Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9MHT7

Protein Details
Accession A0A0C9MHT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24QITKNNPTKDQRKSPASNINKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 3, mito 2, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006595  CTLH_C  
IPR006594  LisH  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR027078  snRNP-E  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50897  CTLH  
PS50896  LISH  
PS52002  SM  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd01718  Sm_E  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MQITKNNPTKDQRKSPASNINKEELVRLMLQSLQDLGYQKAADALEAESGYSLESKNIVELRSSILLGQWHKAESLLSQVPFVSSQTCIPKVQFLIRQQKFLELLEKQETMQALHVLRTEITPLGQNTERLHLLTSLILCSSVDDIKEQASWDGTKGTSREQLLTDIQKFIDPAAMIPKQRLFHLINQSLEWQKRNCLYHNPRQETKLSLYSDHYCDKASFPSTTIKTLNGHADEIWHVHYSNNGKYLASVSKDKTCIIWDMDTFSQIQKLTSDVSGSYCAWSPDDSKLLICGTDFSIRLWDPYHGILLHTYQYHKDQVTSCVWLPDNQHFISGACDKVLCLWDSEITLSQPITRWPVQRTTDMKMTPDGKRFVTIGLDKCITVYDVDGLRITEVVKIQEEGTITSLTLSKDGRYALVNVQDSQTLHLWDLEERIVVHKYSGQRQNTYIIRSTLGGHNEAFVISGSEDNRVYIWSRDHETLLETLEGHENTVNCVAWCPAEPMQFVSASDDHTIRVWGSSLDLTDDMELYLQNKSRVQIWLFDKSDLRIEGQIIGFDEFMNLVLDGAEEIDTKNNTRLKVGRLMLKGDNITLIQGVEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.81
4 0.82
5 0.81
6 0.75
7 0.71
8 0.64
9 0.58
10 0.51
11 0.43
12 0.36
13 0.28
14 0.23
15 0.2
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.16
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.19
28 0.18
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.13
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.2
49 0.21
50 0.21
51 0.17
52 0.16
53 0.21
54 0.21
55 0.24
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.2
60 0.18
61 0.14
62 0.19
63 0.21
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.14
71 0.11
72 0.15
73 0.21
74 0.24
75 0.24
76 0.25
77 0.29
78 0.3
79 0.35
80 0.37
81 0.41
82 0.49
83 0.49
84 0.54
85 0.49
86 0.51
87 0.46
88 0.41
89 0.38
90 0.28
91 0.31
92 0.31
93 0.31
94 0.26
95 0.27
96 0.26
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.16
101 0.17
102 0.18
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.15
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.13
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.21
115 0.25
116 0.25
117 0.21
118 0.22
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.15
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.13
141 0.12
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.22
149 0.25
150 0.26
151 0.31
152 0.29
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.22
157 0.19
158 0.17
159 0.11
160 0.1
161 0.15
162 0.18
163 0.18
164 0.2
165 0.24
166 0.22
167 0.23
168 0.28
169 0.24
170 0.28
171 0.38
172 0.4
173 0.37
174 0.37
175 0.4
176 0.4
177 0.4
178 0.36
179 0.28
180 0.27
181 0.32
182 0.34
183 0.34
184 0.39
185 0.45
186 0.51
187 0.6
188 0.63
189 0.6
190 0.6
191 0.58
192 0.51
193 0.47
194 0.44
195 0.35
196 0.3
197 0.31
198 0.31
199 0.33
200 0.3
201 0.27
202 0.21
203 0.2
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.22
210 0.23
211 0.25
212 0.25
213 0.23
214 0.22
215 0.24
216 0.27
217 0.21
218 0.2
219 0.17
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.13
228 0.16
229 0.17
230 0.19
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.2
235 0.19
236 0.18
237 0.2
238 0.19
239 0.22
240 0.24
241 0.24
242 0.22
243 0.2
244 0.2
245 0.18
246 0.17
247 0.13
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.15
302 0.14
303 0.16
304 0.16
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.2
312 0.21
313 0.21
314 0.23
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.13
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.13
341 0.16
342 0.19
343 0.21
344 0.28
345 0.3
346 0.37
347 0.39
348 0.38
349 0.41
350 0.39
351 0.37
352 0.34
353 0.37
354 0.34
355 0.36
356 0.34
357 0.28
358 0.29
359 0.28
360 0.24
361 0.24
362 0.24
363 0.21
364 0.22
365 0.22
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.15
370 0.11
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.13
401 0.12
402 0.14
403 0.15
404 0.2
405 0.21
406 0.2
407 0.21
408 0.21
409 0.2
410 0.21
411 0.19
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.13
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.14
426 0.18
427 0.27
428 0.34
429 0.36
430 0.37
431 0.39
432 0.46
433 0.45
434 0.45
435 0.4
436 0.33
437 0.3
438 0.28
439 0.29
440 0.26
441 0.24
442 0.22
443 0.19
444 0.18
445 0.17
446 0.16
447 0.14
448 0.09
449 0.08
450 0.06
451 0.09
452 0.09
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.13
459 0.13
460 0.16
461 0.18
462 0.22
463 0.24
464 0.24
465 0.24
466 0.24
467 0.22
468 0.2
469 0.17
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.16
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.15
478 0.17
479 0.16
480 0.12
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.13
485 0.16
486 0.17
487 0.2
488 0.2
489 0.22
490 0.23
491 0.22
492 0.21
493 0.22
494 0.18
495 0.18
496 0.19
497 0.17
498 0.16
499 0.16
500 0.17
501 0.13
502 0.13
503 0.11
504 0.09
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.12
518 0.14
519 0.17
520 0.19
521 0.2
522 0.23
523 0.29
524 0.29
525 0.33
526 0.36
527 0.43
528 0.42
529 0.45
530 0.43
531 0.39
532 0.43
533 0.36
534 0.32
535 0.25
536 0.24
537 0.25
538 0.23
539 0.23
540 0.19
541 0.19
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.09
546 0.1
547 0.09
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.06
556 0.07
557 0.11
558 0.13
559 0.15
560 0.22
561 0.25
562 0.26
563 0.32
564 0.36
565 0.37
566 0.45
567 0.48
568 0.5
569 0.49
570 0.54
571 0.51
572 0.51
573 0.47
574 0.38
575 0.35
576 0.27
577 0.24
578 0.2