Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T0LC03

Protein Details
Accession T0LC03    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-35TKINSDQKNASNNKKRVKRSHKKNEKDFELLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-26KKRVKRSHKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
Amino Acid Sequences MTITKINSDQKNASNNKKRVKRSHKKNEKDFELLTEIKENFEDIKSLLKCKSSDKKTIEQKIDLIWINCKSLFCQLLKQKNMFNNINLLFTKGNNDLKNEIFEETLKNIVVISIHEYSKQFVIILAKHSTKYLVGIIKHIKLNIDKIVCSRNGLYVIDEVFKLCNRKSKHEIISEILHYSNTDEIIDDHFESNVKLEFQHVEKENENIKLNGVEIEDVKSKCQLNVDENNKNKEKEQQIDYVTSKNFILIRKLSSKRCWNFEITHYILHRYINEEKISIKFLLDLFIRNKQLHLLLYTYKGLEVGLNLLDTNEIIILFNLIQKDFSNLVNDKYGVIYILKFLELNNVTINNKIIDIYTNEYKSIFIEEISILPILYFFNQEAKYYPTLFNTLRQKKQVQIDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.72
3 0.76
4 0.8
5 0.84
6 0.85
7 0.89
8 0.89
9 0.89
10 0.92
11 0.93
12 0.95
13 0.95
14 0.94
15 0.9
16 0.85
17 0.75
18 0.68
19 0.64
20 0.54
21 0.45
22 0.41
23 0.34
24 0.29
25 0.28
26 0.24
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.12
31 0.21
32 0.22
33 0.26
34 0.27
35 0.29
36 0.3
37 0.38
38 0.48
39 0.47
40 0.55
41 0.57
42 0.64
43 0.7
44 0.78
45 0.75
46 0.67
47 0.62
48 0.55
49 0.54
50 0.48
51 0.39
52 0.35
53 0.31
54 0.3
55 0.3
56 0.27
57 0.23
58 0.25
59 0.28
60 0.24
61 0.31
62 0.38
63 0.46
64 0.51
65 0.53
66 0.53
67 0.54
68 0.61
69 0.55
70 0.47
71 0.45
72 0.41
73 0.42
74 0.36
75 0.33
76 0.25
77 0.23
78 0.26
79 0.23
80 0.29
81 0.26
82 0.29
83 0.29
84 0.3
85 0.32
86 0.29
87 0.25
88 0.19
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.17
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.08
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.12
108 0.11
109 0.14
110 0.14
111 0.17
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.22
123 0.25
124 0.28
125 0.29
126 0.28
127 0.26
128 0.24
129 0.26
130 0.26
131 0.23
132 0.2
133 0.21
134 0.25
135 0.23
136 0.23
137 0.2
138 0.17
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.13
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.19
152 0.21
153 0.29
154 0.35
155 0.42
156 0.47
157 0.49
158 0.5
159 0.46
160 0.46
161 0.4
162 0.34
163 0.26
164 0.19
165 0.15
166 0.13
167 0.1
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.14
187 0.16
188 0.18
189 0.18
190 0.21
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.2
195 0.18
196 0.15
197 0.15
198 0.13
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.09
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.29
213 0.35
214 0.4
215 0.43
216 0.49
217 0.49
218 0.48
219 0.43
220 0.42
221 0.4
222 0.38
223 0.38
224 0.37
225 0.37
226 0.4
227 0.4
228 0.37
229 0.31
230 0.27
231 0.23
232 0.19
233 0.2
234 0.16
235 0.2
236 0.18
237 0.22
238 0.29
239 0.35
240 0.38
241 0.43
242 0.52
243 0.52
244 0.55
245 0.54
246 0.5
247 0.47
248 0.46
249 0.46
250 0.38
251 0.38
252 0.34
253 0.33
254 0.3
255 0.28
256 0.24
257 0.22
258 0.24
259 0.24
260 0.24
261 0.22
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.21
266 0.16
267 0.14
268 0.13
269 0.16
270 0.15
271 0.18
272 0.18
273 0.23
274 0.27
275 0.26
276 0.26
277 0.24
278 0.26
279 0.23
280 0.21
281 0.18
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.18
286 0.16
287 0.14
288 0.13
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.14
311 0.14
312 0.15
313 0.2
314 0.2
315 0.22
316 0.24
317 0.24
318 0.21
319 0.2
320 0.19
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.18
330 0.18
331 0.19
332 0.19
333 0.21
334 0.22
335 0.23
336 0.25
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.13
341 0.13
342 0.15
343 0.2
344 0.25
345 0.26
346 0.26
347 0.26
348 0.26
349 0.24
350 0.24
351 0.19
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.14
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.09
365 0.16
366 0.17
367 0.18
368 0.2
369 0.24
370 0.27
371 0.28
372 0.3
373 0.27
374 0.32
375 0.33
376 0.39
377 0.45
378 0.51
379 0.56
380 0.61
381 0.62
382 0.63