Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9TFE0

Protein Details
Accession A0A0C9TFE0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MATVTRPKQPRKGMADPASRRPQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.333, mito 7.5, cyto_mito 6.999, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MATVTRPKQPRKGMADPASRRPQAWSGARASPTFSPANSTSRLPNGPPQANQGSFPPLAGHANGTRSQDATQDRVLQTLAGLTGTTVTLSTKTSQRYEGVILSTSPDGDTTGVTLKDVKEISKHGNPLKDTVFIPSGNIENWQSGPADAKVPNGDNTDISKGKLTRERELQAWQPSVALGSPPTPATHHDGVGDEVTFGPGAGNPSWDQFAANEQMFGVTTSFDEEVYTTKLDRNAADFKEKERKAQRIASEIMGSVINNPHIAEERNLSVDDSGLNEEDKYGAVVRGSGAYIPPGARKHQQQVTSAGPSVTNPPQKSDIPKVSVNGPDGATVAPKETPPISKSTSPAPSTSSMNKPPADPLPAFRDFVTNERQRLTQKKQALVKSEMDKRKAELLKFSQTFKLNKPIPDDLVPILAKDEEKQRQIRERSSQDAASSTARTIGAAGTLNPSPSASRMPQVPISAKLAPDAARKPIHAAVAPAKAPAPTPSTSTAKVPAAKPSEPSKSIGKSGINMYIQAIPPFRGSKPKSPAPHTNGTSSTAAVPTSPTSTANRLNVNASSFRPNPKANAFTPGPTSPIPSATSASASASPQAKPAETSPPTPNPFFGTRVIKKAAVHVKDDFNPFKHNKVVDANNITAIWPYSGKRYMHMFPPLPHQAPQQPAHMAPPGPPPVTHHPYEEGEQRFVYYPYYPGQPMMPGMAPPPPGAYVSSPFMQPMPYPPGMPPNAQPMYAASPMPQMPPPQYMPPPGTYPPPNGAGPRPSMPPTPTPMHAHPYYHQSPQLPHAVPYPMMMPPGGPNGPHPYEAGPAPPQMGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.8
4 0.8
5 0.8
6 0.73
7 0.64
8 0.59
9 0.54
10 0.53
11 0.53
12 0.5
13 0.45
14 0.5
15 0.53
16 0.48
17 0.47
18 0.4
19 0.37
20 0.33
21 0.28
22 0.28
23 0.28
24 0.32
25 0.31
26 0.32
27 0.32
28 0.36
29 0.39
30 0.36
31 0.41
32 0.45
33 0.48
34 0.47
35 0.5
36 0.52
37 0.5
38 0.48
39 0.42
40 0.39
41 0.33
42 0.32
43 0.25
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.21
48 0.18
49 0.22
50 0.26
51 0.29
52 0.28
53 0.27
54 0.27
55 0.3
56 0.3
57 0.3
58 0.3
59 0.34
60 0.33
61 0.33
62 0.32
63 0.26
64 0.22
65 0.19
66 0.15
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.09
77 0.13
78 0.17
79 0.22
80 0.25
81 0.28
82 0.29
83 0.31
84 0.32
85 0.31
86 0.28
87 0.25
88 0.22
89 0.21
90 0.2
91 0.17
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.14
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.19
107 0.23
108 0.3
109 0.34
110 0.41
111 0.41
112 0.46
113 0.46
114 0.48
115 0.45
116 0.41
117 0.35
118 0.33
119 0.31
120 0.24
121 0.23
122 0.21
123 0.2
124 0.17
125 0.19
126 0.16
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.12
132 0.15
133 0.14
134 0.17
135 0.16
136 0.18
137 0.2
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.24
142 0.21
143 0.24
144 0.28
145 0.25
146 0.24
147 0.26
148 0.25
149 0.3
150 0.36
151 0.37
152 0.38
153 0.44
154 0.46
155 0.44
156 0.47
157 0.48
158 0.48
159 0.45
160 0.38
161 0.31
162 0.28
163 0.25
164 0.21
165 0.15
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.14
173 0.2
174 0.21
175 0.21
176 0.2
177 0.21
178 0.21
179 0.21
180 0.18
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.08
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.13
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.1
217 0.12
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.2
222 0.24
223 0.26
224 0.32
225 0.31
226 0.34
227 0.42
228 0.42
229 0.46
230 0.47
231 0.52
232 0.51
233 0.56
234 0.54
235 0.49
236 0.51
237 0.44
238 0.37
239 0.31
240 0.26
241 0.19
242 0.16
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.11
282 0.12
283 0.15
284 0.2
285 0.24
286 0.31
287 0.35
288 0.39
289 0.38
290 0.41
291 0.41
292 0.39
293 0.36
294 0.29
295 0.23
296 0.2
297 0.21
298 0.23
299 0.25
300 0.22
301 0.24
302 0.28
303 0.3
304 0.35
305 0.38
306 0.37
307 0.35
308 0.36
309 0.35
310 0.34
311 0.35
312 0.31
313 0.26
314 0.21
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.12
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.16
328 0.19
329 0.21
330 0.22
331 0.27
332 0.31
333 0.3
334 0.29
335 0.28
336 0.26
337 0.27
338 0.3
339 0.3
340 0.29
341 0.32
342 0.32
343 0.29
344 0.3
345 0.29
346 0.29
347 0.24
348 0.22
349 0.24
350 0.25
351 0.25
352 0.23
353 0.23
354 0.2
355 0.22
356 0.27
357 0.24
358 0.24
359 0.25
360 0.27
361 0.29
362 0.36
363 0.4
364 0.39
365 0.4
366 0.45
367 0.5
368 0.51
369 0.52
370 0.48
371 0.46
372 0.45
373 0.49
374 0.47
375 0.44
376 0.41
377 0.37
378 0.41
379 0.4
380 0.34
381 0.32
382 0.32
383 0.37
384 0.38
385 0.38
386 0.35
387 0.36
388 0.38
389 0.33
390 0.38
391 0.34
392 0.34
393 0.37
394 0.34
395 0.32
396 0.31
397 0.3
398 0.21
399 0.21
400 0.18
401 0.14
402 0.13
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.16
407 0.16
408 0.21
409 0.24
410 0.27
411 0.35
412 0.39
413 0.43
414 0.44
415 0.44
416 0.44
417 0.44
418 0.41
419 0.33
420 0.3
421 0.27
422 0.2
423 0.17
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.13
444 0.15
445 0.17
446 0.19
447 0.19
448 0.18
449 0.21
450 0.21
451 0.19
452 0.17
453 0.17
454 0.17
455 0.19
456 0.19
457 0.2
458 0.2
459 0.2
460 0.22
461 0.23
462 0.22
463 0.19
464 0.19
465 0.19
466 0.21
467 0.21
468 0.18
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.14
474 0.12
475 0.15
476 0.19
477 0.21
478 0.22
479 0.23
480 0.25
481 0.24
482 0.27
483 0.25
484 0.28
485 0.29
486 0.29
487 0.31
488 0.33
489 0.35
490 0.33
491 0.35
492 0.33
493 0.3
494 0.32
495 0.32
496 0.27
497 0.24
498 0.25
499 0.27
500 0.22
501 0.2
502 0.2
503 0.19
504 0.19
505 0.19
506 0.17
507 0.13
508 0.15
509 0.17
510 0.16
511 0.23
512 0.26
513 0.34
514 0.4
515 0.46
516 0.51
517 0.55
518 0.64
519 0.61
520 0.65
521 0.59
522 0.55
523 0.5
524 0.47
525 0.41
526 0.32
527 0.26
528 0.18
529 0.16
530 0.12
531 0.11
532 0.09
533 0.1
534 0.1
535 0.11
536 0.13
537 0.17
538 0.22
539 0.24
540 0.25
541 0.25
542 0.26
543 0.26
544 0.26
545 0.24
546 0.22
547 0.24
548 0.25
549 0.28
550 0.31
551 0.31
552 0.33
553 0.36
554 0.39
555 0.34
556 0.38
557 0.35
558 0.31
559 0.34
560 0.31
561 0.28
562 0.23
563 0.26
564 0.19
565 0.2
566 0.2
567 0.17
568 0.18
569 0.16
570 0.17
571 0.14
572 0.15
573 0.14
574 0.13
575 0.15
576 0.16
577 0.16
578 0.18
579 0.19
580 0.18
581 0.18
582 0.2
583 0.25
584 0.25
585 0.3
586 0.32
587 0.39
588 0.42
589 0.41
590 0.4
591 0.35
592 0.36
593 0.34
594 0.34
595 0.35
596 0.35
597 0.39
598 0.41
599 0.39
600 0.37
601 0.43
602 0.46
603 0.39
604 0.39
605 0.38
606 0.39
607 0.42
608 0.48
609 0.43
610 0.37
611 0.42
612 0.4
613 0.4
614 0.41
615 0.37
616 0.34
617 0.38
618 0.4
619 0.4
620 0.43
621 0.4
622 0.36
623 0.35
624 0.31
625 0.25
626 0.2
627 0.14
628 0.11
629 0.11
630 0.15
631 0.22
632 0.22
633 0.24
634 0.29
635 0.31
636 0.36
637 0.43
638 0.41
639 0.37
640 0.45
641 0.49
642 0.46
643 0.44
644 0.43
645 0.41
646 0.43
647 0.44
648 0.4
649 0.35
650 0.34
651 0.35
652 0.34
653 0.29
654 0.24
655 0.29
656 0.3
657 0.28
658 0.28
659 0.31
660 0.37
661 0.42
662 0.41
663 0.36
664 0.35
665 0.37
666 0.41
667 0.42
668 0.36
669 0.33
670 0.32
671 0.31
672 0.28
673 0.26
674 0.24
675 0.18
676 0.17
677 0.17
678 0.21
679 0.2
680 0.19
681 0.2
682 0.19
683 0.18
684 0.19
685 0.17
686 0.14
687 0.14
688 0.17
689 0.17
690 0.16
691 0.17
692 0.15
693 0.15
694 0.16
695 0.18
696 0.18
697 0.2
698 0.21
699 0.2
700 0.19
701 0.19
702 0.19
703 0.17
704 0.19
705 0.23
706 0.23
707 0.24
708 0.24
709 0.32
710 0.33
711 0.35
712 0.32
713 0.34
714 0.34
715 0.33
716 0.32
717 0.27
718 0.3
719 0.29
720 0.27
721 0.18
722 0.21
723 0.22
724 0.25
725 0.24
726 0.22
727 0.24
728 0.29
729 0.32
730 0.34
731 0.37
732 0.4
733 0.41
734 0.41
735 0.43
736 0.4
737 0.43
738 0.4
739 0.41
740 0.4
741 0.4
742 0.39
743 0.38
744 0.41
745 0.38
746 0.39
747 0.38
748 0.38
749 0.38
750 0.4
751 0.4
752 0.4
753 0.42
754 0.42
755 0.44
756 0.46
757 0.46
758 0.49
759 0.48
760 0.47
761 0.44
762 0.48
763 0.47
764 0.46
765 0.46
766 0.42
767 0.43
768 0.44
769 0.5
770 0.42
771 0.39
772 0.38
773 0.37
774 0.34
775 0.32
776 0.29
777 0.21
778 0.2
779 0.19
780 0.15
781 0.15
782 0.21
783 0.21
784 0.19
785 0.22
786 0.29
787 0.32
788 0.32
789 0.31
790 0.26
791 0.29
792 0.29
793 0.3
794 0.24
795 0.23
796 0.24