Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T0MD79

Protein Details
Accession T0MD79    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-58NKNQNLKKFDEKLKNYQEKKKKFQLNVFILKNHydrophilic
440-467LTCNSGKSNLFKKRRIRKKIGNFQCENLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
451-458KKRRIRKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010935  SMC_hinge  
IPR036277  SMC_hinge_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051276  P:chromosome organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF06470  SMC_hinge  
Amino Acid Sequences MNKNSFKKMDLQYYKNELKLISEELNNKNQNLKKFDEKLKNYQEKKKKFQLNVFILKNIVNFLKIYKDKKLTEDEKKKEISIIKNVLEEKKASEKICFDYDMLTKLIDKRKELWREEKRLMENKKSINEAFKMAENKLFVSGHFSYNVYKEIKDQEGVIGCVYNLIDIPEDFMSAFEAVSGGFLFNIVVENEQVVNKILEKDLSGNAIFIPLNKLEEKNEIEIEGLESLSSKIICDNKYKKLVQFITRNTFLTSDLKKGSEISKKYKISVVTKDGDLVTKSGVMTGGYEHKSTVIIEYKKSINELEHCNNNLKKVQNKISKLNIEIETINNLQKENINLDGRVSTIKFLEEKIKILESSKYNLKSFESKLENLNLKNIGLRTEIIKIENEYDNLKSEVNKLEKSKTNIKNILNSVENFDMERKNLKNQLDNLKIKEVNKLTCNSGKSNLFKKRRIRKKIGNFQCENLYPNLSREQIAEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.62
3 0.56
4 0.45
5 0.4
6 0.38
7 0.35
8 0.3
9 0.3
10 0.36
11 0.39
12 0.48
13 0.48
14 0.46
15 0.5
16 0.51
17 0.53
18 0.51
19 0.52
20 0.52
21 0.58
22 0.67
23 0.69
24 0.71
25 0.74
26 0.79
27 0.83
28 0.82
29 0.84
30 0.85
31 0.84
32 0.86
33 0.86
34 0.85
35 0.83
36 0.84
37 0.84
38 0.83
39 0.82
40 0.76
41 0.67
42 0.59
43 0.51
44 0.42
45 0.35
46 0.25
47 0.17
48 0.15
49 0.14
50 0.22
51 0.28
52 0.31
53 0.37
54 0.44
55 0.45
56 0.5
57 0.58
58 0.58
59 0.63
60 0.7
61 0.67
62 0.67
63 0.67
64 0.62
65 0.58
66 0.56
67 0.52
68 0.51
69 0.52
70 0.46
71 0.48
72 0.52
73 0.49
74 0.44
75 0.38
76 0.33
77 0.34
78 0.37
79 0.34
80 0.33
81 0.34
82 0.36
83 0.37
84 0.35
85 0.27
86 0.26
87 0.26
88 0.25
89 0.22
90 0.18
91 0.18
92 0.23
93 0.3
94 0.29
95 0.3
96 0.34
97 0.43
98 0.51
99 0.55
100 0.6
101 0.62
102 0.67
103 0.7
104 0.71
105 0.7
106 0.7
107 0.7
108 0.68
109 0.65
110 0.62
111 0.6
112 0.57
113 0.52
114 0.48
115 0.43
116 0.38
117 0.32
118 0.31
119 0.31
120 0.27
121 0.28
122 0.23
123 0.22
124 0.21
125 0.2
126 0.15
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.24
135 0.18
136 0.17
137 0.18
138 0.22
139 0.23
140 0.22
141 0.21
142 0.19
143 0.2
144 0.2
145 0.17
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.07
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.08
197 0.1
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.16
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.09
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.07
220 0.11
221 0.13
222 0.21
223 0.25
224 0.3
225 0.37
226 0.39
227 0.38
228 0.43
229 0.45
230 0.44
231 0.47
232 0.47
233 0.46
234 0.46
235 0.45
236 0.37
237 0.33
238 0.28
239 0.26
240 0.22
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.18
245 0.19
246 0.23
247 0.25
248 0.28
249 0.31
250 0.39
251 0.4
252 0.41
253 0.42
254 0.42
255 0.4
256 0.41
257 0.4
258 0.33
259 0.32
260 0.33
261 0.3
262 0.26
263 0.21
264 0.15
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.16
282 0.17
283 0.17
284 0.21
285 0.22
286 0.22
287 0.23
288 0.21
289 0.17
290 0.2
291 0.26
292 0.27
293 0.3
294 0.32
295 0.37
296 0.37
297 0.37
298 0.37
299 0.34
300 0.35
301 0.38
302 0.46
303 0.48
304 0.52
305 0.56
306 0.59
307 0.58
308 0.55
309 0.53
310 0.44
311 0.38
312 0.34
313 0.28
314 0.25
315 0.23
316 0.23
317 0.17
318 0.16
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.15
331 0.11
332 0.1
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.22
340 0.23
341 0.22
342 0.23
343 0.27
344 0.22
345 0.26
346 0.31
347 0.33
348 0.32
349 0.33
350 0.35
351 0.35
352 0.35
353 0.39
354 0.37
355 0.35
356 0.37
357 0.43
358 0.45
359 0.39
360 0.41
361 0.34
362 0.29
363 0.3
364 0.27
365 0.22
366 0.18
367 0.18
368 0.16
369 0.19
370 0.2
371 0.18
372 0.2
373 0.19
374 0.22
375 0.23
376 0.22
377 0.2
378 0.2
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.18
383 0.2
384 0.26
385 0.29
386 0.33
387 0.34
388 0.4
389 0.46
390 0.51
391 0.58
392 0.58
393 0.63
394 0.66
395 0.66
396 0.66
397 0.63
398 0.62
399 0.55
400 0.48
401 0.43
402 0.37
403 0.34
404 0.27
405 0.27
406 0.24
407 0.22
408 0.28
409 0.26
410 0.32
411 0.38
412 0.42
413 0.46
414 0.51
415 0.59
416 0.62
417 0.66
418 0.62
419 0.63
420 0.63
421 0.56
422 0.58
423 0.53
424 0.5
425 0.49
426 0.48
427 0.46
428 0.48
429 0.51
430 0.46
431 0.47
432 0.48
433 0.5
434 0.57
435 0.62
436 0.65
437 0.69
438 0.76
439 0.8
440 0.83
441 0.87
442 0.88
443 0.88
444 0.91
445 0.93
446 0.93
447 0.93
448 0.86
449 0.79
450 0.76
451 0.67
452 0.59
453 0.51
454 0.46
455 0.37
456 0.36
457 0.38
458 0.32
459 0.3