Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A081CFL6

Protein Details
Accession A0A081CFL6    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35ASSSTILKRPRGRPRKDADVSLHydrophilic
75-96ATSTPAQPKKRGRPPKSSLTTPHydrophilic
109-129ASSAGPKKRGRPPKPKSILTAHydrophilic
172-191TSVAPPRKKRGRPSKAAAAAHydrophilic
333-361GAAAPRRLKSKKRKDWPSERERLRKWRRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-27PRGRP
83-88KKRGRP
113-124GPKKRGRPPKPK
177-186PRKKRGRPSK
210-215RKRGRP
239-248PRKRGRPPKS
263-291AAKRRGRPPGSSNAKKDARMAASDARRRS
336-360APRRLKSKKRKDWPSERERLRKWRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MPPKRTNTSALSDASSSTILKRPRGRPRKDADVSLSSTVGEPTPARRNAAASSSSSSRRIQARDSGDISLASTVATSTPAQPKKRGRPPKSSLTTPAMRAFTSADTSAASSAGPKKRGRPPKPKSILTARDDRTLTSPNNSVSFSDDPAHRALLRGLANQRAVRDADTTAGTSVAPPRKKRGRPSKAAAAATPNTSIDVSTAATPNVPARKRGRPPKSASAATDTSVSMSASATLEAPPRKRGRPPKSASAAPNTSVSTSTPAAKRRGRPPGSSNAKKDARMAASDARRRSRPVEDSGESDVSLVDGGSDEASEADDAEQSDADVMSSDGEAGAAAPRRLKSKKRKDWPSERERLRKWRRLSVQERECITSEGGLIWRTAIPLLNSMPKNIRSMVADSLTRALNRIDGKLETGLVPPLARIPLGSATNTSRRDLPSSMLAWRLEEEGSLLRAEAGDTPEARSIDTMSLGMNAEISELEQMLLPEAEQIVGLSKTLEHQTQQLEQSQAEIARLKRERKLIKSQGTSDYPPNLEAHDLLSASAQKPELDATLGSYFRLGRQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.2
4 0.18
5 0.22
6 0.25
7 0.32
8 0.41
9 0.49
10 0.59
11 0.69
12 0.74
13 0.78
14 0.82
15 0.85
16 0.81
17 0.78
18 0.74
19 0.69
20 0.65
21 0.57
22 0.49
23 0.38
24 0.33
25 0.27
26 0.2
27 0.16
28 0.13
29 0.17
30 0.26
31 0.28
32 0.31
33 0.31
34 0.34
35 0.34
36 0.38
37 0.34
38 0.28
39 0.31
40 0.32
41 0.35
42 0.36
43 0.34
44 0.35
45 0.39
46 0.39
47 0.39
48 0.43
49 0.45
50 0.48
51 0.49
52 0.45
53 0.39
54 0.36
55 0.32
56 0.24
57 0.17
58 0.1
59 0.08
60 0.06
61 0.06
62 0.08
63 0.08
64 0.13
65 0.23
66 0.3
67 0.35
68 0.43
69 0.53
70 0.62
71 0.72
72 0.78
73 0.76
74 0.8
75 0.83
76 0.85
77 0.82
78 0.77
79 0.73
80 0.69
81 0.65
82 0.58
83 0.57
84 0.48
85 0.4
86 0.36
87 0.31
88 0.25
89 0.24
90 0.2
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.18
99 0.23
100 0.29
101 0.31
102 0.39
103 0.49
104 0.6
105 0.67
106 0.71
107 0.73
108 0.78
109 0.84
110 0.81
111 0.78
112 0.77
113 0.76
114 0.69
115 0.71
116 0.62
117 0.59
118 0.55
119 0.49
120 0.42
121 0.39
122 0.35
123 0.3
124 0.3
125 0.26
126 0.28
127 0.27
128 0.24
129 0.24
130 0.24
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.18
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.26
145 0.29
146 0.3
147 0.29
148 0.26
149 0.25
150 0.22
151 0.2
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.15
161 0.21
162 0.25
163 0.27
164 0.36
165 0.46
166 0.53
167 0.63
168 0.68
169 0.7
170 0.74
171 0.79
172 0.8
173 0.78
174 0.72
175 0.63
176 0.57
177 0.48
178 0.4
179 0.33
180 0.23
181 0.17
182 0.15
183 0.14
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.12
193 0.18
194 0.18
195 0.23
196 0.28
197 0.37
198 0.46
199 0.56
200 0.61
201 0.63
202 0.69
203 0.73
204 0.74
205 0.68
206 0.6
207 0.56
208 0.48
209 0.4
210 0.34
211 0.24
212 0.18
213 0.15
214 0.13
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.11
223 0.14
224 0.15
225 0.22
226 0.26
227 0.28
228 0.37
229 0.47
230 0.51
231 0.59
232 0.62
233 0.65
234 0.66
235 0.68
236 0.63
237 0.59
238 0.52
239 0.42
240 0.39
241 0.29
242 0.25
243 0.2
244 0.17
245 0.13
246 0.13
247 0.15
248 0.17
249 0.21
250 0.27
251 0.32
252 0.37
253 0.42
254 0.52
255 0.52
256 0.53
257 0.53
258 0.56
259 0.61
260 0.62
261 0.58
262 0.56
263 0.54
264 0.5
265 0.48
266 0.42
267 0.33
268 0.27
269 0.27
270 0.24
271 0.28
272 0.32
273 0.34
274 0.33
275 0.33
276 0.35
277 0.36
278 0.36
279 0.33
280 0.34
281 0.37
282 0.35
283 0.36
284 0.37
285 0.34
286 0.27
287 0.23
288 0.17
289 0.11
290 0.09
291 0.06
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.09
324 0.11
325 0.17
326 0.22
327 0.32
328 0.41
329 0.51
330 0.61
331 0.7
332 0.8
333 0.84
334 0.9
335 0.91
336 0.9
337 0.89
338 0.87
339 0.86
340 0.82
341 0.83
342 0.81
343 0.8
344 0.74
345 0.74
346 0.73
347 0.75
348 0.76
349 0.76
350 0.73
351 0.71
352 0.68
353 0.6
354 0.53
355 0.45
356 0.36
357 0.26
358 0.18
359 0.13
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.08
369 0.1
370 0.12
371 0.18
372 0.18
373 0.2
374 0.24
375 0.24
376 0.26
377 0.25
378 0.24
379 0.19
380 0.22
381 0.23
382 0.21
383 0.2
384 0.18
385 0.2
386 0.19
387 0.17
388 0.16
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.17
394 0.16
395 0.18
396 0.17
397 0.18
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.09
409 0.12
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.19
414 0.26
415 0.28
416 0.28
417 0.27
418 0.28
419 0.32
420 0.3
421 0.29
422 0.27
423 0.27
424 0.28
425 0.28
426 0.26
427 0.23
428 0.23
429 0.21
430 0.16
431 0.14
432 0.13
433 0.11
434 0.12
435 0.11
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.12
443 0.12
444 0.14
445 0.18
446 0.18
447 0.18
448 0.16
449 0.15
450 0.14
451 0.14
452 0.13
453 0.09
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.11
481 0.14
482 0.16
483 0.15
484 0.19
485 0.23
486 0.28
487 0.31
488 0.33
489 0.32
490 0.3
491 0.3
492 0.29
493 0.25
494 0.22
495 0.24
496 0.21
497 0.28
498 0.35
499 0.39
500 0.42
501 0.51
502 0.58
503 0.61
504 0.7
505 0.71
506 0.74
507 0.77
508 0.76
509 0.74
510 0.71
511 0.67
512 0.62
513 0.57
514 0.49
515 0.43
516 0.38
517 0.32
518 0.28
519 0.24
520 0.2
521 0.17
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.18
526 0.17
527 0.19
528 0.18
529 0.16
530 0.17
531 0.18
532 0.17
533 0.15
534 0.15
535 0.16
536 0.2
537 0.2
538 0.19
539 0.19
540 0.19