Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9SSB3

Protein Details
Accession A0A0C9SSB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-36LEAPIVHSKSKKKDKSSKKRSKHTAVVTANHHydrophilic
239-270IDKEVQPKESKGKKRKVEVEIPKKSKKHKSNVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-27KSKKKDKSSKKRSK
246-268KESKGKKRKVEVEIPKKSKKHKS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.499, cyto_nucl 10.166, mito 8, cyto_mito 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSSLGLEAPIVHSKSKKKDKSSKKRSKHTAVVTANHEKNEGDDPHWAYEPPAGAVLLDHTIESKPFEWDAIKDDEDTEIWLIRVPDSIKAKHLEGLEIDPPSSSRTARVGSLTRKTVTYDVWSIGDDDTEVVGGEELRGLSCLIPRTKKRGKLCIAPKTISRHIVISAQPTVPTVPEHQPIVHQNPPRPSYPKAVLKHRFVPYGARSEQSQSEDLPMDVDATNTPATKPADTMETSPPIDKEVQPKESKGKKRKVEVEIPKKSKKHKSNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.55
3 0.6
4 0.65
5 0.74
6 0.83
7 0.88
8 0.92
9 0.92
10 0.92
11 0.94
12 0.94
13 0.93
14 0.91
15 0.88
16 0.87
17 0.82
18 0.77
19 0.74
20 0.73
21 0.66
22 0.57
23 0.49
24 0.38
25 0.34
26 0.35
27 0.3
28 0.22
29 0.26
30 0.27
31 0.29
32 0.3
33 0.28
34 0.22
35 0.22
36 0.21
37 0.16
38 0.14
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.17
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.12
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.11
72 0.16
73 0.2
74 0.21
75 0.22
76 0.24
77 0.25
78 0.26
79 0.26
80 0.21
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.17
85 0.16
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.09
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.2
97 0.24
98 0.29
99 0.3
100 0.28
101 0.27
102 0.28
103 0.26
104 0.22
105 0.2
106 0.17
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.06
129 0.09
130 0.12
131 0.18
132 0.21
133 0.29
134 0.36
135 0.44
136 0.48
137 0.54
138 0.56
139 0.59
140 0.66
141 0.67
142 0.65
143 0.59
144 0.57
145 0.55
146 0.53
147 0.47
148 0.38
149 0.3
150 0.26
151 0.28
152 0.25
153 0.21
154 0.2
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.2
167 0.25
168 0.29
169 0.32
170 0.32
171 0.35
172 0.41
173 0.44
174 0.45
175 0.44
176 0.41
177 0.42
178 0.46
179 0.5
180 0.49
181 0.57
182 0.6
183 0.61
184 0.67
185 0.63
186 0.57
187 0.49
188 0.5
189 0.43
190 0.44
191 0.4
192 0.33
193 0.3
194 0.31
195 0.34
196 0.3
197 0.28
198 0.21
199 0.22
200 0.22
201 0.2
202 0.18
203 0.14
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.08
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.14
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.2
218 0.21
219 0.24
220 0.24
221 0.27
222 0.28
223 0.29
224 0.27
225 0.26
226 0.28
227 0.28
228 0.32
229 0.35
230 0.42
231 0.43
232 0.47
233 0.55
234 0.61
235 0.69
236 0.7
237 0.72
238 0.73
239 0.8
240 0.86
241 0.84
242 0.85
243 0.86
244 0.86
245 0.87
246 0.87
247 0.86
248 0.83
249 0.84
250 0.84