Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A081CDG2

Protein Details
Accession A0A081CDG2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
489-516LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
495-507KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) extr 14, nucl 6.5, cyto_nucl 5, cyto 2.5, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MPQVPPNSTSAAADDALRNTFQIVHAFLAEHAPNAAAQLAATLPDSPAPPRTLASALVDHVRNSPRRSWPGLAAQAAAAPSSPTPMDEDSDSDSSSSDSSSSSSSSSSSDSDSDSDSSDSDSDSDSSDDGSDDSDSEEDKKVKAAKNEKPHQDHEAASSTIVSDSQDEAEAELPSKGIATPTGASSAGPSAAITHKRKRAASTSSSDSDSDDSDDESSDSDSSSDEDSDDESSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDNSDSDDDKEEPTVKTVETVVVEVASSDSDSDSDSDSSDSSDSSSDSDSDSDSSSDEEVVAKVSAPNGDGDDSSSSDSSDSSDSDSDSDSGSDSDSSSGSSSSGGSSSSSESGDESDSSSDSSSSSSSSSSGGSDSSSPSPKGPPAKRQKTDPEVAAVAATAAAAAVAAPVASTSTPSRPAPPAPATGSGRKPVGQNTPFQRVKADKVTYLDDRMKDMSYAGIGLNGDEYGARASRDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDVYGSHSIKFDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.2
16 0.19
17 0.16
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.22
39 0.22
40 0.23
41 0.24
42 0.22
43 0.21
44 0.25
45 0.25
46 0.23
47 0.27
48 0.32
49 0.34
50 0.37
51 0.42
52 0.46
53 0.52
54 0.57
55 0.55
56 0.54
57 0.57
58 0.59
59 0.53
60 0.44
61 0.38
62 0.33
63 0.29
64 0.23
65 0.14
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.11
72 0.12
73 0.15
74 0.15
75 0.17
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.18
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.18
128 0.24
129 0.27
130 0.36
131 0.43
132 0.47
133 0.57
134 0.66
135 0.71
136 0.7
137 0.7
138 0.67
139 0.6
140 0.53
141 0.46
142 0.41
143 0.32
144 0.26
145 0.22
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.11
179 0.19
180 0.23
181 0.3
182 0.35
183 0.4
184 0.42
185 0.44
186 0.47
187 0.46
188 0.47
189 0.45
190 0.45
191 0.42
192 0.42
193 0.38
194 0.32
195 0.26
196 0.21
197 0.17
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.07
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.12
374 0.15
375 0.17
376 0.18
377 0.19
378 0.21
379 0.26
380 0.35
381 0.38
382 0.44
383 0.53
384 0.63
385 0.65
386 0.7
387 0.75
388 0.73
389 0.72
390 0.63
391 0.56
392 0.46
393 0.42
394 0.34
395 0.24
396 0.16
397 0.11
398 0.08
399 0.04
400 0.03
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.03
410 0.03
411 0.06
412 0.08
413 0.11
414 0.16
415 0.18
416 0.22
417 0.25
418 0.28
419 0.33
420 0.34
421 0.36
422 0.35
423 0.41
424 0.41
425 0.44
426 0.45
427 0.42
428 0.41
429 0.38
430 0.37
431 0.36
432 0.42
433 0.38
434 0.43
435 0.45
436 0.53
437 0.53
438 0.51
439 0.52
440 0.46
441 0.5
442 0.51
443 0.48
444 0.41
445 0.43
446 0.48
447 0.44
448 0.47
449 0.46
450 0.38
451 0.38
452 0.36
453 0.34
454 0.28
455 0.25
456 0.2
457 0.15
458 0.15
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.11
473 0.14
474 0.17
475 0.18
476 0.2
477 0.26
478 0.28
479 0.3
480 0.33
481 0.31
482 0.34
483 0.39
484 0.45
485 0.5
486 0.58
487 0.66
488 0.73
489 0.82
490 0.85
491 0.9
492 0.91
493 0.9
494 0.9
495 0.88
496 0.86
497 0.84
498 0.78
499 0.67
500 0.56
501 0.47
502 0.37
503 0.33
504 0.27
505 0.19
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.17