FuNGI

A0A081CFN4

Protein Details

Accession

A0A081CFN4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MSKDAKSPTKESKRKSKSSDAAESPKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-30	TKESKRKSKSSDAAESPKKSKK
512-521	PRKGKAGGRK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MSKDAKSPTKESKRKSKSSDAAESPKKSKKTASATASSSSNVESTSSKGKSKAKDGQATLKVQGSKSASQQLSKAGAAFASFADYNPAPSTKFSLYRAEGLPDETGARDDASDERLLLAGETDTMAYVGNNFEFGSTAEVRGYTGEYMVGIYDPSSSSITLRALPTFQVARSIKANSSLASISSSRTFADYGEMTAARRALGDAFGNRKQKANARNQDRMKVDTANMEVILDDFTGGIQDSVASLPSLDEVLASSTASRPMPPANLDAKHPAEAYRISDLIPTDVFQALPIQKLIDNVHDADELQKLIPYSREFPDWIWSRLVDNLQRSSHLGGGSKSQKHTTFDDDDEDADKPANGDDDDVMMMPALGATEDKEDATNKVRLAYYMSMLWYLHSRPKSVSQRSRLITSLKLDGEDANKRIVRALLNTFSETPANSDRAQMSAFHQTKLLAYMCALALHLDNFSVDYDKLARNCNIAPSTLRELFRTLGCTAATTGGEKRMVLKTPFTLPQPRKGKAGGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.85
3	0.84
4	0.82
5	0.83
6	0.84
7	0.81
8	0.81
9	0.8
10	0.78
11	0.75
12	0.74
13	0.69
14	0.62
15	0.61
16	0.6
17	0.6
18	0.64
19	0.63
20	0.62
21	0.61
22	0.61
23	0.56
24	0.47
25	0.39
26	0.3
27	0.23
28	0.17
29	0.15
30	0.13
31	0.15
32	0.23
33	0.25
34	0.27
35	0.34
36	0.41
37	0.45
38	0.53
39	0.59
40	0.6
41	0.65
42	0.67
43	0.7
44	0.7
45	0.67
46	0.6
47	0.56
48	0.5
49	0.41
50	0.43
51	0.37
52	0.34
53	0.35
54	0.41
55	0.38
56	0.37
57	0.38
58	0.37
59	0.36
60	0.33
61	0.29
62	0.2
63	0.18
64	0.16
65	0.16
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.09
70	0.14
71	0.14
72	0.16
73	0.17
74	0.18
75	0.16
76	0.17
77	0.22
78	0.21
79	0.25
80	0.26
81	0.31
82	0.33
83	0.36
84	0.36
85	0.34
86	0.31
87	0.29
88	0.26
89	0.2
90	0.18
91	0.14
92	0.13
93	0.11
94	0.1
95	0.08
96	0.09
97	0.1
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.09
105	0.09
106	0.06
107	0.05
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.04
114	0.05
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.07
131	0.07
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.04
138	0.04
139	0.05
140	0.05
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.11
147	0.13
148	0.14
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.16
153	0.15
154	0.14
155	0.2
156	0.2
157	0.21
158	0.23
159	0.25
160	0.23
161	0.25
162	0.26
163	0.17
164	0.19
165	0.17
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.12
170	0.13
171	0.13
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.1
176	0.12
177	0.11
178	0.1
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.06
188	0.07
189	0.09
190	0.11
191	0.16
192	0.21
193	0.26
194	0.27
195	0.28
196	0.3
197	0.35
198	0.41
199	0.46
200	0.5
201	0.53
202	0.62
203	0.62
204	0.66
205	0.62
206	0.56
207	0.47
208	0.4
209	0.33
210	0.26
211	0.24
212	0.18
213	0.16
214	0.13
215	0.1
216	0.09
217	0.08
218	0.05
219	0.04
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.1
249	0.11
250	0.15
251	0.17
252	0.18
253	0.19
254	0.23
255	0.23
256	0.22
257	0.21
258	0.18
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.13
263	0.12
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.1
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.09
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.12
284	0.12
285	0.13
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.1
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.08
295	0.11
296	0.12
297	0.14
298	0.16
299	0.17
300	0.17
301	0.18
302	0.26
303	0.26
304	0.26
305	0.24
306	0.23
307	0.22
308	0.23
309	0.26
310	0.21
311	0.21
312	0.24
313	0.23
314	0.24
315	0.24
316	0.23
317	0.22
318	0.19
319	0.17
320	0.14
321	0.2
322	0.26
323	0.28
324	0.29
325	0.31
326	0.32
327	0.34
328	0.36
329	0.36
330	0.33
331	0.31
332	0.32
333	0.28
334	0.27
335	0.25
336	0.23
337	0.17
338	0.13
339	0.11
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.06
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.09
363	0.11
364	0.16
365	0.18
366	0.17
367	0.2
368	0.2
369	0.19
370	0.23
371	0.22
372	0.19
373	0.17
374	0.18
375	0.16
376	0.15
377	0.16
378	0.13
379	0.14
380	0.19
381	0.2
382	0.21
383	0.22
384	0.32
385	0.42
386	0.5
387	0.57
388	0.58
389	0.65
390	0.66
391	0.67
392	0.6
393	0.53
394	0.47
395	0.4
396	0.39
397	0.31
398	0.28
399	0.26
400	0.25
401	0.27
402	0.28
403	0.26
404	0.27
405	0.27
406	0.27
407	0.28
408	0.28
409	0.25
410	0.24
411	0.29
412	0.28
413	0.3
414	0.32
415	0.31
416	0.3
417	0.29
418	0.24
419	0.23
420	0.21
421	0.22
422	0.2
423	0.23
424	0.22
425	0.22
426	0.23
427	0.2
428	0.19
429	0.27
430	0.28
431	0.25
432	0.26
433	0.25
434	0.25
435	0.27
436	0.25
437	0.14
438	0.13
439	0.15
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.1
444	0.09
445	0.1
446	0.09
447	0.08
448	0.07
449	0.08
450	0.09
451	0.1
452	0.09
453	0.11
454	0.14
455	0.19
456	0.21
457	0.26
458	0.27
459	0.28
460	0.3
461	0.35
462	0.33
463	0.31
464	0.31
465	0.32
466	0.38
467	0.4
468	0.4
469	0.34
470	0.35
471	0.36
472	0.35
473	0.33
474	0.25
475	0.22
476	0.21
477	0.21
478	0.19
479	0.2
480	0.18
481	0.17
482	0.19
483	0.21
484	0.22
485	0.21
486	0.25
487	0.27
488	0.32
489	0.33
490	0.34
491	0.33
492	0.38
493	0.43
494	0.44
495	0.5
496	0.48
497	0.56
498	0.6
499	0.59
500	0.58
501	0.6

A0A081CFN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer