Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6X238

Protein Details
Accession A0A0L6X238    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-59EDNYAKRREREDKERESKRIABasic
91-117VDDTMKWIRRSKKKEKELARKRQEELEBasic
274-300EGDVGFKKPKTKKKRPSRRVADDQTDMBasic
336-357ALARSRKAKLRQSKKKMTPEELHydrophilic
671-698VQPLTKGKTEKTKKKKEGKNAQRQAEFMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-69KRREREDKERESKRIADRIAKVRNRK
99-112RRSKKKEKELARKR
280-292KKPKTKKKRPSRR
340-351SRKAKLRQSKKK
599-617HKFHGKGSGKAKTEKRLKK
677-689GKTEKTKKKKEGK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSLEESISLEETNKIRISLGLKPLSEDAPTSNDKDKQAEDNYAKRREREDKERESKRIADRIAKVRNRKELNASLKGTTLGGADANDDADVDDTMKWIRRSKKKEKELARKRQEELESMDRAFQDEYTERDLEGLKVSHDFDEMDEGEARILTLKDSRILDNEEDELQNIEMAEAERTKKTNELKIKRRDYTGYDDEEFVDGTQGMKRAVLAKYDEDINGPQETGFRLGSSVISTKARMEEEKQQAAASVNKSLLSIDYTSQYKNLEINDYLKEGDVGFKKPKTKKKRPSRRVADDQTDMNMDMNMSMDVDEKPIVVPRVRDLDANFVDDDDLQAALARSRKAKLRQSKKKMTPEELAQKIADERAREEAVGVGVGVGKVEAGGEGGGLTFDETSEFVRVVGVDPVGVVKTKTEEVQIKRERSSSRDVSMGPGDQPVEEIEAGEVVVKDEDEGEEDEMAMLDAIEDAIRANEDDDVGATSSEQTFSSGMASTLNILRQQGLLSAPAADQSDREKTQLERDVWLADMRRRVAQREVERLQSRGSNKDQAQREYENRMREQQEARDNLEMFRAYKPDVNIVYYDEFGRTLTPKEAWKALSHKFHGKGSGKAKTEKRLKKIAEEQKQAAMASGDTPLSMNSAFQQRQQKTGQAHFVLSVGNRGAVPQAADFVDVQPLTKGKTEKTKKKKEGKNAQRQAEFMTVPAGQVQEESVSRSNSPAPRPGFSRIGTAVDTPTSTPVAGERSKVAFGFGTKRKAGEEAVGTPAAKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.38
10 0.4
11 0.37
12 0.34
13 0.28
14 0.22
15 0.22
16 0.25
17 0.27
18 0.31
19 0.35
20 0.37
21 0.39
22 0.4
23 0.42
24 0.43
25 0.49
26 0.49
27 0.54
28 0.6
29 0.65
30 0.66
31 0.62
32 0.66
33 0.67
34 0.69
35 0.7
36 0.72
37 0.73
38 0.8
39 0.85
40 0.82
41 0.78
42 0.77
43 0.75
44 0.72
45 0.67
46 0.65
47 0.64
48 0.68
49 0.73
50 0.73
51 0.74
52 0.74
53 0.79
54 0.76
55 0.72
56 0.71
57 0.7
58 0.71
59 0.69
60 0.64
61 0.55
62 0.5
63 0.46
64 0.38
65 0.29
66 0.2
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.1
82 0.16
83 0.19
84 0.25
85 0.35
86 0.45
87 0.55
88 0.65
89 0.74
90 0.79
91 0.86
92 0.89
93 0.91
94 0.91
95 0.93
96 0.92
97 0.88
98 0.8
99 0.79
100 0.71
101 0.64
102 0.6
103 0.55
104 0.48
105 0.42
106 0.41
107 0.33
108 0.31
109 0.27
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.2
114 0.22
115 0.23
116 0.21
117 0.22
118 0.23
119 0.19
120 0.2
121 0.17
122 0.13
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.11
141 0.12
142 0.16
143 0.18
144 0.2
145 0.21
146 0.25
147 0.25
148 0.24
149 0.24
150 0.22
151 0.2
152 0.19
153 0.17
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.22
167 0.27
168 0.35
169 0.43
170 0.51
171 0.59
172 0.68
173 0.76
174 0.73
175 0.72
176 0.67
177 0.61
178 0.6
179 0.56
180 0.51
181 0.43
182 0.4
183 0.37
184 0.33
185 0.28
186 0.19
187 0.14
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.14
196 0.15
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.21
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.19
227 0.27
228 0.33
229 0.35
230 0.34
231 0.31
232 0.3
233 0.3
234 0.31
235 0.23
236 0.18
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.14
241 0.13
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.15
260 0.14
261 0.11
262 0.15
263 0.14
264 0.17
265 0.2
266 0.24
267 0.32
268 0.4
269 0.5
270 0.56
271 0.65
272 0.72
273 0.79
274 0.87
275 0.89
276 0.92
277 0.93
278 0.92
279 0.91
280 0.87
281 0.82
282 0.73
283 0.63
284 0.53
285 0.43
286 0.33
287 0.23
288 0.16
289 0.1
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.12
306 0.17
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.23
311 0.22
312 0.24
313 0.21
314 0.16
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.07
319 0.06
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.06
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.2
329 0.26
330 0.35
331 0.44
332 0.53
333 0.63
334 0.71
335 0.8
336 0.82
337 0.85
338 0.82
339 0.77
340 0.69
341 0.65
342 0.64
343 0.56
344 0.48
345 0.38
346 0.33
347 0.27
348 0.26
349 0.21
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.07
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.11
401 0.17
402 0.2
403 0.3
404 0.36
405 0.38
406 0.38
407 0.42
408 0.4
409 0.37
410 0.42
411 0.35
412 0.3
413 0.3
414 0.29
415 0.27
416 0.27
417 0.24
418 0.17
419 0.14
420 0.13
421 0.1
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.04
447 0.03
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.11
497 0.16
498 0.16
499 0.17
500 0.18
501 0.19
502 0.26
503 0.33
504 0.31
505 0.27
506 0.27
507 0.27
508 0.26
509 0.27
510 0.23
511 0.18
512 0.21
513 0.21
514 0.25
515 0.26
516 0.28
517 0.32
518 0.38
519 0.41
520 0.45
521 0.46
522 0.5
523 0.5
524 0.48
525 0.44
526 0.41
527 0.37
528 0.35
529 0.36
530 0.36
531 0.38
532 0.45
533 0.49
534 0.47
535 0.5
536 0.49
537 0.49
538 0.5
539 0.51
540 0.49
541 0.46
542 0.49
543 0.46
544 0.46
545 0.46
546 0.44
547 0.48
548 0.45
549 0.45
550 0.43
551 0.41
552 0.36
553 0.35
554 0.29
555 0.22
556 0.21
557 0.2
558 0.17
559 0.19
560 0.2
561 0.23
562 0.23
563 0.23
564 0.21
565 0.23
566 0.23
567 0.2
568 0.2
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.13
573 0.11
574 0.12
575 0.14
576 0.16
577 0.19
578 0.22
579 0.25
580 0.25
581 0.29
582 0.33
583 0.37
584 0.43
585 0.44
586 0.49
587 0.49
588 0.49
589 0.53
590 0.51
591 0.51
592 0.51
593 0.55
594 0.51
595 0.57
596 0.6
597 0.6
598 0.68
599 0.68
600 0.67
601 0.68
602 0.67
603 0.68
604 0.73
605 0.74
606 0.73
607 0.72
608 0.67
609 0.61
610 0.6
611 0.51
612 0.41
613 0.31
614 0.21
615 0.15
616 0.14
617 0.1
618 0.08
619 0.09
620 0.08
621 0.09
622 0.08
623 0.08
624 0.1
625 0.18
626 0.19
627 0.25
628 0.35
629 0.35
630 0.41
631 0.44
632 0.47
633 0.45
634 0.51
635 0.53
636 0.44
637 0.44
638 0.38
639 0.36
640 0.31
641 0.25
642 0.22
643 0.14
644 0.13
645 0.12
646 0.12
647 0.13
648 0.11
649 0.12
650 0.09
651 0.11
652 0.1
653 0.12
654 0.12
655 0.11
656 0.15
657 0.14
658 0.14
659 0.14
660 0.15
661 0.16
662 0.2
663 0.22
664 0.22
665 0.34
666 0.44
667 0.53
668 0.63
669 0.72
670 0.78
671 0.86
672 0.91
673 0.91
674 0.92
675 0.92
676 0.93
677 0.91
678 0.89
679 0.82
680 0.74
681 0.67
682 0.61
683 0.5
684 0.39
685 0.32
686 0.23
687 0.2
688 0.2
689 0.16
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.11
694 0.11
695 0.16
696 0.17
697 0.19
698 0.2
699 0.22
700 0.28
701 0.32
702 0.36
703 0.4
704 0.4
705 0.42
706 0.46
707 0.5
708 0.49
709 0.44
710 0.45
711 0.39
712 0.38
713 0.36
714 0.33
715 0.29
716 0.24
717 0.24
718 0.19
719 0.19
720 0.17
721 0.15
722 0.14
723 0.14
724 0.2
725 0.2
726 0.21
727 0.23
728 0.25
729 0.27
730 0.27
731 0.26
732 0.22
733 0.24
734 0.31
735 0.34
736 0.38
737 0.38
738 0.39
739 0.39
740 0.4
741 0.38
742 0.35
743 0.33
744 0.29
745 0.32
746 0.33
747 0.31