Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0G4PFA7

Protein Details
Accession A0A0G4PFA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-445RRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 7, mito 6, plas 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIVSPVIEEQAQVVDGEEIPIDITRPNPNGEEQDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPADEQEMMMEIYKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKENDQKKEELHKMLAQQHATKTGEQLVREEVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPGWENLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPNHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSRPRGCRLCGQTGHKAEECLGRPKEKSGEFDEKQHAAPLKPFIWLHVAVLREYLAVELRVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNLPAMGSYLTKDGSVELKNAQIILQGLAKQEDAIFARRRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRSSPQRDLTAGSGGGEPAPPMELITPGRGHLNKETRELTHSMVINRGAVYRANMENKSAAAVLKSKLMKGNQDAGDSETPATDGEDVSSELPEQTSPGVLGKRKADVAEQEVTEAGTPGRDSPLPVPPVPEKPKQDETQEDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPKDLEFRHQVAREYAIGLCWVLRYYFQGCPSWTWYYPRHYAPFAADFVDIADMDVQFEKGTIFKPFEQLMGVLPASSNHALPKVFHPLMENPDSEIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVILLPFIDETRLLNAMAKVYPLLTEDEKSRNSHGQEVLLLSDRNPLYQDLVANFYSKKPGPAQYPLKEDVSGGLAGIVERSDTYIPHSSLVSPLEAHGMPGVDDDRSLTVLYTIPKTSHVHKSMLLRGVKLPTPMLDSNDIRATQTRSQNSGRSFGGAPFQGRGRGGRMNYSSDRPNPFAAHLDPKFNSGPQGGPGGAPMVPPGWVPPGQGYGGYARGPPPPPRGGMSHQYPPQYPPQHGYQQPGDYYGQQNNQYNQGGQYNNGHQSGYGQQDYRGGRGGNRGGRGRGGQNRDHYSHNQGGGGYNRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.45
8 0.44
9 0.4
10 0.38
11 0.3
12 0.27
13 0.25
14 0.17
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.09
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.11
26 0.17
27 0.19
28 0.22
29 0.24
30 0.28
31 0.33
32 0.34
33 0.36
34 0.32
35 0.35
36 0.33
37 0.33
38 0.29
39 0.24
40 0.22
41 0.18
42 0.15
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.42
55 0.47
56 0.47
57 0.5
58 0.51
59 0.54
60 0.46
61 0.41
62 0.36
63 0.31
64 0.28
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.15
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.15
74 0.19
75 0.24
76 0.3
77 0.38
78 0.47
79 0.48
80 0.47
81 0.49
82 0.47
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.71
110 0.72
111 0.69
112 0.66
113 0.71
114 0.68
115 0.6
116 0.55
117 0.49
118 0.42
119 0.46
120 0.48
121 0.44
122 0.44
123 0.46
124 0.48
125 0.53
126 0.55
127 0.49
128 0.46
129 0.43
130 0.46
131 0.43
132 0.37
133 0.33
134 0.35
135 0.34
136 0.3
137 0.3
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.27
142 0.2
143 0.19
144 0.2
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.21
149 0.19
150 0.2
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.21
155 0.22
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.2
175 0.27
176 0.26
177 0.29
178 0.29
179 0.3
180 0.34
181 0.31
182 0.28
183 0.22
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.15
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.21
205 0.28
206 0.29
207 0.31
208 0.35
209 0.41
210 0.48
211 0.52
212 0.59
213 0.59
214 0.64
215 0.65
216 0.62
217 0.64
218 0.56
219 0.48
220 0.38
221 0.31
222 0.26
223 0.25
224 0.2
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.19
247 0.18
248 0.2
249 0.2
250 0.18
251 0.21
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.27
256 0.25
257 0.27
258 0.34
259 0.36
260 0.42
261 0.45
262 0.49
263 0.55
264 0.57
265 0.59
266 0.52
267 0.46
268 0.39
269 0.39
270 0.36
271 0.35
272 0.34
273 0.33
274 0.33
275 0.36
276 0.41
277 0.37
278 0.38
279 0.37
280 0.44
281 0.42
282 0.47
283 0.49
284 0.44
285 0.41
286 0.41
287 0.36
288 0.27
289 0.29
290 0.27
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.21
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.18
299 0.19
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.09
310 0.12
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.22
317 0.25
318 0.24
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.12
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.1
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.17
397 0.17
398 0.24
399 0.25
400 0.28
401 0.32
402 0.41
403 0.45
404 0.52
405 0.58
406 0.57
407 0.64
408 0.68
409 0.72
410 0.72
411 0.69
412 0.68
413 0.69
414 0.69
415 0.66
416 0.68
417 0.66
418 0.66
419 0.68
420 0.61
421 0.55
422 0.51
423 0.55
424 0.53
425 0.52
426 0.51
427 0.5
428 0.53
429 0.6
430 0.69
431 0.72
432 0.75
433 0.77
434 0.79
435 0.75
436 0.71
437 0.63
438 0.54
439 0.44
440 0.34
441 0.24
442 0.15
443 0.11
444 0.09
445 0.08
446 0.06
447 0.04
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.06
453 0.07
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.12
458 0.13
459 0.15
460 0.2
461 0.26
462 0.26
463 0.3
464 0.31
465 0.28
466 0.31
467 0.31
468 0.25
469 0.22
470 0.22
471 0.19
472 0.19
473 0.19
474 0.16
475 0.15
476 0.14
477 0.1
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.12
482 0.15
483 0.15
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.12
489 0.1
490 0.07
491 0.09
492 0.09
493 0.13
494 0.13
495 0.14
496 0.17
497 0.18
498 0.2
499 0.21
500 0.27
501 0.24
502 0.24
503 0.24
504 0.24
505 0.23
506 0.2
507 0.18
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.06
528 0.09
529 0.1
530 0.13
531 0.14
532 0.16
533 0.16
534 0.17
535 0.16
536 0.16
537 0.18
538 0.18
539 0.17
540 0.16
541 0.15
542 0.14
543 0.13
544 0.11
545 0.06
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.09
553 0.15
554 0.18
555 0.18
556 0.21
557 0.22
558 0.3
559 0.34
560 0.38
561 0.36
562 0.39
563 0.45
564 0.44
565 0.45
566 0.42
567 0.43
568 0.46
569 0.43
570 0.38
571 0.32
572 0.31
573 0.28
574 0.23
575 0.17
576 0.1
577 0.09
578 0.11
579 0.14
580 0.13
581 0.13
582 0.14
583 0.18
584 0.19
585 0.19
586 0.17
587 0.14
588 0.15
589 0.19
590 0.2
591 0.19
592 0.18
593 0.18
594 0.26
595 0.25
596 0.27
597 0.26
598 0.25
599 0.28
600 0.29
601 0.28
602 0.22
603 0.24
604 0.22
605 0.2
606 0.18
607 0.12
608 0.11
609 0.09
610 0.08
611 0.06
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.08
616 0.11
617 0.14
618 0.16
619 0.18
620 0.19
621 0.21
622 0.25
623 0.27
624 0.25
625 0.27
626 0.29
627 0.32
628 0.36
629 0.38
630 0.36
631 0.33
632 0.33
633 0.31
634 0.3
635 0.25
636 0.21
637 0.17
638 0.14
639 0.13
640 0.12
641 0.09
642 0.07
643 0.07
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.07
653 0.09
654 0.11
655 0.12
656 0.15
657 0.16
658 0.16
659 0.16
660 0.15
661 0.13
662 0.13
663 0.12
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.11
668 0.11
669 0.1
670 0.09
671 0.11
672 0.11
673 0.13
674 0.16
675 0.21
676 0.21
677 0.21
678 0.23
679 0.24
680 0.3
681 0.31
682 0.28
683 0.21
684 0.23
685 0.22
686 0.19
687 0.16
688 0.11
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.09
694 0.1
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.14
699 0.14
700 0.14
701 0.16
702 0.15
703 0.17
704 0.18
705 0.17
706 0.15
707 0.14
708 0.14
709 0.16
710 0.17
711 0.15
712 0.14
713 0.13
714 0.11
715 0.11
716 0.1
717 0.06
718 0.05
719 0.07
720 0.08
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.1
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.11
732 0.11
733 0.12
734 0.15
735 0.2
736 0.22
737 0.24
738 0.26
739 0.29
740 0.29
741 0.33
742 0.32
743 0.28
744 0.27
745 0.26
746 0.24
747 0.21
748 0.19
749 0.14
750 0.19
751 0.17
752 0.16
753 0.17
754 0.16
755 0.16
756 0.17
757 0.19
758 0.14
759 0.17
760 0.17
761 0.18
762 0.18
763 0.16
764 0.2
765 0.19
766 0.21
767 0.22
768 0.27
769 0.31
770 0.4
771 0.48
772 0.48
773 0.53
774 0.53
775 0.5
776 0.45
777 0.4
778 0.31
779 0.24
780 0.18
781 0.12
782 0.09
783 0.08
784 0.07
785 0.08
786 0.06
787 0.04
788 0.04
789 0.06
790 0.06
791 0.06
792 0.12
793 0.17
794 0.18
795 0.19
796 0.19
797 0.18
798 0.2
799 0.21
800 0.17
801 0.12
802 0.12
803 0.15
804 0.14
805 0.13
806 0.12
807 0.11
808 0.1
809 0.11
810 0.11
811 0.07
812 0.07
813 0.08
814 0.08
815 0.09
816 0.09
817 0.08
818 0.08
819 0.1
820 0.13
821 0.15
822 0.15
823 0.15
824 0.19
825 0.22
826 0.27
827 0.34
828 0.35
829 0.35
830 0.38
831 0.44
832 0.46
833 0.51
834 0.47
835 0.39
836 0.39
837 0.41
838 0.39
839 0.34
840 0.28
841 0.22
842 0.27
843 0.27
844 0.26
845 0.29
846 0.27
847 0.29
848 0.32
849 0.31
850 0.26
851 0.28
852 0.3
853 0.31
854 0.39
855 0.39
856 0.41
857 0.45
858 0.51
859 0.5
860 0.48
861 0.42
862 0.37
863 0.34
864 0.3
865 0.31
866 0.27
867 0.25
868 0.23
869 0.24
870 0.24
871 0.24
872 0.24
873 0.23
874 0.27
875 0.27
876 0.32
877 0.34
878 0.38
879 0.4
880 0.43
881 0.45
882 0.46
883 0.5
884 0.45
885 0.46
886 0.41
887 0.39
888 0.39
889 0.36
890 0.39
891 0.36
892 0.39
893 0.37
894 0.39
895 0.38
896 0.35
897 0.34
898 0.26
899 0.25
900 0.21
901 0.23
902 0.2
903 0.18
904 0.17
905 0.16
906 0.14
907 0.13
908 0.11
909 0.08
910 0.08
911 0.08
912 0.1
913 0.12
914 0.13
915 0.14
916 0.15
917 0.18
918 0.18
919 0.18
920 0.18
921 0.16
922 0.18
923 0.18
924 0.17
925 0.17
926 0.22
927 0.26
928 0.31
929 0.36
930 0.37
931 0.39
932 0.4
933 0.44
934 0.45
935 0.48
936 0.49
937 0.5
938 0.51
939 0.53
940 0.51
941 0.5
942 0.53
943 0.51
944 0.47
945 0.42
946 0.45
947 0.5
948 0.52
949 0.55
950 0.51
951 0.51
952 0.48
953 0.48
954 0.42
955 0.37
956 0.39
957 0.39
958 0.38
959 0.4
960 0.45
961 0.44
962 0.49
963 0.47
964 0.44
965 0.4
966 0.4
967 0.35
968 0.31
969 0.35
970 0.35
971 0.38
972 0.37
973 0.34
974 0.28
975 0.3
976 0.33
977 0.34
978 0.31
979 0.27
980 0.27
981 0.34
982 0.36
983 0.35
984 0.33
985 0.28
986 0.27
987 0.34
988 0.42
989 0.41
990 0.46
991 0.49
992 0.46
993 0.49
994 0.51
995 0.52
996 0.52
997 0.53
998 0.53
999 0.58
1000 0.63
1001 0.61
1002 0.63
1003 0.58
1004 0.57
1005 0.57
1006 0.52
1007 0.45
1008 0.38
1009 0.4