Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9SSK9

Protein Details
Accession A0A0C9SSK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-203PVPTLRPKTKLKPRTKSKPTVADGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-197PKTKLKPRTKSK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027329  TPX2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005856  C:cytoskeleton  
Pfam View protein in Pfam  
PF06886  TPX2  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MSQEMITDITLDHLPDLSDASLSFQIPADNSSADLLLADVTDGFNLLRRGTDDDATFATLMPTPYRGPPLTLCEITPKPESASRPPPRSRTPRPSSSESSEIPHPLTLGYPSVDKWSTPPRARSKPTDIALGSPLVSEERQEQLAPADVEILGRHPETTTHVDIDMAVHINEAAVSVHGPVPTLRPKTKLKPRTKSKPTVADGGISKIPAPTNAHVSRKAKNLPSSKDVALAVPHCTASQNPWPQSGDIDAEEQLVPPASMNDDIRMPADNHSITPTTSRMAERLVSYSQKLISSIGVEGKNSRSVRARDQSGPSSAVDLPLFEKPNATLPAAQVTKPVAFTFRVDARLEARKIERLAASEQGMHRALHESHESTLACRKENIVPSGPIETFFFYTEQRAKERERFDEMVKRKEEEMQRVREEQRRLAAEEEERAIKELRRKAIPKANEVPECSGDTITQSFILGLMKGKGNNNAFKRTMTVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.12
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.12
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.06
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.18
37 0.21
38 0.24
39 0.21
40 0.23
41 0.24
42 0.24
43 0.22
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.15
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.17
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.26
56 0.31
57 0.35
58 0.34
59 0.32
60 0.34
61 0.35
62 0.36
63 0.35
64 0.3
65 0.27
66 0.31
67 0.35
68 0.36
69 0.46
70 0.51
71 0.58
72 0.63
73 0.67
74 0.72
75 0.77
76 0.79
77 0.79
78 0.78
79 0.79
80 0.79
81 0.79
82 0.76
83 0.72
84 0.67
85 0.57
86 0.53
87 0.46
88 0.41
89 0.35
90 0.28
91 0.22
92 0.17
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.18
103 0.25
104 0.33
105 0.38
106 0.46
107 0.52
108 0.61
109 0.66
110 0.7
111 0.7
112 0.69
113 0.65
114 0.62
115 0.53
116 0.46
117 0.42
118 0.35
119 0.26
120 0.17
121 0.16
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.16
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.13
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.14
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.11
169 0.18
170 0.23
171 0.24
172 0.28
173 0.34
174 0.43
175 0.54
176 0.6
177 0.64
178 0.69
179 0.78
180 0.84
181 0.87
182 0.86
183 0.83
184 0.82
185 0.74
186 0.7
187 0.6
188 0.52
189 0.44
190 0.37
191 0.3
192 0.2
193 0.18
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.14
198 0.12
199 0.2
200 0.24
201 0.27
202 0.32
203 0.35
204 0.36
205 0.39
206 0.43
207 0.39
208 0.43
209 0.47
210 0.45
211 0.46
212 0.46
213 0.41
214 0.38
215 0.33
216 0.26
217 0.21
218 0.17
219 0.15
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.11
226 0.18
227 0.22
228 0.23
229 0.24
230 0.25
231 0.25
232 0.25
233 0.23
234 0.16
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.13
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.22
289 0.21
290 0.22
291 0.24
292 0.26
293 0.35
294 0.39
295 0.43
296 0.41
297 0.45
298 0.46
299 0.42
300 0.41
301 0.32
302 0.29
303 0.24
304 0.21
305 0.16
306 0.13
307 0.13
308 0.15
309 0.17
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.19
314 0.21
315 0.2
316 0.18
317 0.16
318 0.24
319 0.24
320 0.24
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.13
327 0.13
328 0.15
329 0.18
330 0.19
331 0.22
332 0.21
333 0.22
334 0.25
335 0.31
336 0.3
337 0.3
338 0.29
339 0.3
340 0.3
341 0.32
342 0.3
343 0.25
344 0.26
345 0.26
346 0.24
347 0.24
348 0.23
349 0.24
350 0.24
351 0.21
352 0.19
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.22
357 0.19
358 0.19
359 0.23
360 0.22
361 0.2
362 0.27
363 0.25
364 0.23
365 0.22
366 0.24
367 0.27
368 0.33
369 0.36
370 0.34
371 0.33
372 0.34
373 0.38
374 0.35
375 0.29
376 0.24
377 0.21
378 0.18
379 0.18
380 0.17
381 0.14
382 0.19
383 0.24
384 0.26
385 0.27
386 0.31
387 0.36
388 0.42
389 0.48
390 0.47
391 0.5
392 0.5
393 0.52
394 0.57
395 0.58
396 0.58
397 0.55
398 0.52
399 0.46
400 0.51
401 0.52
402 0.53
403 0.55
404 0.54
405 0.56
406 0.61
407 0.66
408 0.65
409 0.63
410 0.57
411 0.56
412 0.52
413 0.49
414 0.45
415 0.44
416 0.4
417 0.38
418 0.36
419 0.31
420 0.28
421 0.28
422 0.28
423 0.27
424 0.32
425 0.36
426 0.4
427 0.46
428 0.49
429 0.56
430 0.63
431 0.66
432 0.66
433 0.68
434 0.7
435 0.66
436 0.67
437 0.62
438 0.55
439 0.52
440 0.44
441 0.35
442 0.27
443 0.25
444 0.22
445 0.18
446 0.16
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.13
451 0.1
452 0.12
453 0.14
454 0.17
455 0.21
456 0.24
457 0.32
458 0.37
459 0.45
460 0.49
461 0.53
462 0.51
463 0.49