Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9TZ50

Protein Details
Accession A0A0C9TZ50    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-369DTYSSPARPIKRPKARAPSTDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-360KRPK
387-402PMRGTRQPIKRGGKRF
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.833, cyto 8, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MNHFNEEHSKLLLSKEWLAKINGQTSTPYLIKFYSSSVDLTSCIMITDTKSTWAEVLSSNQLARRWRECNRRAGSPLLDDDEEEAWRTRHLELLSRAHTLGGVAELSFEVVESKFGDFAFELECAAFKWRWETASVGHKLSADILSQHLIMPLISVSHLAFSSSDVVGDLPPSDLEKAIDKVARTARRTFDTHVKNALSKPRLATTIRRMTAIFNFISDPPIITTTSDDPVLQAPQEPTPKIIKAPERLKSTRTSTPEPNNNRDAPGRSKSGSVALSRGPSPVVQAADSGSATESDDGGPSTHPLKAVAARSSADQQVDTHMLSPTPSRNALPAPRSLSVTKAPPLDTYSSPARPIKRPKARAPSTDDDSEQERKKLAAQIKSGTAPMRGTRQPIKRGGKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.36
4 0.38
5 0.4
6 0.43
7 0.44
8 0.47
9 0.42
10 0.37
11 0.35
12 0.33
13 0.36
14 0.32
15 0.27
16 0.22
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.21
21 0.18
22 0.18
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.15
35 0.14
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.18
42 0.15
43 0.19
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.23
48 0.26
49 0.3
50 0.34
51 0.36
52 0.39
53 0.46
54 0.56
55 0.6
56 0.67
57 0.67
58 0.68
59 0.65
60 0.63
61 0.57
62 0.5
63 0.47
64 0.4
65 0.35
66 0.28
67 0.27
68 0.22
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.12
76 0.16
77 0.16
78 0.22
79 0.27
80 0.34
81 0.36
82 0.36
83 0.35
84 0.31
85 0.3
86 0.22
87 0.17
88 0.1
89 0.07
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.18
121 0.27
122 0.29
123 0.27
124 0.26
125 0.26
126 0.24
127 0.24
128 0.2
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.16
169 0.22
170 0.27
171 0.28
172 0.31
173 0.32
174 0.34
175 0.37
176 0.36
177 0.38
178 0.38
179 0.37
180 0.38
181 0.36
182 0.33
183 0.34
184 0.38
185 0.31
186 0.27
187 0.26
188 0.23
189 0.25
190 0.25
191 0.28
192 0.29
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.33
197 0.32
198 0.32
199 0.3
200 0.21
201 0.13
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.12
206 0.1
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.13
223 0.16
224 0.16
225 0.18
226 0.2
227 0.21
228 0.2
229 0.25
230 0.26
231 0.32
232 0.38
233 0.43
234 0.48
235 0.49
236 0.5
237 0.5
238 0.5
239 0.48
240 0.47
241 0.45
242 0.45
243 0.52
244 0.59
245 0.6
246 0.6
247 0.59
248 0.54
249 0.52
250 0.47
251 0.43
252 0.39
253 0.37
254 0.35
255 0.31
256 0.31
257 0.29
258 0.3
259 0.28
260 0.23
261 0.21
262 0.19
263 0.21
264 0.2
265 0.2
266 0.16
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.18
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.23
299 0.26
300 0.26
301 0.22
302 0.19
303 0.17
304 0.19
305 0.2
306 0.19
307 0.16
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.17
312 0.17
313 0.19
314 0.2
315 0.19
316 0.21
317 0.27
318 0.33
319 0.33
320 0.36
321 0.37
322 0.37
323 0.4
324 0.38
325 0.36
326 0.34
327 0.35
328 0.34
329 0.32
330 0.31
331 0.29
332 0.32
333 0.33
334 0.29
335 0.3
336 0.32
337 0.31
338 0.36
339 0.39
340 0.41
341 0.46
342 0.55
343 0.61
344 0.66
345 0.72
346 0.77
347 0.83
348 0.85
349 0.84
350 0.82
351 0.79
352 0.74
353 0.7
354 0.61
355 0.53
356 0.5
357 0.51
358 0.46
359 0.4
360 0.35
361 0.32
362 0.35
363 0.4
364 0.42
365 0.41
366 0.43
367 0.46
368 0.5
369 0.51
370 0.49
371 0.43
372 0.38
373 0.34
374 0.32
375 0.35
376 0.34
377 0.39
378 0.45
379 0.52
380 0.58
381 0.64
382 0.71