Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9SYF5

Protein Details
Accession A0A0C9SYF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-152MLSLRRPPRRRVHLPRRHLPHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-148RRPPRRRVHLPRRH
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044867  DEUBAD_dom  
IPR006773  Rpn13/ADRM1  
IPR044868  Rpn13/ADRM1_Pru  
IPR038633  Rpn13/ADRM1_Pru_sf  
IPR032368  RPN13_DEUBAD  
IPR038108  RPN13_DEUBAD_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000502  C:proteasome complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF04683  Proteasom_Rpn13  
PF16550  RPN13_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51916  DEUBAD  
PS51917  PRU  
CDD cd13314  PH_Rpn13  
Amino Acid Sequences MSVTLTDAQTLLAFKAGRSTRRAGTNFVDASPTKGAVILSNSEDGLLRFVWKERTTGNVEEDLILFPGDATFEKVSQAPGGRTYVLKFESSNQRHFFWLQDASTRRDEEFVHNLNNYSKTQTSFPSGTLAMLSLRRPPRRRVHLPRRHLPHRMPLSFITTRPSELTFYSPSYYRSRSAQGSGTTPEQLARLRALVTSMGANSGPNPDDEVSLTDILTPSNLLPLFTSHPTLLPSLFPHLPQELLPQSNGPLTPQQTARLTESLQRTINSPPFRAAVAQLDRALRTGALGGFVRGLGLPESAGTGVGAFLRAIGDQARREGTGGNGQGDMMDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.2
3 0.25
4 0.28
5 0.33
6 0.38
7 0.4
8 0.49
9 0.51
10 0.48
11 0.47
12 0.51
13 0.47
14 0.42
15 0.41
16 0.32
17 0.34
18 0.31
19 0.27
20 0.19
21 0.18
22 0.18
23 0.15
24 0.18
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.13
37 0.2
38 0.2
39 0.22
40 0.22
41 0.27
42 0.31
43 0.33
44 0.34
45 0.29
46 0.29
47 0.27
48 0.27
49 0.22
50 0.17
51 0.13
52 0.1
53 0.07
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.17
65 0.15
66 0.16
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.18
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.22
76 0.32
77 0.35
78 0.42
79 0.4
80 0.4
81 0.41
82 0.42
83 0.37
84 0.3
85 0.29
86 0.22
87 0.26
88 0.28
89 0.3
90 0.32
91 0.32
92 0.28
93 0.26
94 0.27
95 0.26
96 0.3
97 0.28
98 0.27
99 0.27
100 0.28
101 0.28
102 0.29
103 0.25
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.23
110 0.21
111 0.21
112 0.2
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.15
121 0.22
122 0.29
123 0.33
124 0.41
125 0.49
126 0.57
127 0.67
128 0.72
129 0.76
130 0.79
131 0.84
132 0.84
133 0.83
134 0.79
135 0.75
136 0.67
137 0.65
138 0.63
139 0.55
140 0.49
141 0.41
142 0.42
143 0.37
144 0.35
145 0.28
146 0.2
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.17
158 0.19
159 0.21
160 0.19
161 0.2
162 0.22
163 0.23
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.21
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.05
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.12
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.2
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.15
237 0.16
238 0.17
239 0.21
240 0.21
241 0.25
242 0.26
243 0.29
244 0.3
245 0.28
246 0.26
247 0.29
248 0.32
249 0.32
250 0.32
251 0.29
252 0.28
253 0.32
254 0.39
255 0.36
256 0.33
257 0.3
258 0.29
259 0.3
260 0.29
261 0.25
262 0.25
263 0.26
264 0.27
265 0.28
266 0.28
267 0.28
268 0.27
269 0.26
270 0.17
271 0.14
272 0.13
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.09
281 0.1
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.1
300 0.15
301 0.16
302 0.2
303 0.22
304 0.22
305 0.23
306 0.24
307 0.24
308 0.28
309 0.29
310 0.26
311 0.24
312 0.24
313 0.23