Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T0MJA3

Protein Details
Accession T0MJA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MGKVTRKIREEKKKERSPRKLSQAKYPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-20RKIREEKKKERSPRK
226-237ARRTGRVRGSKK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
Amino Acid Sequences MGKVTRKIREEKKKERSPRKLSQAKYPAISEITEGTVVDLIHERGRGVPLVHVKFGEETFSMIATEGLYTGQKIIIGDDSPIAFGNITKLKNVPGGMAVHSIEYEYEDGGCVGMTGGAYSVVVNHREESNETVIGLPSGAKKVFSSEVRCIVGVPAAGGIKEKPFLKASVAYYYNKAHAKKWPRVRCVAMNPVDHKFGGGNHQHVGRPTTISKRRPHAQLMGLIGARRTGRVRGSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.93
3 0.94
4 0.92
5 0.91
6 0.91
7 0.89
8 0.82
9 0.82
10 0.8
11 0.74
12 0.68
13 0.58
14 0.5
15 0.43
16 0.4
17 0.3
18 0.22
19 0.18
20 0.15
21 0.14
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.17
36 0.24
37 0.26
38 0.27
39 0.25
40 0.25
41 0.25
42 0.24
43 0.21
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.09
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.18
79 0.18
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.06
124 0.05
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.1
130 0.14
131 0.17
132 0.21
133 0.23
134 0.27
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.21
139 0.19
140 0.14
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.15
153 0.17
154 0.21
155 0.22
156 0.26
157 0.28
158 0.27
159 0.29
160 0.3
161 0.33
162 0.34
163 0.33
164 0.29
165 0.35
166 0.43
167 0.49
168 0.58
169 0.62
170 0.63
171 0.69
172 0.72
173 0.7
174 0.69
175 0.69
176 0.64
177 0.61
178 0.58
179 0.54
180 0.51
181 0.42
182 0.35
183 0.27
184 0.22
185 0.24
186 0.25
187 0.25
188 0.25
189 0.28
190 0.3
191 0.31
192 0.33
193 0.26
194 0.26
195 0.28
196 0.35
197 0.42
198 0.48
199 0.53
200 0.59
201 0.65
202 0.67
203 0.69
204 0.66
205 0.62
206 0.6
207 0.56
208 0.52
209 0.46
210 0.4
211 0.34
212 0.3
213 0.25
214 0.22
215 0.21
216 0.21
217 0.28