Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6W7D8

Protein Details
Accession A0A0L6W7D8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-270VGKTKTVPKARAKKEEKQFIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-53PARTSQKPRGGPAARGGK
85-107RKFEARGRGRGGRGGAQRGGRRP
257-266PKARAKKEEK
273-311ARFERPDRGGRGRGGRGGDRGGDRARGGGRGRGGARGNR
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13.5, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFALLEADDSSRPPSPAPAAPAPAAPPAPARTSQKPRGGPAARGGKYYARGGANKPAFKDANPNQNGVEEPAAAEGQRKFEARGRGRGGRGGAQRGGRRPFDKHSQTGKTDSDKKIQQSWGGADGNTELKVEEAAVVDATAEANEWTVDAGNNAEWDTPAQDGAADPAPAAEGDKADGRPRREKEPEEEDNTLTLDQYLAQQKEKESIVPKLETTRQANEGADSNIWKDAVPLSKADEDSYFVGKTKTVPKARAKKEEKQFIEIDARFERPDRGGRGRGGRGGDRGGDRARGGGRGRGGARGNRPTAPLVVNVDDQTAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.2
4 0.22
5 0.22
6 0.21
7 0.18
8 0.2
9 0.23
10 0.26
11 0.32
12 0.33
13 0.34
14 0.34
15 0.35
16 0.32
17 0.31
18 0.28
19 0.22
20 0.21
21 0.2
22 0.23
23 0.27
24 0.32
25 0.38
26 0.47
27 0.55
28 0.6
29 0.62
30 0.62
31 0.68
32 0.65
33 0.58
34 0.58
35 0.6
36 0.52
37 0.49
38 0.47
39 0.41
40 0.4
41 0.39
42 0.35
43 0.29
44 0.31
45 0.33
46 0.4
47 0.44
48 0.43
49 0.42
50 0.43
51 0.4
52 0.38
53 0.45
54 0.41
55 0.45
56 0.44
57 0.44
58 0.38
59 0.38
60 0.38
61 0.3
62 0.24
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.13
69 0.12
70 0.14
71 0.16
72 0.17
73 0.18
74 0.23
75 0.33
76 0.35
77 0.42
78 0.45
79 0.49
80 0.49
81 0.51
82 0.47
83 0.44
84 0.43
85 0.39
86 0.36
87 0.36
88 0.39
89 0.42
90 0.45
91 0.42
92 0.41
93 0.41
94 0.42
95 0.47
96 0.49
97 0.5
98 0.53
99 0.54
100 0.54
101 0.55
102 0.53
103 0.5
104 0.52
105 0.48
106 0.46
107 0.45
108 0.45
109 0.46
110 0.44
111 0.39
112 0.33
113 0.32
114 0.3
115 0.26
116 0.23
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.07
169 0.08
170 0.13
171 0.17
172 0.21
173 0.29
174 0.32
175 0.39
176 0.43
177 0.46
178 0.47
179 0.52
180 0.53
181 0.5
182 0.49
183 0.42
184 0.36
185 0.34
186 0.27
187 0.19
188 0.13
189 0.07
190 0.06
191 0.09
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.18
196 0.18
197 0.22
198 0.22
199 0.22
200 0.2
201 0.24
202 0.26
203 0.26
204 0.26
205 0.27
206 0.3
207 0.33
208 0.33
209 0.31
210 0.3
211 0.31
212 0.31
213 0.27
214 0.26
215 0.21
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.18
228 0.2
229 0.21
230 0.21
231 0.19
232 0.17
233 0.18
234 0.2
235 0.17
236 0.14
237 0.15
238 0.14
239 0.17
240 0.23
241 0.3
242 0.34
243 0.41
244 0.51
245 0.61
246 0.69
247 0.76
248 0.76
249 0.76
250 0.8
251 0.83
252 0.76
253 0.71
254 0.64
255 0.57
256 0.59
257 0.5
258 0.44
259 0.37
260 0.35
261 0.3
262 0.31
263 0.29
264 0.24
265 0.3
266 0.32
267 0.36
268 0.4
269 0.45
270 0.51
271 0.52
272 0.53
273 0.51
274 0.47
275 0.43
276 0.41
277 0.39
278 0.34
279 0.34
280 0.32
281 0.3
282 0.27
283 0.28
284 0.27
285 0.28
286 0.28
287 0.29
288 0.29
289 0.33
290 0.33
291 0.36
292 0.39
293 0.41
294 0.47
295 0.5
296 0.52
297 0.48
298 0.49
299 0.45
300 0.44
301 0.38
302 0.34
303 0.3
304 0.29
305 0.3
306 0.27
307 0.27
308 0.23
309 0.22
310 0.2