FuNGI

A0A0C9MQS8

Protein Details

Accession

A0A0C9MQS8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-62	RTNAPPSFDKQPEKKRRSLFAERLAST	Hydrophilic
169-188	PKPVHRSEFKKRLEAQRNKT	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 12, nucl 7.5, cyto_nucl 6, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSKFTRPTFNVDDDDLERLQKEFFEKETMPSARVYRTNAPPSFDKQPEKKRRSLFAERLASTNDSSSSSSNPVEASMPDLEMPLLEEATPALESTRTVVEDEQEDEYEPVMDPHPEPHVPVSKKMIDLTSLLGQVLGEIKEHDVKQVVAPTLPSVVENKPARGQANGFPKPVHRSEFKKRLEAQRNKTASGSAKTPRPEAPPQVMSEEPVDENDRRIQEMSQQELEDARQEIMSTLSPESIALLMKGLKNKGSSASAAATKEKKKVSFEEPQANAMVMDDDKEDLLQIKKEYFANVPMENEKLAWMDNRFLTPEIRKQEAQRLKELAEENNESQASEAEKVYRRVRFDLRGRIIDQTLDIPRHKGLHHHGDEPDKAGYTLAELFYLVRSQVPSQRSMVLTTLARIITLAKKAAPTEPVWNHVLSVFTGKEHAATIYLRSALDDRNLIVLVSAIKALAALVLDDYQIWETSLIDATEEFNKFLGHIARPTLPPGVTEIKRKGLNDKLTELVDRVRQTSGQPSLKEQQDDAELAERDLVRGLVKMDLLARIRYLLASDSSELIQYDAASVDRLVRIVVRMAEAGQDVCEVIEEEELLEPIVHWGVANTQWPMTEDDDAAVAHTNYPSLAAVRLLTVLAQGSKQIAENIVEKATITLRFLVTSPDTACDSLKRRAYALQLETLKLVRVLASYGFIVPTLEDLQGPLMGWLRSVLGDDANDMNCTIASTAIGLLEVLLYAAADPHKTVPAHAIDWHQPTAYLPAVTAVLRSSRDRHQSLYESALGYLGTWASHIALFPPELETIRQVWKTVIQEDNNFQSGNSVALGYTTSTHHVLRYLQFVAAFTRLNAQHTLYRDMVQDAQCRLRSAQVVHLLKECYAKDMLGRYALYIWLDQCKESEKCWGMSLRLAELESGIRSKHIGISETWLAQELLHLCLSSKQQQQALGDLEPFYLDFDQQHVGISKALFDHDGRPIKTLMYTSQGESESNSLETTAFILSPIDALYHLDKSKVAQKSRADAASIVSSTIELANKLFYTSDINHDVAIITLMKIFLIGDREGRQADMMSEREIFRDDRVSQNMDQWLNYLCRTKTNLAALENAWRRSSEHIRQAQVPFFQFYQGFVAQYAAVSFGHHGFARLLVYLVTQIDIIDYRHLVLSDYRDILATLKVGVNQVPQLTITEKQELDNAGLKLLDSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.34
3	0.29
4	0.24
5	0.21
6	0.2
7	0.18
8	0.2
9	0.19
10	0.21
11	0.27
12	0.27
13	0.3
14	0.38
15	0.38
16	0.35
17	0.35
18	0.36
19	0.35
20	0.38
21	0.41
22	0.41
23	0.48
24	0.57
25	0.56
26	0.57
27	0.56
28	0.57
29	0.6
30	0.59
31	0.6
32	0.6
33	0.69
34	0.75
35	0.78
36	0.81
37	0.79
38	0.81
39	0.81
40	0.82
41	0.8
42	0.79
43	0.8
44	0.73
45	0.67
46	0.62
47	0.55
48	0.45
49	0.37
50	0.28
51	0.22
52	0.22
53	0.21
54	0.21
55	0.22
56	0.22
57	0.21
58	0.2
59	0.18
60	0.18
61	0.17
62	0.18
63	0.15
64	0.15
65	0.14
66	0.14
67	0.13
68	0.11
69	0.13
70	0.09
71	0.09
72	0.08
73	0.07
74	0.07
75	0.09
76	0.09
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.1
82	0.12
83	0.12
84	0.13
85	0.14
86	0.16
87	0.18
88	0.2
89	0.2
90	0.18
91	0.18
92	0.17
93	0.17
94	0.15
95	0.13
96	0.12
97	0.11
98	0.13
99	0.12
100	0.14
101	0.19
102	0.19
103	0.21
104	0.25
105	0.34
106	0.34
107	0.38
108	0.43
109	0.41
110	0.43
111	0.43
112	0.38
113	0.3
114	0.29
115	0.28
116	0.24
117	0.21
118	0.19
119	0.17
120	0.15
121	0.14
122	0.16
123	0.12
124	0.09
125	0.09
126	0.12
127	0.17
128	0.18
129	0.19
130	0.18
131	0.19
132	0.21
133	0.26
134	0.25
135	0.21
136	0.21
137	0.2
138	0.2
139	0.19
140	0.17
141	0.15
142	0.15
143	0.23
144	0.25
145	0.27
146	0.29
147	0.33
148	0.33
149	0.33
150	0.35
151	0.33
152	0.42
153	0.43
154	0.41
155	0.38
156	0.41
157	0.45
158	0.46
159	0.44
160	0.4
161	0.44
162	0.53
163	0.62
164	0.63
165	0.65
166	0.68
167	0.74
168	0.78
169	0.8
170	0.78
171	0.78
172	0.77
173	0.69
174	0.63
175	0.56
176	0.51
177	0.44
178	0.42
179	0.37
180	0.39
181	0.4
182	0.43
183	0.43
184	0.43
185	0.47
186	0.47
187	0.49
188	0.47
189	0.46
190	0.47
191	0.43
192	0.38
193	0.33
194	0.28
195	0.21
196	0.19
197	0.22
198	0.18
199	0.2
200	0.24
201	0.23
202	0.23
203	0.24
204	0.22
205	0.26
206	0.31
207	0.34
208	0.31
209	0.3
210	0.29
211	0.29
212	0.29
213	0.24
214	0.19
215	0.14
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.07
230	0.07
231	0.1
232	0.12
233	0.17
234	0.17
235	0.19
236	0.2
237	0.22
238	0.23
239	0.23
240	0.22
241	0.2
242	0.22
243	0.23
244	0.23
245	0.28
246	0.31
247	0.33
248	0.38
249	0.4
250	0.41
251	0.41
252	0.45
253	0.47
254	0.5
255	0.54
256	0.57
257	0.54
258	0.52
259	0.48
260	0.43
261	0.35
262	0.26
263	0.2
264	0.1
265	0.09
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.11
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.17
277	0.18
278	0.2
279	0.19
280	0.22
281	0.23
282	0.23
283	0.25
284	0.24
285	0.24
286	0.22
287	0.2
288	0.16
289	0.12
290	0.12
291	0.13
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.16
296	0.17
297	0.18
298	0.21
299	0.22
300	0.28
301	0.29
302	0.32
303	0.34
304	0.35
305	0.45
306	0.49
307	0.48
308	0.46
309	0.44
310	0.4
311	0.44
312	0.43
313	0.35
314	0.33
315	0.34
316	0.28
317	0.3
318	0.29
319	0.23
320	0.21
321	0.19
322	0.16
323	0.14
324	0.13
325	0.14
326	0.18
327	0.24
328	0.29
329	0.32
330	0.33
331	0.36
332	0.41
333	0.45
334	0.49
335	0.54
336	0.54
337	0.54
338	0.53
339	0.5
340	0.45
341	0.37
342	0.3
343	0.24
344	0.22
345	0.21
346	0.21
347	0.2
348	0.2
349	0.22
350	0.22
351	0.24
352	0.27
353	0.34
354	0.37
355	0.39
356	0.41
357	0.43
358	0.44
359	0.4
360	0.34
361	0.24
362	0.21
363	0.16
364	0.13
365	0.1
366	0.11
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.09
377	0.15
378	0.17
379	0.19
380	0.2
381	0.23
382	0.23
383	0.23
384	0.22
385	0.19
386	0.17
387	0.16
388	0.17
389	0.13
390	0.12
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.14
395	0.14
396	0.12
397	0.14
398	0.15
399	0.17
400	0.18
401	0.16
402	0.23
403	0.24
404	0.26
405	0.27
406	0.26
407	0.24
408	0.22
409	0.21
410	0.12
411	0.14
412	0.1
413	0.09
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.11
428	0.12
429	0.11
430	0.1
431	0.1
432	0.11
433	0.1
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.1
463	0.11
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.12
469	0.13
470	0.11
471	0.12
472	0.14
473	0.16
474	0.16
475	0.18
476	0.17
477	0.15
478	0.14
479	0.16
480	0.21
481	0.21
482	0.26
483	0.27
484	0.3
485	0.32
486	0.33
487	0.35
488	0.35
489	0.4
490	0.37
491	0.37
492	0.34
493	0.32
494	0.32
495	0.27
496	0.22
497	0.19
498	0.17
499	0.16
500	0.15
501	0.15
502	0.15
503	0.2
504	0.26
505	0.26
506	0.26
507	0.28
508	0.34
509	0.35
510	0.35
511	0.29
512	0.23
513	0.21
514	0.2
515	0.17
516	0.15
517	0.12
518	0.12
519	0.13
520	0.12
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.1
532	0.11
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.07
548	0.06
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.04
590	0.05
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.09
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.04
610	0.05
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.06
629	0.06
630	0.07
631	0.09
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.09
637	0.1
638	0.09
639	0.08
640	0.08
641	0.08
642	0.09
643	0.09
644	0.11
645	0.1
646	0.11
647	0.11
648	0.11
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.14
653	0.17
654	0.22
655	0.24
656	0.24
657	0.24
658	0.26
659	0.29
660	0.31
661	0.28
662	0.28
663	0.26
664	0.26
665	0.26
666	0.23
667	0.2
668	0.14
669	0.13
670	0.07
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.07
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.07
697	0.07
698	0.05
699	0.06
700	0.07
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.07
706	0.06
707	0.07
708	0.05
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.02
720	0.02
721	0.02
722	0.02
723	0.03
724	0.03
725	0.04
726	0.04
727	0.05
728	0.09
729	0.09
730	0.1
731	0.13
732	0.15
733	0.16
734	0.17
735	0.19
736	0.21
737	0.24
738	0.24
739	0.2
740	0.18
741	0.17
742	0.18
743	0.16
744	0.12
745	0.09
746	0.09
747	0.1
748	0.1
749	0.09
750	0.07
751	0.08
752	0.1
753	0.12
754	0.15
755	0.2
756	0.27
757	0.29
758	0.31
759	0.33
760	0.36
761	0.36
762	0.36
763	0.32
764	0.25
765	0.23
766	0.21
767	0.16
768	0.12
769	0.1
770	0.06
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.06
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.08
783	0.09
784	0.1
785	0.11
786	0.12
787	0.17
788	0.17
789	0.16
790	0.16
791	0.2
792	0.22
793	0.25
794	0.28
795	0.25
796	0.28
797	0.3
798	0.33
799	0.3
800	0.27
801	0.23
802	0.18
803	0.16
804	0.13
805	0.11
806	0.07
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.07
812	0.07
813	0.09
814	0.11
815	0.11
816	0.12
817	0.13
818	0.16
819	0.16
820	0.19
821	0.18
822	0.17
823	0.17
824	0.17
825	0.17
826	0.16
827	0.14
828	0.1
829	0.15
830	0.15
831	0.17
832	0.18
833	0.18
834	0.2
835	0.23
836	0.27
837	0.23
838	0.24
839	0.22
840	0.23
841	0.26
842	0.25
843	0.27
844	0.25
845	0.29
846	0.29
847	0.3
848	0.29
849	0.28
850	0.27
851	0.25
852	0.28
853	0.32
854	0.33
855	0.33
856	0.35
857	0.32
858	0.3
859	0.33
860	0.27
861	0.2
862	0.19
863	0.17
864	0.17
865	0.19
866	0.2
867	0.18
868	0.18
869	0.16
870	0.16
871	0.16
872	0.15
873	0.12
874	0.12
875	0.15
876	0.15
877	0.15
878	0.15
879	0.2
880	0.2
881	0.2
882	0.28
883	0.25
884	0.26
885	0.29
886	0.31
887	0.26
888	0.29
889	0.29
890	0.22
891	0.2
892	0.19
893	0.16
894	0.14
895	0.14
896	0.11
897	0.11
898	0.09
899	0.09
900	0.09
901	0.1
902	0.13
903	0.14
904	0.14
905	0.14
906	0.2
907	0.22
908	0.22
909	0.21
910	0.19
911	0.17
912	0.15
913	0.17
914	0.12
915	0.12
916	0.12
917	0.11
918	0.11
919	0.14
920	0.18
921	0.23
922	0.27
923	0.29
924	0.31
925	0.35
926	0.36
927	0.37
928	0.36
929	0.3
930	0.25
931	0.22
932	0.19
933	0.15
934	0.14
935	0.11
936	0.09
937	0.08
938	0.07
939	0.09
940	0.11
941	0.11
942	0.12
943	0.12
944	0.12
945	0.14
946	0.13
947	0.12
948	0.12
949	0.12
950	0.12
951	0.13
952	0.15
953	0.22
954	0.29
955	0.28
956	0.3
957	0.29
958	0.28
959	0.29
960	0.27
961	0.21
962	0.2
963	0.21
964	0.2
965	0.23
966	0.23
967	0.22
968	0.21
969	0.21
970	0.16
971	0.16
972	0.14
973	0.11
974	0.1
975	0.1
976	0.1
977	0.09
978	0.07
979	0.07
980	0.07
981	0.07
982	0.07
983	0.07
984	0.06
985	0.05
986	0.08
987	0.1
988	0.14
989	0.14
990	0.15
991	0.15
992	0.18
993	0.26
994	0.31
995	0.33
996	0.36
997	0.4
998	0.46
999	0.51
1000	0.5
1001	0.44
1002	0.36
1003	0.35
1004	0.32
1005	0.27
1006	0.21
1007	0.15
1008	0.13
1009	0.13
1010	0.14
1011	0.12
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.11
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.15
1020	0.16
1021	0.22
1022	0.24
1023	0.24
1024	0.23
1025	0.23
1026	0.22
1027	0.17
1028	0.16
1029	0.11
1030	0.07
1031	0.08
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.1
1038	0.11
1039	0.14
1040	0.17
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.21
1044	0.2
1045	0.17
1046	0.18
1047	0.19
1048	0.18
1049	0.18
1050	0.2
1051	0.2
1052	0.2
1053	0.22
1054	0.21
1055	0.19
1056	0.24
1057	0.24
1058	0.28
1059	0.33
1060	0.37
1061	0.35
1062	0.4
1063	0.44
1064	0.39
1065	0.36
1066	0.31
1067	0.3
1068	0.27
1069	0.29
1070	0.29
1071	0.23
1072	0.28
1073	0.33
1074	0.35
1075	0.38
1076	0.42
1077	0.44
1078	0.4
1079	0.43
1080	0.38
1081	0.42
1082	0.45
1083	0.41
1084	0.35
1085	0.31
1086	0.3
1087	0.35
1088	0.43
1089	0.43
1090	0.47
1091	0.52
1092	0.55
1093	0.61
1094	0.64
1095	0.62
1096	0.57
1097	0.51
1098	0.44
1099	0.37
1100	0.37
1101	0.3
1102	0.27
1103	0.28
1104	0.23
1105	0.22
1106	0.18
1107	0.19
1108	0.15
1109	0.15
1110	0.14
1111	0.1
1112	0.08
1113	0.09
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.13
1117	0.13
1118	0.14
1119	0.13
1120	0.15
1121	0.15
1122	0.14
1123	0.13
1124	0.1
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.09
1130	0.08
1131	0.09
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.12
1135	0.12
1136	0.13
1137	0.14
1138	0.14
1139	0.15
1140	0.17
1141	0.21
1142	0.23
1143	0.25
1144	0.24
1145	0.23
1146	0.23
1147	0.23
1148	0.21
1149	0.16
1150	0.13
1151	0.13
1152	0.15
1153	0.16
1154	0.18
1155	0.19
1156	0.21
1157	0.21
1158	0.19
1159	0.18
1160	0.19
1161	0.2
1162	0.23
1163	0.24
1164	0.27
1165	0.27
1166	0.27
1167	0.3
1168	0.29
1169	0.3
1170	0.32
1171	0.28
1172	0.23
1173	0.22

A0A0C9MQS8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer