FuNGI

A0A0L6WCS4

Protein Details

Accession

A0A0L6WCS4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-58	DKPGGRKASSKIRSHRPRVID	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-55	PGGRKASSKIRSHRPR

Subcellular Location(s)

mito 10.5, cyto_mito 9.333, cyto 7, cyto_nucl 5.833, extr 4, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001611 Leu-rich_rpt IPR032675 LRR_dom_sf IPR032710 NTF2-like_dom_sf IPR018222 Nuclear_transport_factor_2_euk IPR030217 NXF_fam IPR005637 TAP_C_dom IPR009060 UBA-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0051028 P:mRNA transport
Pfam	View protein in Pfam PF03943 TAP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51450 LRR PS50177 NTF2_DOMAIN PS51281 TAP_C
CDD	cd14342 UBA_TAP-C

Amino Acid Sequences

MFSSPTPAPGSRAIANNALRNAGLIGADRDATMRDATDKPGGRKASSKIRSHRPRVIDIKDLRNPRSKAAMQAGPSEPLTIRGAGMRTTRIGAGGPLGNPRVRIKSKPVEVWREVVRKRWNPETQFLNLEGGALSIPSSLFFDFDANLHSLIDEEILKKNNIQPPGYGGGVKDAAVIFKLAKELTPKVKTLSLSNNKLQGIHLQLLSHYLPDLVNLSLQNNNIRTLKELDFLASRRGRLLNLKELVLTGNPVQVNSVGQDGGEKYRRDITSRFTSLEVLDQVAIAQIAFDGPGPSTAPATKPTASTFPVGMGASFITGVDGGIVSNFLVRFFNGMDTQRNLLINAYDPNATFSFSANTTIAARARVQGFHSSMPNQKKLTWAEWLAGGSRNLQRVGNHFDRALNSLHVGAEDAIKALAALPGTKHDITGPPERFCLDSFPILLGQGMGLLLTVHGQFTEVGTEGIRSFDRSFVLMPAPEGSRAKLNGWDVVIVSDQWTVRVYSSHEAWKPGPLLVQALSREEQQAQNAASAPALQPLTFDQQSQAALAAMPEPQRNLVMQVCQRTRLNVPFAVDCLTGNGWDLNRAIANFEEVKTTLSRDAFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.42
3	0.44
4	0.41
5	0.37
6	0.33
7	0.29
8	0.26
9	0.19
10	0.15
11	0.11
12	0.12
13	0.11
14	0.12
15	0.11
16	0.12
17	0.12
18	0.13
19	0.12
20	0.11
21	0.15
22	0.16
23	0.2
24	0.28
25	0.32
26	0.34
27	0.41
28	0.44
29	0.42
30	0.47
31	0.5
32	0.52
33	0.56
34	0.61
35	0.62
36	0.7
37	0.78
38	0.81
39	0.82
40	0.77
41	0.78
42	0.78
43	0.74
44	0.73
45	0.69
46	0.7
47	0.69
48	0.7
49	0.66
50	0.67
51	0.63
52	0.58
53	0.59
54	0.52
55	0.52
56	0.52
57	0.51
58	0.44
59	0.49
60	0.46
61	0.4
62	0.38
63	0.32
64	0.25
65	0.23
66	0.23
67	0.17
68	0.15
69	0.15
70	0.16
71	0.18
72	0.2
73	0.19
74	0.19
75	0.2
76	0.2
77	0.18
78	0.17
79	0.14
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.17
84	0.2
85	0.2
86	0.22
87	0.25
88	0.31
89	0.32
90	0.36
91	0.41
92	0.48
93	0.53
94	0.6
95	0.65
96	0.65
97	0.63
98	0.64
99	0.63
100	0.62
101	0.57
102	0.56
103	0.58
104	0.56
105	0.6
106	0.65
107	0.65
108	0.61
109	0.66
110	0.63
111	0.57
112	0.53
113	0.48
114	0.4
115	0.31
116	0.26
117	0.19
118	0.14
119	0.1
120	0.07
121	0.06
122	0.04
123	0.04
124	0.04
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.08
139	0.09
140	0.08
141	0.09
142	0.12
143	0.15
144	0.15
145	0.17
146	0.23
147	0.27
148	0.3
149	0.29
150	0.26
151	0.28
152	0.31
153	0.3
154	0.24
155	0.19
156	0.18
157	0.17
158	0.17
159	0.13
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.1
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.07
168	0.09
169	0.13
170	0.17
171	0.25
172	0.27
173	0.28
174	0.29
175	0.32
176	0.32
177	0.32
178	0.38
179	0.39
180	0.42
181	0.44
182	0.47
183	0.44
184	0.43
185	0.39
186	0.32
187	0.27
188	0.24
189	0.21
190	0.16
191	0.16
192	0.18
193	0.18
194	0.14
195	0.1
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.09
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.09
204	0.11
205	0.12
206	0.15
207	0.15
208	0.18
209	0.18
210	0.18
211	0.19
212	0.22
213	0.22
214	0.2
215	0.19
216	0.18
217	0.19
218	0.19
219	0.24
220	0.21
221	0.2
222	0.2
223	0.21
224	0.21
225	0.25
226	0.29
227	0.29
228	0.29
229	0.29
230	0.27
231	0.27
232	0.26
233	0.19
234	0.16
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.09
243	0.09
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.11
249	0.15
250	0.15
251	0.15
252	0.22
253	0.23
254	0.25
255	0.26
256	0.28
257	0.32
258	0.34
259	0.34
260	0.28
261	0.28
262	0.25
263	0.25
264	0.19
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.04
272	0.03
273	0.02
274	0.02
275	0.02
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.09
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.14
290	0.16
291	0.17
292	0.17
293	0.15
294	0.12
295	0.13
296	0.12
297	0.1
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.02
309	0.02
310	0.03
311	0.02
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.08
320	0.09
321	0.11
322	0.13
323	0.14
324	0.15
325	0.16
326	0.16
327	0.15
328	0.13
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.09
334	0.09
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.11
339	0.1
340	0.11
341	0.11
342	0.13
343	0.1
344	0.11
345	0.1
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.14
352	0.14
353	0.15
354	0.18
355	0.19
356	0.19
357	0.21
358	0.21
359	0.28
360	0.32
361	0.35
362	0.32
363	0.31
364	0.35
365	0.35
366	0.34
367	0.32
368	0.28
369	0.24
370	0.24
371	0.24
372	0.19
373	0.18
374	0.17
375	0.15
376	0.17
377	0.19
378	0.18
379	0.19
380	0.19
381	0.22
382	0.29
383	0.29
384	0.28
385	0.27
386	0.27
387	0.27
388	0.28
389	0.25
390	0.18
391	0.14
392	0.13
393	0.13
394	0.11
395	0.1
396	0.08
397	0.08
398	0.07
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.08
409	0.12
410	0.13
411	0.12
412	0.13
413	0.17
414	0.21
415	0.3
416	0.32
417	0.29
418	0.3
419	0.31
420	0.31
421	0.27
422	0.27
423	0.21
424	0.19
425	0.18
426	0.18
427	0.17
428	0.16
429	0.15
430	0.1
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.15
460	0.17
461	0.15
462	0.15
463	0.15
464	0.15
465	0.18
466	0.18
467	0.17
468	0.19
469	0.2
470	0.21
471	0.23
472	0.24
473	0.24
474	0.23
475	0.23
476	0.19
477	0.18
478	0.17
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.11
483	0.11
484	0.12
485	0.11
486	0.11
487	0.13
488	0.15
489	0.17
490	0.21
491	0.28
492	0.29
493	0.32
494	0.33
495	0.36
496	0.34
497	0.3
498	0.29
499	0.22
500	0.22
501	0.2
502	0.24
503	0.2
504	0.22
505	0.22
506	0.21
507	0.22
508	0.23
509	0.23
510	0.21
511	0.24
512	0.22
513	0.22
514	0.22
515	0.2
516	0.17
517	0.17
518	0.15
519	0.15
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.15
524	0.22
525	0.21
526	0.22
527	0.19
528	0.2
529	0.21
530	0.21
531	0.18
532	0.11
533	0.11
534	0.1
535	0.1
536	0.11
537	0.13
538	0.14
539	0.15
540	0.16
541	0.17
542	0.18
543	0.21
544	0.2
545	0.25
546	0.29
547	0.38
548	0.39
549	0.43
550	0.44
551	0.44
552	0.48
553	0.47
554	0.47
555	0.41
556	0.42
557	0.38
558	0.38
559	0.37
560	0.31
561	0.24
562	0.22
563	0.19
564	0.16
565	0.15
566	0.17
567	0.14
568	0.16
569	0.17
570	0.15
571	0.17
572	0.17
573	0.18
574	0.15
575	0.2
576	0.19
577	0.2
578	0.21
579	0.19
580	0.21
581	0.2
582	0.23
583	0.24

A0A0L6WCS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer