92 0.32
93 0.34
94 0.31
95 0.3
96 0.27
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.17
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.14
110 0.15
111 0.13
112 0.12
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.12
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.2
137 0.18
138 0.23
139 0.31
140 0.38
141 0.43
142 0.5
143 0.56
144 0.62
145 0.62
146 0.59
147 0.56
148 0.54
149 0.54
150 0.48
151 0.41
152 0.34
153 0.35
154 0.3
155 0.24
156 0.19
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.23
196 0.2
197 0.16
198 0.18
199 0.17
200 0.2
201 0.23
202 0.21
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.14
209 0.1
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.04
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.12
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.05
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.18
253 0.21
254 0.23
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.2
260 0.15
261 0.15
262 0.18
263 0.18
264 0.18
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.21
270 0.22
271 0.23
272 0.25
273 0.25
274 0.24
275 0.24
276 0.28
277 0.21
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.2
284 0.14
285 0.17
286 0.19
287 0.22
288 0.23
289 0.23
290 0.23
291 0.23
292 0.27
293 0.29
294 0.33
295 0.38
296 0.4
297 0.47
298 0.47
299 0.48
300 0.47
301 0.43
302 0.34
303 0.26
304 0.23
305 0.13
306 0.12
307 0.08
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.09
318 0.17
319 0.22
320 0.22
321 0.24
322 0.23
323 0.21
324 0.22
325 0.29
326 0.23
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.19
331 0.19
332 0.22
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.19
337 0.19
338 0.2
339 0.25
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.22
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.17
351 0.17
352 0.15
353 0.16
354 0.14
355 0.14
356 0.17
357 0.15
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.13
369 0.14
370 0.16
371 0.18
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.15
376 0.15
377 0.18
378 0.15
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.15
383 0.18
384 0.18
385 0.14
386 0.17
387 0.21
388 0.2
389 0.2
390 0.23
391 0.19
392 0.22
393 0.25
394 0.25
395 0.21
396 0.22
397 0.26
398 0.27
399 0.32
400 0.28
401 0.26
402 0.27
403 0.3
404 0.33
405 0.33
406 0.29
407 0.28
408 0.32
409 0.31
410 0.31
411 0.34
412 0.33
413 0.37
414 0.37
415 0.35
416 0.36
417 0.37
418 0.35
419 0.36
420 0.34
421 0.3
422 0.35
423 0.33
424 0.27
425 0.27
426 0.25
427 0.18
428 0.18
429 0.15
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.14
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.22
442 0.23
443 0.25
444 0.24
445 0.25
446 0.26
447 0.29
448 0.3
449 0.23
450 0.2
451 0.19
452 0.21
453 0.22
454 0.2
455 0.17
456 0.15
457 0.13
458 0.13
459 0.12
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.16
464 0.17
465 0.17
466 0.2
467 0.21
468 0.21
469 0.21
470 0.26
471 0.3
472 0.31
473 0.32
474 0.3
475 0.27
476 0.23
477 0.23
478 0.19
479 0.15
480 0.15
481 0.15
482 0.17
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.16
487 0.17
488 0.15
489 0.13
490 0.11
491 0.1
492 0.11
493 0.09
494 0.09
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.11
526 0.12
527 0.17
528 0.19
529 0.19
530 0.2
531 0.22
532 0.25
533 0.27
534 0.28
535 0.28
536 0.29
537 0.29
538 0.28
539 0.26
540 0.22
541 0.25
542 0.22
543 0.18
544 0.2
545 0.24
546 0.26
547 0.28
548 0.31
549 0.33
550 0.38
551 0.42
552 0.43
553 0.41
554 0.4
555 0.39
556 0.36
557 0.29
558 0.25
559 0.23
560 0.18
561 0.18
562 0.2
563 0.18
564 0.17
565 0.17
566 0.21
567 0.23
568 0.23
569 0.21
570 0.22
571 0.24
572 0.27
573 0.26
574 0.25
575 0.22
576 0.23
577 0.3
578 0.28
579 0.3
580 0.27
581 0.27
582 0.25
583 0.24
584 0.21
585 0.16
586 0.19
587 0.22
588 0.24
589 0.24
590 0.25
591 0.28
592 0.31
593 0.31
594 0.3
595 0.26
596 0.3
597 0.31
598 0.29
599 0.26
600 0.23
601 0.22
602 0.19
603 0.16
604 0.1
605 0.09
606 0.1
607 0.14
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.15
614 0.2
615 0.17
616 0.2
617 0.21