Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9SV96

Protein Details
Accession A0A0C9SV96    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-331SFGRLGKDKAPQKKKSKNGRCQSHAFLYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-45SKRAAKAQERRAKSE
310-320KDKAPQKKKSK
Subcellular Location(s) mito 15, cyto_mito 11.166, mito_nucl 11.166, cyto_nucl 6.666, nucl 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MRQSKQGSTSKPSSNGKSAVTVADMLQARASKRAAKAQERRAKSEKLKEEGNALYRVEDYTNAIECYQKAIDVHVHGSAATPVLLTNLAAAYIKLEMYGAAHFTATEALIGDPKSVKARFRRGVARQNMDMLDAAVTDFRTVLSLDPENQETKARLGFVEELSLVNEGIDTGYSDDEFPSPSEDPELEDSMSDSSDCEHGGNDIPCKFYNHDGCAKGPACRFSHAPDNKSERDALGKNVCSYFLMGLCKFGDNRCSYSHSREYLPEKGWWTTAEGLTSARKLYKHARVLPKEVVKVAEDYVAASFGRLGKDKAPQKKKSKNGRCQSHAFLYGGSDSEEEELNEYGFTNSDTQELLSQGVKPWDDDAYDVLAALRDGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.61
3 0.54
4 0.5
5 0.45
6 0.38
7 0.32
8 0.27
9 0.2
10 0.23
11 0.22
12 0.18
13 0.19
14 0.21
15 0.2
16 0.24
17 0.26
18 0.25
19 0.28
20 0.37
21 0.43
22 0.51
23 0.6
24 0.66
25 0.74
26 0.73
27 0.77
28 0.75
29 0.75
30 0.74
31 0.75
32 0.72
33 0.67
34 0.66
35 0.59
36 0.59
37 0.54
38 0.5
39 0.43
40 0.34
41 0.3
42 0.26
43 0.26
44 0.21
45 0.17
46 0.15
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.2
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.15
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.17
62 0.17
63 0.15
64 0.16
65 0.14
66 0.1
67 0.08
68 0.06
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.15
102 0.17
103 0.22
104 0.28
105 0.38
106 0.41
107 0.47
108 0.55
109 0.57
110 0.65
111 0.68
112 0.65
113 0.57
114 0.55
115 0.49
116 0.41
117 0.33
118 0.23
119 0.15
120 0.09
121 0.08
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.11
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.08
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.17
194 0.18
195 0.2
196 0.24
197 0.24
198 0.29
199 0.29
200 0.29
201 0.33
202 0.32
203 0.31
204 0.28
205 0.29
206 0.25
207 0.26
208 0.26
209 0.23
210 0.33
211 0.34
212 0.34
213 0.37
214 0.42
215 0.41
216 0.41
217 0.39
218 0.29
219 0.3
220 0.29
221 0.27
222 0.26
223 0.26
224 0.26
225 0.25
226 0.25
227 0.2
228 0.19
229 0.15
230 0.12
231 0.14
232 0.13
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.2
239 0.19
240 0.21
241 0.22
242 0.27
243 0.29
244 0.35
245 0.41
246 0.37
247 0.36
248 0.39
249 0.42
250 0.42
251 0.41
252 0.38
253 0.35
254 0.33
255 0.32
256 0.27
257 0.25
258 0.22
259 0.21
260 0.17
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.18
269 0.26
270 0.34
271 0.41
272 0.49
273 0.58
274 0.6
275 0.66
276 0.7
277 0.67
278 0.6
279 0.53
280 0.46
281 0.37
282 0.33
283 0.28
284 0.21
285 0.15
286 0.14
287 0.12
288 0.12
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.15
296 0.17
297 0.27
298 0.35
299 0.44
300 0.52
301 0.6
302 0.69
303 0.77
304 0.84
305 0.87
306 0.9
307 0.9
308 0.9
309 0.91
310 0.87
311 0.84
312 0.8
313 0.75
314 0.68
315 0.58
316 0.48
317 0.39
318 0.33
319 0.27
320 0.21
321 0.14
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.14
343 0.15
344 0.17
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.21
349 0.21
350 0.2
351 0.2
352 0.19
353 0.17
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.13