Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A081CHE5

Protein Details
Accession A0A081CHE5    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-141AEDGTVRKKKKKRHHSPLGSPVHABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-132VRKKKKKRHH
178-188RAGRKKAPRKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MADEEQAQHELPPQSPIQSQPEDATSPVDAAPQPTTTQESAEQPEAEQPDVDELRAEDGHGSIDAAPSTSADANSLTTVVRSENTDAAAQTAAIFDEDDEDDDQDLPSFRRREARDAAEDGTVRKKKKKRHHSPLGSPVHASATREPEPEEEEDPYANMTEAEMRRARTDRMIEEALRAGRKKAPRKRAGEDDLDLLADEEVAALRREMVNAADDDEEANKLKKPATNKLKLLPKVVATLQKNHLQQSILDNNLLEGVKRWLEPLPDKSLPALNIQHQFFQILERMTIDTISLKMSGLGKVVVFYSMCNRVEPSIKRSAEHLIEVWSRPVLKRSSSYRDRHVASAEWNPDVLARTPATASQIVDNGRRNVGIPQAVTAGFRVAPQSTAGQRSDSSHEARMANHKRLNQFKSRLKEAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.31
4 0.32
5 0.33
6 0.34
7 0.32
8 0.34
9 0.32
10 0.3
11 0.28
12 0.21
13 0.19
14 0.17
15 0.18
16 0.15
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.23
23 0.2
24 0.22
25 0.23
26 0.26
27 0.29
28 0.31
29 0.29
30 0.25
31 0.3
32 0.3
33 0.27
34 0.22
35 0.18
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.16
40 0.14
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.12
77 0.1
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.16
95 0.17
96 0.19
97 0.27
98 0.29
99 0.36
100 0.42
101 0.46
102 0.45
103 0.46
104 0.46
105 0.4
106 0.38
107 0.33
108 0.35
109 0.34
110 0.33
111 0.39
112 0.44
113 0.51
114 0.61
115 0.71
116 0.73
117 0.79
118 0.87
119 0.88
120 0.91
121 0.92
122 0.88
123 0.78
124 0.66
125 0.56
126 0.48
127 0.39
128 0.31
129 0.24
130 0.23
131 0.24
132 0.25
133 0.25
134 0.22
135 0.24
136 0.24
137 0.22
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.11
144 0.08
145 0.07
146 0.05
147 0.1
148 0.11
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.2
153 0.22
154 0.23
155 0.22
156 0.25
157 0.22
158 0.25
159 0.26
160 0.24
161 0.23
162 0.25
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.17
167 0.2
168 0.28
169 0.37
170 0.43
171 0.52
172 0.58
173 0.64
174 0.68
175 0.72
176 0.69
177 0.63
178 0.55
179 0.47
180 0.38
181 0.31
182 0.25
183 0.16
184 0.11
185 0.06
186 0.05
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.11
210 0.13
211 0.18
212 0.27
213 0.36
214 0.43
215 0.45
216 0.51
217 0.57
218 0.57
219 0.55
220 0.47
221 0.38
222 0.33
223 0.32
224 0.32
225 0.26
226 0.29
227 0.29
228 0.34
229 0.34
230 0.33
231 0.32
232 0.26
233 0.25
234 0.27
235 0.28
236 0.23
237 0.21
238 0.2
239 0.18
240 0.19
241 0.18
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.15
250 0.19
251 0.23
252 0.28
253 0.28
254 0.28
255 0.28
256 0.29
257 0.27
258 0.26
259 0.25
260 0.22
261 0.27
262 0.28
263 0.28
264 0.25
265 0.25
266 0.21
267 0.2
268 0.18
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.12
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.28
299 0.31
300 0.32
301 0.36
302 0.36
303 0.36
304 0.37
305 0.41
306 0.35
307 0.33
308 0.29
309 0.24
310 0.26
311 0.26
312 0.25
313 0.21
314 0.2
315 0.2
316 0.24
317 0.22
318 0.23
319 0.29
320 0.35
321 0.43
322 0.51
323 0.56
324 0.58
325 0.62
326 0.62
327 0.58
328 0.53
329 0.46
330 0.41
331 0.43
332 0.38
333 0.31
334 0.28
335 0.26
336 0.24
337 0.24
338 0.21
339 0.17
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.17
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.21
349 0.22
350 0.27
351 0.32
352 0.31
353 0.3
354 0.29
355 0.28
356 0.27
357 0.29
358 0.28
359 0.23
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.2
365 0.16
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.19
373 0.22
374 0.26
375 0.27
376 0.27
377 0.27
378 0.3
379 0.34
380 0.34
381 0.34
382 0.33
383 0.37
384 0.36
385 0.38
386 0.45
387 0.48
388 0.52
389 0.53
390 0.55
391 0.59
392 0.68
393 0.71
394 0.71
395 0.73
396 0.73
397 0.75
398 0.79