Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IHV3

Protein Details
Accession A0A0D2IHV3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-173FCEKGPRCSKRHVRRKLCEFYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-243RKDFGWKGRGGKGGRWRNKRDRR
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 8, cyto 8, cyto_nucl 8, cyto_mito 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MASVATNSTADAVDTKKKQPPPPPTYNFSFAPFLRANGLAALVSTVPVCPDFASSGHCPRGRRCPDRHPTPAQQSQHHYGRNNDNYVCKHWLKGLCKKGDACDYLHEYNLRKMSECQFFNQNGYCQNGDECLYVHVKEDSKLPMCEDYNKGFCEKGPRCSKRHVRRKLCEFYLAGFCPDGKECKHGVHLKSVTAAPAGEKDGDAQRRERTTELEKKEEETRKDFGWKGRGGKGGRWRNKRDRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.37
4 0.45
5 0.53
6 0.6
7 0.68
8 0.69
9 0.75
10 0.76
11 0.75
12 0.73
13 0.7
14 0.62
15 0.55
16 0.51
17 0.4
18 0.4
19 0.34
20 0.29
21 0.27
22 0.25
23 0.22
24 0.17
25 0.18
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.14
41 0.18
42 0.23
43 0.3
44 0.33
45 0.34
46 0.37
47 0.47
48 0.51
49 0.56
50 0.57
51 0.61
52 0.68
53 0.75
54 0.79
55 0.75
56 0.74
57 0.75
58 0.76
59 0.69
60 0.64
61 0.61
62 0.61
63 0.59
64 0.55
65 0.49
66 0.47
67 0.52
68 0.52
69 0.49
70 0.44
71 0.43
72 0.41
73 0.42
74 0.43
75 0.33
76 0.29
77 0.31
78 0.35
79 0.37
80 0.43
81 0.47
82 0.45
83 0.47
84 0.47
85 0.45
86 0.44
87 0.39
88 0.31
89 0.27
90 0.29
91 0.27
92 0.27
93 0.26
94 0.22
95 0.24
96 0.26
97 0.23
98 0.18
99 0.2
100 0.25
101 0.29
102 0.29
103 0.27
104 0.28
105 0.29
106 0.3
107 0.28
108 0.24
109 0.19
110 0.21
111 0.19
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.17
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.23
133 0.24
134 0.24
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.21
140 0.28
141 0.27
142 0.33
143 0.41
144 0.46
145 0.48
146 0.58
147 0.68
148 0.69
149 0.77
150 0.78
151 0.78
152 0.82
153 0.89
154 0.87
155 0.79
156 0.73
157 0.63
158 0.55
159 0.51
160 0.42
161 0.33
162 0.24
163 0.22
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.14
168 0.17
169 0.18
170 0.2
171 0.28
172 0.33
173 0.34
174 0.4
175 0.41
176 0.37
177 0.39
178 0.37
179 0.3
180 0.23
181 0.22
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.19
189 0.25
190 0.26
191 0.28
192 0.33
193 0.36
194 0.39
195 0.38
196 0.37
197 0.41
198 0.48
199 0.51
200 0.52
201 0.5
202 0.5
203 0.58
204 0.6
205 0.56
206 0.52
207 0.49
208 0.45
209 0.5
210 0.51
211 0.49
212 0.5
213 0.5
214 0.51
215 0.54
216 0.59
217 0.55
218 0.58
219 0.62
220 0.64
221 0.68
222 0.72
223 0.76