Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T0MM56

Protein Details
Accession T0MM56    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-327GKTDITKKIKVVKKKTLKLTKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-327TKKIKVVKKKTLKLTKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032284  RecQ_Zn-bd  
IPR018982  RQC_domain  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0043138  F:3'-5' DNA helicase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF16124  RecQ_Zn_bind  
PF09382  RQC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
Amino Acid Sequences MWNYLLYIKKECEMISEKLNKNLKTAFYHAGLSKKERNAVQQLWNQDKFKIIVATIAFGMGIDKKDVRFVIHYSLPKSLEGYYQETGRAGRDGKESICILYYNYGDKHKINYMINLNHQSTKEQKQRQKDELRDVINFCENKNDCRRKLILKYFDEDFDSTNCKKTCDNCTNTQKTVLVNYTTVANELSSIVRYNKLSLHQLIDVYRGTGNKKVDNVYAGRGNNIKKTLIERIIKKMIIKGYIEEKTESKGGFPWTYLIYRKNVDLLDIEEVHKNEIVAKNKEPIEKNKINTDKKLAIKNSTNSGKTDITKKIKVVKKKTLKLTKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.36
3 0.44
4 0.45
5 0.52
6 0.59
7 0.53
8 0.52
9 0.53
10 0.49
11 0.45
12 0.47
13 0.43
14 0.37
15 0.41
16 0.4
17 0.41
18 0.41
19 0.42
20 0.44
21 0.43
22 0.47
23 0.46
24 0.5
25 0.52
26 0.54
27 0.56
28 0.53
29 0.58
30 0.6
31 0.63
32 0.57
33 0.49
34 0.47
35 0.39
36 0.37
37 0.31
38 0.22
39 0.21
40 0.2
41 0.2
42 0.17
43 0.16
44 0.12
45 0.1
46 0.11
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.2
57 0.23
58 0.28
59 0.31
60 0.3
61 0.34
62 0.33
63 0.3
64 0.3
65 0.25
66 0.22
67 0.22
68 0.25
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.21
73 0.21
74 0.18
75 0.17
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.19
80 0.18
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.18
85 0.15
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.23
95 0.23
96 0.28
97 0.26
98 0.29
99 0.33
100 0.34
101 0.38
102 0.4
103 0.37
104 0.35
105 0.34
106 0.31
107 0.31
108 0.37
109 0.41
110 0.45
111 0.49
112 0.57
113 0.64
114 0.71
115 0.74
116 0.7
117 0.7
118 0.68
119 0.64
120 0.57
121 0.5
122 0.43
123 0.39
124 0.34
125 0.25
126 0.27
127 0.25
128 0.28
129 0.37
130 0.43
131 0.38
132 0.43
133 0.46
134 0.44
135 0.52
136 0.55
137 0.53
138 0.47
139 0.49
140 0.45
141 0.43
142 0.39
143 0.3
144 0.23
145 0.15
146 0.18
147 0.16
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.24
153 0.32
154 0.36
155 0.4
156 0.44
157 0.53
158 0.57
159 0.55
160 0.53
161 0.45
162 0.37
163 0.35
164 0.27
165 0.19
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.15
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.18
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.16
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.17
197 0.19
198 0.2
199 0.22
200 0.23
201 0.23
202 0.25
203 0.24
204 0.23
205 0.26
206 0.23
207 0.23
208 0.26
209 0.26
210 0.27
211 0.28
212 0.25
213 0.21
214 0.25
215 0.29
216 0.33
217 0.37
218 0.37
219 0.42
220 0.46
221 0.46
222 0.44
223 0.41
224 0.37
225 0.34
226 0.31
227 0.27
228 0.29
229 0.31
230 0.31
231 0.29
232 0.26
233 0.25
234 0.28
235 0.25
236 0.19
237 0.19
238 0.21
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.23
244 0.25
245 0.25
246 0.25
247 0.26
248 0.26
249 0.28
250 0.25
251 0.23
252 0.21
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.19
263 0.24
264 0.3
265 0.32
266 0.34
267 0.39
268 0.43
269 0.5
270 0.5
271 0.52
272 0.54
273 0.57
274 0.58
275 0.61
276 0.67
277 0.67
278 0.67
279 0.66
280 0.65
281 0.64
282 0.69
283 0.64
284 0.62
285 0.63
286 0.62
287 0.64
288 0.63
289 0.59
290 0.52
291 0.52
292 0.49
293 0.45
294 0.48
295 0.48
296 0.48
297 0.51
298 0.54
299 0.59
300 0.62
301 0.69
302 0.72
303 0.73
304 0.76
305 0.8
306 0.86
307 0.87