Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9TVM7

Protein Details
Accession A0A0C9TVM7    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-192TAASSEKPKKEKKHKDKTSKSIETVHydrophilic
218-244SDATEKKEKKEKKEKKKKEANGETPAABasic
251-278VEEGKRDDSKEKKKKKKSKDETPTADNSBasic
282-320VDTQEDSKKEKKSKKEKKEKKEKSEKKRKAEKQGDELTLBasic
325-351ASEGDHSDKKSKKRKRESKDVQEDADLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-184SSEKPKKEKKHKDK
223-236KKEKKEKKEKKKKE
258-269DSKEKKKKKKSK
289-313KKEKKSKKEKKEKKEKSEKKRKAEK
333-341KKSKKRKRE
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MVSFQCHGCSDVVKKPKLDQHHSRCHTGFDCIDCSVTFNTPAEYKGHTSCITEAEKYQKTLYKGPKNQTENGADQHWSQGGANGGGGFQGRGRGRGGFQGRGGYQNGRQSRYEGTGANGTPLGTPQRMSPMATPPDTTPSKPVESSANARISQEKPDPAPSFEKPKETAASSEKPKKEKKHKDKTSKSIETVGDSKSQAGESTVDPASVPLPSSEKPSDATEKKEKKEKKEKKKKEANGETPAADESTMDVEEGKRDDSKEKKKKKKSKDETPTADNSNMDVDTQEDSKKEKKSKKEKKEKKEKSEKKRKAEKQGDELTLPTSAASEGDHSDKKSKKRKRESKDVQEDADLAVTNAAEGEEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.55
4 0.6
5 0.64
6 0.66
7 0.67
8 0.74
9 0.77
10 0.77
11 0.71
12 0.67
13 0.59
14 0.54
15 0.47
16 0.4
17 0.38
18 0.31
19 0.31
20 0.25
21 0.26
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.16
26 0.18
27 0.18
28 0.19
29 0.19
30 0.2
31 0.22
32 0.22
33 0.26
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.3
38 0.29
39 0.27
40 0.28
41 0.32
42 0.34
43 0.34
44 0.37
45 0.36
46 0.37
47 0.44
48 0.51
49 0.53
50 0.59
51 0.65
52 0.7
53 0.71
54 0.71
55 0.69
56 0.64
57 0.57
58 0.52
59 0.46
60 0.37
61 0.32
62 0.3
63 0.23
64 0.19
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.07
75 0.05
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.25
83 0.29
84 0.25
85 0.26
86 0.29
87 0.28
88 0.3
89 0.31
90 0.26
91 0.26
92 0.31
93 0.34
94 0.32
95 0.32
96 0.31
97 0.32
98 0.33
99 0.31
100 0.24
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.21
105 0.19
106 0.15
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.16
114 0.16
115 0.18
116 0.19
117 0.23
118 0.26
119 0.27
120 0.27
121 0.22
122 0.28
123 0.28
124 0.27
125 0.23
126 0.23
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.21
131 0.23
132 0.26
133 0.28
134 0.29
135 0.27
136 0.28
137 0.31
138 0.28
139 0.3
140 0.29
141 0.25
142 0.22
143 0.29
144 0.3
145 0.28
146 0.32
147 0.28
148 0.34
149 0.34
150 0.36
151 0.31
152 0.32
153 0.31
154 0.27
155 0.29
156 0.25
157 0.29
158 0.32
159 0.39
160 0.4
161 0.45
162 0.51
163 0.57
164 0.63
165 0.68
166 0.73
167 0.76
168 0.83
169 0.87
170 0.9
171 0.9
172 0.89
173 0.82
174 0.73
175 0.67
176 0.57
177 0.48
178 0.41
179 0.33
180 0.25
181 0.21
182 0.19
183 0.14
184 0.14
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.07
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.05
198 0.08
199 0.09
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.17
204 0.2
205 0.27
206 0.26
207 0.33
208 0.38
209 0.44
210 0.47
211 0.55
212 0.58
213 0.6
214 0.7
215 0.74
216 0.75
217 0.8
218 0.87
219 0.88
220 0.93
221 0.91
222 0.91
223 0.91
224 0.87
225 0.83
226 0.75
227 0.64
228 0.54
229 0.46
230 0.35
231 0.24
232 0.15
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.2
245 0.29
246 0.4
247 0.49
248 0.59
249 0.68
250 0.78
251 0.87
252 0.91
253 0.93
254 0.92
255 0.93
256 0.93
257 0.93
258 0.89
259 0.85
260 0.79
261 0.71
262 0.62
263 0.51
264 0.4
265 0.32
266 0.25
267 0.18
268 0.13
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.16
275 0.22
276 0.31
277 0.39
278 0.45
279 0.54
280 0.64
281 0.74
282 0.82
283 0.87
284 0.9
285 0.92
286 0.95
287 0.95
288 0.95
289 0.96
290 0.95
291 0.95
292 0.96
293 0.94
294 0.94
295 0.94
296 0.92
297 0.92
298 0.92
299 0.88
300 0.87
301 0.85
302 0.78
303 0.68
304 0.59
305 0.49
306 0.4
307 0.31
308 0.21
309 0.13
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.16
316 0.19
317 0.22
318 0.3
319 0.37
320 0.46
321 0.55
322 0.62
323 0.68
324 0.77
325 0.85
326 0.86
327 0.91
328 0.92
329 0.93
330 0.94
331 0.89
332 0.8
333 0.72
334 0.63
335 0.52
336 0.42
337 0.31
338 0.2
339 0.15
340 0.11
341 0.09
342 0.08