FuNGI

A0A081CDN2

Protein Details

Accession

A0A081CDN2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-124	SAQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDP	Hydrophilic
176-199	GGSARPPKSKLFKKKVREIHKAAD	Basic
741-760	LVQHFRKRLKSEPHIKDQLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
179-197	ARPPKSKLFKKKVREIHKA
563-575	RERKEKEAAKNKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPVKAEPSAATSVGNIKSEHGRAAANQRGRPANGNNPAAGRSSLKPDADEGEDKKNAPPPPPTTYRDIPLLSTDCGQWLTHLMKFAHHTRVDPNDSAQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPITDKYNRPMMGKDGQPLTWPAPDDDLQRIEEVIRKEVAAKGPGADQSLIAPGGSARPPKSKLFKKKVREIHKAADSARKTMKEEHFPWVLEDFETSDEWESIRTPIPTGARALQEHIDELKAKRDGKQASDSDVKMHDSTGGAVKIEASAAAASSSSSSTSHAPWVGKLEGDSGSEASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTLTNEQVELEYQKYQKTKEMDRWALRNKPVSASASTSKHEDSAAWRNWPQVNQLTLPTGMSFSTGRRRNLMAVHGGELLRDDDDDDGAGSRRRKRDDSPGAGYDELDYEEEFADDDEVHDPEADVAEDEEAKELEERLKREMARANHAGEEEEEEVVGAAEDEDQMLTGSGKQMMKIMRALAKRDGNEAYDKDDDGRNPYASDDSDDDEESYVANPEKAIQLAREERERKEKEAAKNKKSAPGTASVSGSNTPTDRVEKKPVQLGGAQASRPGAGHASLAQRATSPTRGASKIGSKQVSRSSSPSLVRGSSPGRAESPPGDTASAGTKRRADTQSTPATPSSTVRPEAKRVKTASRAASPTGSASGSKPASRAGSPGAPRVPANAVEAEIIQLIREGKIANTSELVQHFRKRLKSEPHIKDQLSAAVRKVAVMDKTTNRLKLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.26
3	0.22
4	0.22
5	0.27
6	0.29
7	0.29
8	0.25
9	0.24
10	0.26
11	0.35
12	0.41
13	0.42
14	0.43
15	0.47
16	0.51
17	0.52
18	0.54
19	0.51
20	0.53
21	0.55
22	0.55
23	0.5
24	0.47
25	0.46
26	0.41
27	0.37
28	0.31
29	0.24
30	0.29
31	0.32
32	0.32
33	0.31
34	0.31
35	0.33
36	0.34
37	0.38
38	0.33
39	0.36
40	0.37
41	0.38
42	0.39
43	0.42
44	0.41
45	0.39
46	0.44
47	0.42
48	0.47
49	0.54
50	0.54
51	0.55
52	0.56
53	0.54
54	0.52
55	0.47
56	0.4
57	0.39
58	0.38
59	0.31
60	0.29
61	0.25
62	0.21
63	0.21
64	0.2
65	0.15
66	0.17
67	0.18
68	0.19
69	0.24
70	0.23
71	0.25
72	0.3
73	0.35
74	0.39
75	0.37
76	0.37
77	0.38
78	0.46
79	0.48
80	0.44
81	0.43
82	0.39
83	0.39
84	0.39
85	0.34
86	0.3
87	0.25
88	0.25
89	0.25
90	0.29
91	0.36
92	0.44
93	0.5
94	0.57
95	0.66
96	0.75
97	0.8
98	0.8
99	0.82
100	0.83
101	0.86
102	0.86
103	0.84
104	0.84
105	0.83
106	0.79
107	0.74
108	0.68
109	0.64
110	0.56
111	0.53
112	0.51
113	0.49
114	0.45
115	0.44
116	0.47
117	0.42
118	0.41
119	0.37
120	0.35
121	0.36
122	0.38
123	0.38
124	0.35
125	0.33
126	0.33
127	0.33
128	0.3
129	0.26
130	0.24
131	0.2
132	0.21
133	0.23
134	0.24
135	0.25
136	0.25
137	0.23
138	0.22
139	0.21
140	0.18
141	0.21
142	0.2
143	0.19
144	0.17
145	0.16
146	0.18
147	0.21
148	0.24
149	0.22
150	0.2
151	0.18
152	0.2
153	0.21
154	0.22
155	0.18
156	0.14
157	0.13
158	0.14
159	0.13
160	0.1
161	0.09
162	0.07
163	0.1
164	0.13
165	0.16
166	0.17
167	0.23
168	0.27
169	0.34
170	0.44
171	0.52
172	0.6
173	0.67
174	0.73
175	0.77
176	0.83
177	0.86
178	0.86
179	0.86
180	0.81
181	0.79
182	0.76
183	0.7
184	0.63
185	0.62
186	0.53
187	0.49
188	0.47
189	0.41
190	0.37
191	0.42
192	0.46
193	0.46
194	0.47
195	0.47
196	0.46
197	0.44
198	0.43
199	0.35
200	0.29
201	0.2
202	0.18
203	0.13
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.09
210	0.1
211	0.09
212	0.1
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.15
217	0.17
218	0.17
219	0.19
220	0.21
221	0.21
222	0.21
223	0.23
224	0.21
225	0.2
226	0.2
227	0.18
228	0.16
229	0.15
230	0.16
231	0.19
232	0.22
233	0.23
234	0.26
235	0.32
236	0.34
237	0.36
238	0.43
239	0.39
240	0.4
241	0.44
242	0.4
243	0.35
244	0.33
245	0.31
246	0.23
247	0.22
248	0.17
249	0.12
250	0.13
251	0.14
252	0.13
253	0.11
254	0.1
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.07
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.1
272	0.12
273	0.14
274	0.14
275	0.14
276	0.18
277	0.17
278	0.15
279	0.15
280	0.14
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.05
305	0.06
306	0.11
307	0.11
308	0.12
309	0.13
310	0.17
311	0.17
312	0.21
313	0.23
314	0.26
315	0.3
316	0.37
317	0.45
318	0.47
319	0.53
320	0.55
321	0.61
322	0.53
323	0.53
324	0.53
325	0.53
326	0.49
327	0.42
328	0.37
329	0.29
330	0.29
331	0.25
332	0.19
333	0.12
334	0.12
335	0.15
336	0.17
337	0.18
338	0.22
339	0.25
340	0.29
341	0.34
342	0.42
343	0.47
344	0.48
345	0.54
346	0.55
347	0.56
348	0.54
349	0.51
350	0.43
351	0.37
352	0.36
353	0.32
354	0.27
355	0.25
356	0.26
357	0.23
358	0.23
359	0.23
360	0.21
361	0.19
362	0.18
363	0.15
364	0.15
365	0.21
366	0.23
367	0.23
368	0.24
369	0.27
370	0.28
371	0.28
372	0.27
373	0.22
374	0.22
375	0.2
376	0.2
377	0.18
378	0.17
379	0.16
380	0.12
381	0.09
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.16
387	0.22
388	0.22
389	0.24
390	0.25
391	0.26
392	0.27
393	0.28
394	0.23
395	0.19
396	0.19
397	0.19
398	0.18
399	0.15
400	0.14
401	0.12
402	0.08
403	0.07
404	0.06
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.09
412	0.13
413	0.18
414	0.23
415	0.27
416	0.31
417	0.34
418	0.44
419	0.5
420	0.53
421	0.53
422	0.51
423	0.49
424	0.45
425	0.41
426	0.31
427	0.21
428	0.15
429	0.1
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.1
458	0.14
459	0.15
460	0.17
461	0.22
462	0.22
463	0.25
464	0.31
465	0.3
466	0.33
467	0.35
468	0.34
469	0.31
470	0.31
471	0.27
472	0.21
473	0.21
474	0.15
475	0.11
476	0.1
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.05
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.14
497	0.15
498	0.16
499	0.17
500	0.19
501	0.21
502	0.23
503	0.26
504	0.29
505	0.32
506	0.31
507	0.33
508	0.32
509	0.28
510	0.3
511	0.28
512	0.26
513	0.22
514	0.22
515	0.2
516	0.21
517	0.2
518	0.21
519	0.23
520	0.19
521	0.18
522	0.19
523	0.19
524	0.17
525	0.18
526	0.15
527	0.14
528	0.15
529	0.15
530	0.15
531	0.13
532	0.13
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.15
545	0.2
546	0.23
547	0.3
548	0.33
549	0.36
550	0.45
551	0.47
552	0.45
553	0.49
554	0.54
555	0.56
556	0.63
557	0.7
558	0.66
559	0.72
560	0.7
561	0.69
562	0.64
563	0.57
564	0.49
565	0.45
566	0.43
567	0.37
568	0.36
569	0.28
570	0.28
571	0.25
572	0.23
573	0.18
574	0.14
575	0.13
576	0.14
577	0.19
578	0.22
579	0.26
580	0.34
581	0.37
582	0.41
583	0.45
584	0.45
585	0.41
586	0.39
587	0.37
588	0.34
589	0.33
590	0.29
591	0.24
592	0.22
593	0.2
594	0.18
595	0.17
596	0.11
597	0.08
598	0.09
599	0.12
600	0.15
601	0.17
602	0.17
603	0.16
604	0.16
605	0.18
606	0.21
607	0.2
608	0.18
609	0.2
610	0.25
611	0.26
612	0.27
613	0.28
614	0.33
615	0.37
616	0.44
617	0.45
618	0.4
619	0.44
620	0.51
621	0.51
622	0.46
623	0.43
624	0.41
625	0.43
626	0.44
627	0.43
628	0.38
629	0.35
630	0.32
631	0.33
632	0.3
633	0.28
634	0.28
635	0.27
636	0.27
637	0.26
638	0.29
639	0.26
640	0.28
641	0.25
642	0.24
643	0.23
644	0.2
645	0.2
646	0.24
647	0.29
648	0.26
649	0.28
650	0.31
651	0.32
652	0.4
653	0.43
654	0.42
655	0.41
656	0.48
657	0.54
658	0.52
659	0.53
660	0.46
661	0.45
662	0.39
663	0.35
664	0.33
665	0.28
666	0.3
667	0.34
668	0.38
669	0.45
670	0.54
671	0.58
672	0.58
673	0.58
674	0.62
675	0.64
676	0.67
677	0.65
678	0.63
679	0.6
680	0.55
681	0.52
682	0.45
683	0.38
684	0.33
685	0.26
686	0.2
687	0.18
688	0.23
689	0.23
690	0.23
691	0.22
692	0.24
693	0.27
694	0.26
695	0.27
696	0.25
697	0.3
698	0.32
699	0.38
700	0.37
701	0.35
702	0.34
703	0.35
704	0.33
705	0.27
706	0.27
707	0.22
708	0.2
709	0.19
710	0.18
711	0.16
712	0.14
713	0.12
714	0.09
715	0.1
716	0.1
717	0.09
718	0.11
719	0.11
720	0.1
721	0.17
722	0.19
723	0.19
724	0.2
725	0.2
726	0.24
727	0.27
728	0.32
729	0.3
730	0.35
731	0.4
732	0.46
733	0.52
734	0.53
735	0.59
736	0.64
737	0.7
738	0.74
739	0.76
740	0.8
741	0.81
742	0.76
743	0.7
744	0.62
745	0.59
746	0.53
747	0.47
748	0.38
749	0.35
750	0.34
751	0.31
752	0.31
753	0.28
754	0.26
755	0.28
756	0.34
757	0.34
758	0.42
759	0.48
760	0.53
761	0.51
762	0.5

A0A081CDN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer