Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T0KXQ1

Protein Details
Accession T0KXQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-417KGNLGTKSGKRNFKKEGNYKKEGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-414NKKGNLGTKSGKRNFKKEGNYKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 15.5, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000380  Topo_IA  
IPR013497  Topo_IA_cen  
IPR013824  Topo_IA_cen_sub1  
IPR013825  Topo_IA_cen_sub2  
IPR023405  Topo_IA_core_domain  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF01131  Topoisom_bac  
Amino Acid Sequences MKIGEEIFYLNGLEIVERNYLDVYVYDKWNNKRINSYDIGQVFVPVDGYYGNIRNDGVDNVSNEGNDGVVKWNGDCNCSNLRNGDYSVSNVGNDGVDNVSNVRNGDYNVSNKNNEDIENINCSVNNVNINCSVNNKNNTIHTLNKFHICNKSHIITNTAYELCIVQGKTSPPLFLSEPDLISLMDKNGIGTDATIHEHINKILIRKYAKKVGNLIVPEKLGIGLIKGYREFANEEELFNNKNVVDGCENKNVVVGYDNGNVVVGCENKSSMNKHRYNSNIEGTSSNKSSNSKSSVNKNKTLNNSILRVDKPYMRKKLEIDLKKICVGEISKESVLQEEISTYEKLFCKLQNNIEKFKSVVESVLNEKDDNSGFIDGSDDSSSENGPFTKGGNKKGNLGTKSGKRNFKKEGNYKKEGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.16
12 0.2
13 0.25
14 0.31
15 0.37
16 0.45
17 0.5
18 0.49
19 0.54
20 0.54
21 0.56
22 0.54
23 0.51
24 0.5
25 0.45
26 0.44
27 0.34
28 0.31
29 0.24
30 0.2
31 0.18
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.09
36 0.11
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.15
52 0.12
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.16
60 0.17
61 0.21
62 0.21
63 0.22
64 0.29
65 0.31
66 0.32
67 0.29
68 0.31
69 0.3
70 0.3
71 0.28
72 0.21
73 0.22
74 0.24
75 0.21
76 0.19
77 0.16
78 0.15
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.18
94 0.21
95 0.27
96 0.3
97 0.3
98 0.3
99 0.32
100 0.29
101 0.26
102 0.24
103 0.2
104 0.19
105 0.22
106 0.22
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.18
113 0.14
114 0.15
115 0.18
116 0.19
117 0.19
118 0.22
119 0.26
120 0.28
121 0.31
122 0.31
123 0.31
124 0.31
125 0.36
126 0.35
127 0.36
128 0.34
129 0.35
130 0.35
131 0.38
132 0.37
133 0.36
134 0.41
135 0.37
136 0.37
137 0.37
138 0.37
139 0.35
140 0.34
141 0.34
142 0.27
143 0.25
144 0.24
145 0.2
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.1
150 0.12
151 0.11
152 0.08
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.18
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.15
190 0.19
191 0.21
192 0.26
193 0.3
194 0.36
195 0.37
196 0.38
197 0.39
198 0.39
199 0.39
200 0.35
201 0.33
202 0.26
203 0.23
204 0.2
205 0.16
206 0.12
207 0.08
208 0.07
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.16
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.15
226 0.16
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.16
233 0.2
234 0.24
235 0.25
236 0.23
237 0.24
238 0.21
239 0.19
240 0.15
241 0.13
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.18
257 0.25
258 0.34
259 0.38
260 0.4
261 0.46
262 0.49
263 0.54
264 0.54
265 0.51
266 0.43
267 0.39
268 0.39
269 0.35
270 0.34
271 0.28
272 0.24
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.26
277 0.29
278 0.32
279 0.36
280 0.45
281 0.54
282 0.58
283 0.62
284 0.61
285 0.62
286 0.62
287 0.62
288 0.58
289 0.52
290 0.49
291 0.45
292 0.45
293 0.39
294 0.36
295 0.34
296 0.33
297 0.38
298 0.44
299 0.5
300 0.5
301 0.53
302 0.51
303 0.59
304 0.63
305 0.61
306 0.59
307 0.58
308 0.57
309 0.56
310 0.53
311 0.43
312 0.37
313 0.31
314 0.28
315 0.25
316 0.26
317 0.23
318 0.24
319 0.24
320 0.22
321 0.21
322 0.17
323 0.13
324 0.09
325 0.1
326 0.12
327 0.13
328 0.12
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.28
335 0.34
336 0.43
337 0.47
338 0.52
339 0.56
340 0.56
341 0.53
342 0.47
343 0.43
344 0.37
345 0.27
346 0.24
347 0.2
348 0.21
349 0.24
350 0.29
351 0.28
352 0.25
353 0.25
354 0.26
355 0.24
356 0.22
357 0.2
358 0.16
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.12
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.13
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.21
376 0.26
377 0.35
378 0.42
379 0.44
380 0.5
381 0.57
382 0.65
383 0.58
384 0.59
385 0.59
386 0.59
387 0.68
388 0.69
389 0.71
390 0.7
391 0.76
392 0.79
393 0.79
394 0.81
395 0.81
396 0.84
397 0.83