Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9MPA6

Protein Details
Accession A0A0C9MPA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-247LFRERNKKKGGQQRKLNSNFNHHydrophilic
288-307NTTKKKTYTPLSKAEKQRRRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR045358  Ty3_capsid  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
Amino Acid Sequences MATDQAKALALQTKINLSGTETLSDDEITQLSQLLSNISLSKANDGPQLREPRVNDPRPFNGSNHDGDGYNKLENFITQLKMVFALQPSRFPNEITKVMYAASFLDGMAFEWIQPFINNIGTTMEDPTATNFEQFTASIRRMFGNVTLLSDAENKIMKTKQGNRSAAEYTTEFKRYAGLTNFNEPALLWAYKENINAQLQDELIIRQDIPSSLIEFQDLVINLDMLFRERNKKKGGQQRKLNSNFNHQQHSSPSVNHPVYQTRPSHQQPSHQGHQAESDDIRPMEIDNTTKKKTYTPLSKAEKQRRRDLNLCSYCGSADHDVLECDVAPARKQQSINANSILSQHPPTRGNATIFTFEDFLNTQSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.23
4 0.2
5 0.24
6 0.23
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.17
13 0.12
14 0.11
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.15
27 0.14
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.26
32 0.27
33 0.3
34 0.35
35 0.43
36 0.42
37 0.45
38 0.46
39 0.5
40 0.58
41 0.62
42 0.59
43 0.58
44 0.61
45 0.63
46 0.63
47 0.54
48 0.5
49 0.46
50 0.43
51 0.39
52 0.34
53 0.27
54 0.26
55 0.29
56 0.25
57 0.22
58 0.2
59 0.18
60 0.17
61 0.16
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.14
71 0.13
72 0.19
73 0.19
74 0.24
75 0.26
76 0.3
77 0.3
78 0.29
79 0.33
80 0.32
81 0.35
82 0.32
83 0.3
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.18
88 0.13
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.21
146 0.3
147 0.37
148 0.45
149 0.48
150 0.46
151 0.49
152 0.48
153 0.42
154 0.35
155 0.27
156 0.2
157 0.19
158 0.2
159 0.16
160 0.14
161 0.16
162 0.14
163 0.18
164 0.18
165 0.22
166 0.21
167 0.25
168 0.26
169 0.23
170 0.23
171 0.18
172 0.17
173 0.13
174 0.12
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.19
216 0.22
217 0.28
218 0.32
219 0.39
220 0.47
221 0.56
222 0.66
223 0.66
224 0.73
225 0.76
226 0.81
227 0.82
228 0.81
229 0.73
230 0.72
231 0.7
232 0.64
233 0.61
234 0.51
235 0.47
236 0.42
237 0.45
238 0.37
239 0.31
240 0.31
241 0.34
242 0.34
243 0.33
244 0.32
245 0.31
246 0.33
247 0.37
248 0.36
249 0.31
250 0.39
251 0.42
252 0.49
253 0.46
254 0.5
255 0.54
256 0.59
257 0.61
258 0.58
259 0.55
260 0.46
261 0.49
262 0.42
263 0.35
264 0.27
265 0.23
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.16
274 0.2
275 0.27
276 0.3
277 0.32
278 0.32
279 0.35
280 0.39
281 0.46
282 0.48
283 0.49
284 0.56
285 0.63
286 0.7
287 0.77
288 0.81
289 0.8
290 0.76
291 0.79
292 0.78
293 0.78
294 0.77
295 0.74
296 0.75
297 0.73
298 0.69
299 0.6
300 0.52
301 0.43
302 0.37
303 0.33
304 0.25
305 0.19
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.12
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.19
317 0.23
318 0.28
319 0.29
320 0.34
321 0.41
322 0.45
323 0.48
324 0.45
325 0.42
326 0.37
327 0.39
328 0.36
329 0.29
330 0.28
331 0.26
332 0.29
333 0.3
334 0.33
335 0.36
336 0.38
337 0.38
338 0.38
339 0.39
340 0.38
341 0.37
342 0.36
343 0.31
344 0.26
345 0.26
346 0.22