Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9M2W9

Protein Details
Accession A0A0C9M2W9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-125GVAPRAKMNQQRSRRFRASQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-425QGAKRRRL
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6.5, mito 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPAFFRWLSDKFPRVVTTVIEEHPKTVNGVVLPVDTTKPNPNGEEYDNLYLDMNGIIHPCCHPENKACPAPATEDDMMIAIFEYMDRIVDMVRPRKLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASQLAQIEHEAAERVAKELAAIGQQHQLPEKKEHFDSNCITPGTPFMAHLATCLRYHIAAKQNSDPLWKNLKVILSDATVPGEGEHKVMEFIRVERSRPEHNPNTKHVMYGLDADLIMLALGTHEPHFKVLREDVFEDKRTKGACFKCKQQGHSAHQCPVSHEALEEMKKEEAKNAPPKPYVLLHVNVLREYLEHALKFNIPGITWDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAISTLSLLWKSTMPMMGGFMTNNGDVDLKRVQVLVTELGKMEDTIFSERKQTEERRSQGAKRRRLENDRRARETKMFNPNGPNFGDMTAAPVHNPSAGMSNADIVANRAEIRLANINAAAALKAELSGNPIPEPTAATEEMQPKGTKRRLEEDEEEEEQQEDEEDYQDEDNDDDDETMESETPLSEADAEAQGIAILKRVQVEKKEKEDAARQREPDDEVRLWEAGWKERYYKAKFNLTLMDRDEIRHIVKSYCEGLIWVFKYYYVGCVSWSWYYPYHYAPMASDFTNIDEFDIQFEKSAPLRPFEQLMGVLPAASKSHIPKPFHNLMTEGDSPIIDFYPTEFEVDMDGKKWEWQGVVKLPFIDTNRLLEAMRTVYDQLNEEETIRNSEGPSVLYVSENHKAYNSISTVYTKRSTNEKMILDARLTDGLTGEIDKDSECIPRSTLRTPLPDFDLPDIANDKSISVTYSLPRFPEGFTFSTQLLKGLQLDNTLGYEDLQLATFEKIDTRQRYQSNRGWTPQVNHMEDYREYNNQRGRPRGGRGGYQPQGYGGGYNHGYDDGSRFPGTQSYGGGYQQRGYNNNNGYQQQQGYGNNSGYYGNQQQGRYNQQQPYYQNNNGGGYGQQQQQGYGGSGYHRGNNNQYGGNRGRGGYQQQGYGGNRGGGYGNNRGRGGGGGGYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.4
4 0.39
5 0.34
6 0.32
7 0.31
8 0.32
9 0.35
10 0.33
11 0.33
12 0.34
13 0.32
14 0.28
15 0.24
16 0.24
17 0.17
18 0.19
19 0.18
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.16
25 0.19
26 0.25
27 0.28
28 0.31
29 0.32
30 0.35
31 0.38
32 0.39
33 0.42
34 0.39
35 0.39
36 0.36
37 0.34
38 0.3
39 0.25
40 0.22
41 0.17
42 0.13
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.15
49 0.18
50 0.21
51 0.25
52 0.32
53 0.39
54 0.47
55 0.53
56 0.5
57 0.49
58 0.48
59 0.49
60 0.43
61 0.42
62 0.34
63 0.28
64 0.26
65 0.24
66 0.21
67 0.15
68 0.13
69 0.06
70 0.05
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.11
79 0.19
80 0.25
81 0.29
82 0.31
83 0.32
84 0.35
85 0.36
86 0.36
87 0.33
88 0.32
89 0.3
90 0.28
91 0.28
92 0.24
93 0.25
94 0.23
95 0.19
96 0.12
97 0.15
98 0.21
99 0.28
100 0.39
101 0.46
102 0.55
103 0.66
104 0.74
105 0.8
106 0.81
107 0.77
108 0.74
109 0.75
110 0.71
111 0.68
112 0.67
113 0.61
114 0.55
115 0.52
116 0.45
117 0.35
118 0.29
119 0.22
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.18
133 0.19
134 0.21
135 0.25
136 0.28
137 0.28
138 0.36
139 0.39
140 0.39
141 0.41
142 0.48
143 0.46
144 0.49
145 0.49
146 0.46
147 0.46
148 0.41
149 0.39
150 0.31
151 0.29
152 0.26
153 0.23
154 0.18
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.22
167 0.28
168 0.31
169 0.34
170 0.38
171 0.43
172 0.42
173 0.47
174 0.43
175 0.41
176 0.45
177 0.42
178 0.38
179 0.36
180 0.38
181 0.33
182 0.31
183 0.27
184 0.21
185 0.21
186 0.2
187 0.17
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.22
202 0.23
203 0.25
204 0.29
205 0.33
206 0.38
207 0.43
208 0.51
209 0.51
210 0.59
211 0.64
212 0.64
213 0.68
214 0.6
215 0.55
216 0.46
217 0.38
218 0.3
219 0.27
220 0.22
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.05
233 0.07
234 0.08
235 0.11
236 0.13
237 0.14
238 0.18
239 0.22
240 0.24
241 0.26
242 0.28
243 0.32
244 0.35
245 0.38
246 0.36
247 0.33
248 0.33
249 0.31
250 0.3
251 0.32
252 0.36
253 0.42
254 0.44
255 0.52
256 0.58
257 0.63
258 0.64
259 0.66
260 0.67
261 0.65
262 0.71
263 0.67
264 0.63
265 0.61
266 0.58
267 0.51
268 0.46
269 0.39
270 0.28
271 0.24
272 0.21
273 0.21
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.18
278 0.2
279 0.2
280 0.23
281 0.24
282 0.3
283 0.39
284 0.42
285 0.47
286 0.46
287 0.47
288 0.45
289 0.42
290 0.38
291 0.32
292 0.28
293 0.25
294 0.27
295 0.27
296 0.24
297 0.23
298 0.18
299 0.14
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.1
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.07
390 0.08
391 0.11
392 0.13
393 0.13
394 0.18
395 0.18
396 0.2
397 0.25
398 0.3
399 0.34
400 0.42
401 0.45
402 0.47
403 0.52
404 0.56
405 0.6
406 0.63
407 0.63
408 0.6
409 0.65
410 0.65
411 0.72
412 0.75
413 0.76
414 0.78
415 0.76
416 0.77
417 0.72
418 0.67
419 0.63
420 0.58
421 0.56
422 0.55
423 0.5
424 0.46
425 0.51
426 0.49
427 0.46
428 0.4
429 0.33
430 0.23
431 0.21
432 0.19
433 0.11
434 0.13
435 0.11
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.07
459 0.11
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.08
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.07
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.13
486 0.16
487 0.17
488 0.18
489 0.17
490 0.16
491 0.23
492 0.27
493 0.27
494 0.27
495 0.33
496 0.36
497 0.41
498 0.43
499 0.4
500 0.41
501 0.39
502 0.37
503 0.29
504 0.26
505 0.19
506 0.15
507 0.11
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.07
546 0.1
547 0.12
548 0.18
549 0.27
550 0.32
551 0.37
552 0.4
553 0.4
554 0.41
555 0.47
556 0.48
557 0.49
558 0.48
559 0.43
560 0.41
561 0.41
562 0.42
563 0.36
564 0.32
565 0.24
566 0.21
567 0.21
568 0.2
569 0.18
570 0.17
571 0.16
572 0.15
573 0.18
574 0.17
575 0.18
576 0.23
577 0.32
578 0.34
579 0.39
580 0.4
581 0.46
582 0.46
583 0.46
584 0.47
585 0.41
586 0.39
587 0.34
588 0.31
589 0.23
590 0.23
591 0.22
592 0.17
593 0.17
594 0.16
595 0.15
596 0.14
597 0.14
598 0.16
599 0.16
600 0.14
601 0.13
602 0.11
603 0.1
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.11
608 0.1
609 0.12
610 0.12
611 0.13
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.11
616 0.13
617 0.13
618 0.14
619 0.14
620 0.14
621 0.16
622 0.17
623 0.18
624 0.17
625 0.17
626 0.16
627 0.15
628 0.16
629 0.15
630 0.14
631 0.14
632 0.12
633 0.13
634 0.14
635 0.13
636 0.1
637 0.09
638 0.09
639 0.1
640 0.11
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.11
645 0.11
646 0.18
647 0.17
648 0.18
649 0.2
650 0.2
651 0.21
652 0.2
653 0.2
654 0.14
655 0.13
656 0.13
657 0.11
658 0.1
659 0.08
660 0.08
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.1
665 0.18
666 0.25
667 0.29
668 0.32
669 0.4
670 0.47
671 0.47
672 0.44
673 0.38
674 0.33
675 0.36
676 0.33
677 0.25
678 0.18
679 0.16
680 0.15
681 0.13
682 0.12
683 0.06
684 0.05
685 0.05
686 0.09
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.12
692 0.13
693 0.13
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.12
698 0.12
699 0.12
700 0.12
701 0.14
702 0.18
703 0.24
704 0.27
705 0.26
706 0.26
707 0.25
708 0.27
709 0.27
710 0.27
711 0.2
712 0.19
713 0.19
714 0.2
715 0.19
716 0.16
717 0.16
718 0.12
719 0.12
720 0.11
721 0.12
722 0.12
723 0.13
724 0.15
725 0.14
726 0.15
727 0.15
728 0.15
729 0.16
730 0.15
731 0.18
732 0.17
733 0.17
734 0.14
735 0.15
736 0.15
737 0.13
738 0.13
739 0.11
740 0.11
741 0.11
742 0.12
743 0.15
744 0.2
745 0.2
746 0.19
747 0.18
748 0.19
749 0.19
750 0.23
751 0.19
752 0.15
753 0.16
754 0.2
755 0.21
756 0.24
757 0.27
758 0.23
759 0.25
760 0.31
761 0.34
762 0.36
763 0.42
764 0.38
765 0.4
766 0.41
767 0.4
768 0.33
769 0.29
770 0.24
771 0.18
772 0.17
773 0.12
774 0.1
775 0.09
776 0.09
777 0.08
778 0.08
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.08
783 0.08
784 0.12
785 0.13
786 0.13
787 0.15
788 0.2
789 0.24
790 0.26
791 0.32
792 0.33
793 0.38
794 0.4
795 0.41
796 0.42
797 0.4
798 0.4
799 0.35
800 0.33
801 0.26
802 0.25
803 0.25
804 0.19
805 0.18
806 0.16
807 0.14
808 0.12
809 0.12
810 0.11
811 0.1
812 0.12
813 0.14
814 0.18
815 0.2
816 0.2
817 0.22
818 0.22
819 0.21
820 0.24
821 0.25
822 0.23
823 0.24
824 0.25
825 0.23
826 0.26
827 0.25
828 0.21
829 0.17
830 0.16
831 0.16
832 0.16
833 0.16
834 0.14
835 0.15
836 0.14
837 0.14
838 0.13
839 0.11
840 0.09
841 0.09
842 0.08
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.09
848 0.09
849 0.09
850 0.1
851 0.13
852 0.22
853 0.27
854 0.32
855 0.39
856 0.46
857 0.53
858 0.6
859 0.62
860 0.64
861 0.65
862 0.63
863 0.62
864 0.59
865 0.56
866 0.57
867 0.58
868 0.51
869 0.46
870 0.44
871 0.42
872 0.39
873 0.4
874 0.35
875 0.34
876 0.33
877 0.39
878 0.44
879 0.47
880 0.52
881 0.53
882 0.58
883 0.57
884 0.62
885 0.64
886 0.61
887 0.6
888 0.61
889 0.64
890 0.61
891 0.55
892 0.48
893 0.4
894 0.39
895 0.32
896 0.27
897 0.17
898 0.18
899 0.17
900 0.17
901 0.16
902 0.14
903 0.14
904 0.13
905 0.15
906 0.13
907 0.16
908 0.16
909 0.16
910 0.17
911 0.2
912 0.23
913 0.21
914 0.2
915 0.19
916 0.21
917 0.23
918 0.27
919 0.24
920 0.25
921 0.27
922 0.3
923 0.31
924 0.33
925 0.39
926 0.4
927 0.44
928 0.46
929 0.44
930 0.42
931 0.43
932 0.4
933 0.34
934 0.34
935 0.32
936 0.31
937 0.34
938 0.33
939 0.28
940 0.28
941 0.25
942 0.21
943 0.24
944 0.23
945 0.24
946 0.28
947 0.29
948 0.34
949 0.4
950 0.48
951 0.51
952 0.55
953 0.55
954 0.55
955 0.61
956 0.6
957 0.63
958 0.63
959 0.59
960 0.57
961 0.55
962 0.51
963 0.45
964 0.4
965 0.31
966 0.26
967 0.28
968 0.26
969 0.26
970 0.25
971 0.25
972 0.25
973 0.26
974 0.24
975 0.19
976 0.16
977 0.13
978 0.2
979 0.21
980 0.26
981 0.29
982 0.32
983 0.38
984 0.43
985 0.45
986 0.44
987 0.44
988 0.45
989 0.45
990 0.46
991 0.41
992 0.36
993 0.35
994 0.35
995 0.39
996 0.4
997 0.39
998 0.35
999 0.35
1000 0.42
1001 0.41
1002 0.4
1003 0.36
1004 0.29
1005 0.27
1006 0.25
1007 0.24
1008 0.21
1009 0.24
1010 0.3
1011 0.33
1012 0.36
1013 0.36
1014 0.36
1015 0.35
1016 0.33
1017 0.3