Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9T0H6

Protein Details
Accession A0A0C9T0H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28EVIAARPKSHRRTGRRGSAKTQHydrophilic
177-197SRGIRRGRGRGRKGTERSPKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-22KSHRRTGRR
173-195ARPASRGIRRGRGRGRKGTERSP
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 11.666, nucl 4, cyto_nucl 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDQSLDEVIAARPKSHRRTGRRGSAKTQVLGHPANAAARTAAQNSAAAKVVAAAAPPSHPADKIIVSNLPADVNEVQIKELFHSTVGPLRDVTLHHDSAGRSKGVAAIHFQRKGDGTKAYQQYNNRLIDGKRPMKIEIVVDPARPAPPQSLASRVAPPSAAAAVSVVPNARVARPASRGIRRGRGRGRKGTERSPKSAADLDAEMEDYTASNIAAPAATVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.48
3 0.57
4 0.6
5 0.71
6 0.79
7 0.83
8 0.84
9 0.83
10 0.79
11 0.79
12 0.75
13 0.67
14 0.61
15 0.54
16 0.49
17 0.44
18 0.38
19 0.3
20 0.26
21 0.25
22 0.21
23 0.18
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.16
33 0.15
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.09
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.1
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.18
84 0.18
85 0.21
86 0.22
87 0.16
88 0.12
89 0.12
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.17
95 0.22
96 0.24
97 0.23
98 0.21
99 0.22
100 0.23
101 0.23
102 0.19
103 0.17
104 0.23
105 0.27
106 0.28
107 0.31
108 0.32
109 0.36
110 0.4
111 0.39
112 0.32
113 0.31
114 0.29
115 0.32
116 0.39
117 0.37
118 0.33
119 0.34
120 0.34
121 0.33
122 0.34
123 0.28
124 0.21
125 0.24
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.16
133 0.11
134 0.13
135 0.16
136 0.17
137 0.2
138 0.22
139 0.24
140 0.27
141 0.25
142 0.23
143 0.19
144 0.18
145 0.15
146 0.13
147 0.1
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.12
159 0.14
160 0.18
161 0.22
162 0.28
163 0.34
164 0.4
165 0.46
166 0.5
167 0.58
168 0.59
169 0.65
170 0.69
171 0.72
172 0.73
173 0.76
174 0.79
175 0.79
176 0.8
177 0.81
178 0.81
179 0.77
180 0.75
181 0.69
182 0.62
183 0.57
184 0.54
185 0.45
186 0.38
187 0.32
188 0.27
189 0.23
190 0.23
191 0.18
192 0.13
193 0.12
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06