FuNGI

A0A0G4PHA1

Protein Details

Accession

A0A0G4PHA1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
334-353	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
444-467	NTSGQAKRHGAKHKRGRNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
338-343	RRKKRK
450-461	KRHGAKHKRGRN
483-490	VRPEKAKV

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKQWIDKKNASKFQLFHRSQNDPLIHDTSADDRFLYQVGGPAPAPASTTSKKLPNLDDLRTEYGDSARENEGEAANYGVYYDDSSYDYMQHLRELGSGTGDAYFVEAKNEKAKGRAGRGMKLEDALRQVSLVDKDTYGQGTSTGPSLYGSQYGDMRSTASSFVRKPTYQDQQNVPDAIAGFKPDMDPRLREALEALEDEAFVEEGDADGIFGELTANAEELDEGDWEDSLFDHDVEDDGWESDATEKAPVQPDSTEAHRSMDTEGPAKPPMEPGEMPEHDEPAPDMEPTDQSWMNEFAKFKKDAKAGNAPVPAAPTIAASQTMASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTAGHRLLDDRFDKVEQLYSLDEEDEYDDSMSMISGMTGATGMTDMSTASSQAPSLIDGNGEAVHSRSTFNNVMDDFLSSWDPNTSGQAKRHGAKHKRGRNGNEAIGIRMLDEVRSGLGPARVRPEKAKVPARA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.71
3	0.72
4	0.65
5	0.63
6	0.62
7	0.62
8	0.58
9	0.64
10	0.56
11	0.48
12	0.49
13	0.45
14	0.37
15	0.32
16	0.3
17	0.26
18	0.26
19	0.23
20	0.19
21	0.15
22	0.16
23	0.16
24	0.15
25	0.11
26	0.13
27	0.13
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.16
34	0.14
35	0.2
36	0.19
37	0.24
38	0.28
39	0.33
40	0.38
41	0.42
42	0.43
43	0.47
44	0.51
45	0.5
46	0.52
47	0.5
48	0.5
49	0.46
50	0.43
51	0.33
52	0.29
53	0.28
54	0.22
55	0.21
56	0.18
57	0.17
58	0.18
59	0.19
60	0.18
61	0.16
62	0.16
63	0.13
64	0.11
65	0.1
66	0.09
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.09
73	0.11
74	0.11
75	0.12
76	0.13
77	0.15
78	0.15
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.15
83	0.15
84	0.14
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.08
91	0.08
92	0.09
93	0.07
94	0.11
95	0.12
96	0.13
97	0.19
98	0.22
99	0.22
100	0.24
101	0.31
102	0.33
103	0.38
104	0.44
105	0.42
106	0.44
107	0.47
108	0.47
109	0.41
110	0.38
111	0.33
112	0.28
113	0.27
114	0.22
115	0.18
116	0.15
117	0.14
118	0.15
119	0.16
120	0.16
121	0.13
122	0.13
123	0.13
124	0.15
125	0.15
126	0.13
127	0.11
128	0.09
129	0.09
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.1
136	0.09
137	0.11
138	0.1
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.12
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.15
150	0.16
151	0.2
152	0.25
153	0.25
154	0.28
155	0.34
156	0.41
157	0.44
158	0.48
159	0.49
160	0.49
161	0.52
162	0.48
163	0.4
164	0.32
165	0.26
166	0.21
167	0.16
168	0.11
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.12
174	0.13
175	0.14
176	0.16
177	0.22
178	0.22
179	0.21
180	0.21
181	0.18
182	0.17
183	0.16
184	0.14
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.06
190	0.04
191	0.04
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.02
200	0.02
201	0.03
202	0.02
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.08
237	0.11
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.14
242	0.15
243	0.17
244	0.18
245	0.15
246	0.16
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.17
251	0.15
252	0.14
253	0.15
254	0.15
255	0.16
256	0.16
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.15
262	0.16
263	0.22
264	0.22
265	0.26
266	0.24
267	0.24
268	0.2
269	0.2
270	0.18
271	0.13
272	0.13
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.13
279	0.11
280	0.11
281	0.13
282	0.16
283	0.16
284	0.18
285	0.18
286	0.18
287	0.22
288	0.25
289	0.25
290	0.29
291	0.31
292	0.32
293	0.37
294	0.44
295	0.42
296	0.44
297	0.43
298	0.37
299	0.33
300	0.31
301	0.25
302	0.16
303	0.13
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.1
321	0.12
322	0.17
323	0.26
324	0.36
325	0.43
326	0.47
327	0.56
328	0.63
329	0.71
330	0.75
331	0.78
332	0.78
333	0.8
334	0.81
335	0.72
336	0.64
337	0.54
338	0.43
339	0.34
340	0.25
341	0.17
342	0.13
343	0.12
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.1
348	0.11
349	0.14
350	0.14
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.18
355	0.24
356	0.23
357	0.22
358	0.22
359	0.22
360	0.23
361	0.21
362	0.22
363	0.16
364	0.17
365	0.16
366	0.15
367	0.15
368	0.14
369	0.13
370	0.1
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.11
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.11
415	0.17
416	0.2
417	0.21
418	0.25
419	0.24
420	0.25
421	0.24
422	0.24
423	0.19
424	0.18
425	0.19
426	0.14
427	0.14
428	0.14
429	0.14
430	0.13
431	0.19
432	0.22
433	0.25
434	0.3
435	0.38
436	0.43
437	0.48
438	0.55
439	0.6
440	0.64
441	0.7
442	0.76
443	0.77
444	0.81
445	0.85
446	0.84
447	0.83
448	0.81
449	0.75
450	0.72
451	0.63
452	0.55
453	0.47
454	0.39
455	0.3
456	0.24
457	0.2
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.1
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.17
466	0.2
467	0.22
468	0.32
469	0.35
470	0.39
471	0.44
472	0.49
473	0.53
474	0.6

A0A0G4PHA1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer